MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_004551	AAC	2	6	599029	599034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572709
11003	NC_004551	AC	3	6	599085	599090	50 %	0 %	0 %	50 %	28572709
11004	NC_004551	ACA	3	9	599096	599104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572709
11005	NC_004551	GA	3	6	599144	599149	50 %	0 %	50 %	0 %	28572709
11006	NC_004551	AGT	2	6	599158	599163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572709
11007	NC_004551	AAC	2	6	599296	599301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_004551	GTT	2	6	599420	599425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_004551	AGT	2	6	599437	599442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004551	CAT	2	6	599533	599538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572710
11011	NC_004551	AATA	2	8	599568	599575	75 %	25 %	0 %	0 %	28572710
11012	NC_004551	CCCTG	2	10	599604	599613	0 %	20 %	20 %	60 %	28572710
11013	NC_004551	CGC	2	6	599651	599656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572710
11014	NC_004551	TAA	3	9	599695	599703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572710
11015	NC_004551	TAA	2	6	599731	599736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572710
11016	NC_004551	AGA	2	6	599774	599779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572710
11017	NC_004551	CTT	2	6	599827	599832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572710
11018	NC_004551	ACGAA	2	10	599942	599951	60 %	0 %	20 %	20 %	28572710
11019	NC_004551	TA	3	6	599955	599960	50 %	50 %	0 %	0 %	28572710
11020	NC_004551	AAC	2	6	600046	600051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572710
11021	NC_004551	T	6	6	600084	600089	0 %	100 %	0 %	0 %	28572710
11022	NC_004551	GAA	2	6	600117	600122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572710
11023	NC_004551	AGA	2	6	600171	600176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572710
11024	NC_004551	GAA	3	9	600240	600248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572710
11025	NC_004551	CAA	2	6	600282	600287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572710
11026	NC_004551	GAT	2	6	600345	600350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572710
11027	NC_004551	AAC	2	6	600374	600379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572710
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11029	NC_004551	CT	3	6	600458	600463	0 %	50 %	0 %	50 %	28572710
11030	NC_004551	TGG	2	6	600487	600492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572710
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11033	NC_004551	ATCA	2	8	600599	600606	50 %	25 %	0 %	25 %	28572710
11034	NC_004551	AC	4	8	600612	600619	50 %	0 %	0 %	50 %	28572710
11035	NC_004551	GCG	2	6	600691	600696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572711
11036	NC_004551	GA	3	6	600697	600702	50 %	0 %	50 %	0 %	28572711
11037	NC_004551	CAG	2	6	600827	600832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572711
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11040	NC_004551	AAAG	2	8	600996	601003	75 %	0 %	25 %	0 %	28572711
11041	NC_004551	CAA	2	6	601024	601029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572711
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11044	NC_004551	ATTG	2	8	601085	601092	25 %	50 %	25 %	0 %	28572711
11045	NC_004551	CTT	2	6	601100	601105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572711
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11054	NC_004551	TCT	2	6	601719	601724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572711
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11058	NC_004551	AAC	2	6	601891	601896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572711
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11063	NC_004551	GCA	2	6	602282	602287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572712
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11071	NC_004551	CCT	2	6	602743	602748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572712
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11075	NC_004551	CCAA	2	8	603053	603060	50 %	0 %	0 %	50 %	28572712
11076	NC_004551	A	6	6	603097	603102	100 %	0 %	0 %	0 %	28572712
11077	NC_004551	T	7	7	603172	603178	0 %	100 %	0 %	0 %	28572712
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11079	NC_004551	AAG	2	6	603243	603248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11081	NC_004551	GC	3	6	603319	603324	0 %	0 %	50 %	50 %	28572713
11082	NC_004551	GCA	2	6	603358	603363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572713
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11089	NC_004551	AAAT	2	8	603708	603715	75 %	25 %	0 %	0 %	28572713
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11091	NC_004551	GA	3	6	603991	603996	50 %	0 %	50 %	0 %	28572713
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11094	NC_004551	GC	3	6	604385	604390	0 %	0 %	50 %	50 %	28572714
11095	NC_004551	A	6	6	604534	604539	100 %	0 %	0 %	0 %	28572714
11096	NC_004551	GCAA	2	8	604554	604561	50 %	0 %	25 %	25 %	28572714
11097	NC_004551	GT	3	6	604567	604572	0 %	50 %	50 %	0 %	28572714
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11102	NC_004551	GGTC	2	8	604859	604866	0 %	25 %	50 %	25 %	28572715
11103	NC_004551	GA	3	6	604917	604922	50 %	0 %	50 %	0 %	28572715
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11107	NC_004551	GCT	2	6	605247	605252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572715
11108	NC_004551	T	6	6	605252	605257	0 %	100 %	0 %	0 %	28572715
11109	NC_004551	CCA	2	6	605304	605309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572715
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11112	NC_004551	CG	4	8	605612	605619	0 %	0 %	50 %	50 %	28572715
11113	NC_004551	GGT	2	6	605625	605630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572715
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11115	NC_004551	TGC	2	6	605726	605731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572715
11116	NC_004551	A	7	7	605745	605751	100 %	0 %	0 %	0 %	28572715
11117	NC_004551	TGG	2	6	605823	605828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572715
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11122	NC_004551	ACCTG	2	10	606043	606052	20 %	20 %	20 %	40 %	28572715
11123	NC_004551	TTG	2	6	606110	606115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572715
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11125	NC_004551	GCA	2	6	606178	606183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572715
11126	NC_004551	AAG	2	6	606409	606414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572716
11127	NC_004551	TGGG	2	8	606463	606470	0 %	25 %	75 %	0 %	28572716
11128	NC_004551	GC	3	6	606489	606494	0 %	0 %	50 %	50 %	28572716
11129	NC_004551	TCA	2	6	606504	606509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572716
11130	NC_004551	CAA	2	6	606656	606661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572716
11131	NC_004551	TC	3	6	606715	606720	0 %	50 %	0 %	50 %	28572716
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11133	NC_004551	T	6	6	606774	606779	0 %	100 %	0 %	0 %	28572716
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11135	NC_004551	CTC	2	6	606998	607003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572716
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11138	NC_004551	AAC	2	6	607259	607264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572716
11139	NC_004551	CAA	2	6	607333	607338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572716
11140	NC_004551	ACG	3	9	607370	607378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572716
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11146	NC_004551	GGGA	2	8	607686	607693	25 %	0 %	75 %	0 %	28572716
11147	NC_004551	CAGC	2	8	607701	607708	25 %	0 %	25 %	50 %	28572716
11148	NC_004551	AAG	2	6	607709	607714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572716
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11151	NC_004551	GTTAT	2	10	607926	607935	20 %	60 %	20 %	0 %	28572716
11152	NC_004551	GC	3	6	607995	608000	0 %	0 %	50 %	50 %	28572716
11153	NC_004551	TGT	2	6	608015	608020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572716
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11155	NC_004551	GA	3	6	608199	608204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11156	NC_004551	TGT	2	6	608336	608341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11157	NC_004551	CA	3	6	608391	608396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11158	NC_004551	CGA	2	6	608456	608461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11160	NC_004551	TA	3	6	608717	608722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11161	NC_004551	CAC	2	6	608968	608973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11162	NC_004551	GGT	2	6	608993	608998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11163	NC_004551	CCA	2	6	609018	609023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11164	NC_004551	AT	3	6	609033	609038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11165	NC_004551	GTG	2	6	609153	609158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11170	NC_004551	TGT	3	9	609467	609475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11174	NC_004551	GTT	2	6	609607	609612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11178	NC_004551	TA	3	6	609778	609783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11182	NC_004551	TGCA	2	8	609880	609887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11183	NC_004551	TG	3	6	609956	609961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11184	NC_004551	TA	3	6	609966	609971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11185	NC_004551	TA	3	6	609978	609983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11189	NC_004551	ACA	2	6	610170	610175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11190	NC_004551	AC	3	6	610181	610186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11191	NC_004551	AT	3	6	610259	610264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11195	NC_004551	GTA	2	6	610448	610453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11198	NC_004551	TCTTAC	2	12	610509	610520	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11202	NC_004551	TGTGG	2	10	610958	610967	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11203	NC_004551	ACTT	2	8	611074	611081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11207	NC_004551	CATA	2	8	611367	611374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11211	NC_004551	TG	3	6	611604	611609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11222	NC_004551	CAT	2	6	612393	612398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11227	NC_004551	CAC	2	6	612835	612840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11231	NC_004551	TGT	3	9	613107	613115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_004551	AGGTA	2	10	613157	613166	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11233	NC_004551	TTC	2	6	613167	613172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11237	NC_004551	TATG	2	8	613265	613272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_004551	GGT	2	6	613341	613346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11239	NC_004551	CCTG	2	8	613372	613379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11240	NC_004551	GT	5	10	613440	613449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11241	NC_004551	ACA	2	6	613472	613477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11242	NC_004551	AGG	2	6	613564	613569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11243	NC_004551	GTT	2	6	613686	613691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_004551	CT	3	6	613777	613782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11245	NC_004551	GTAAAA	2	12	613997	614008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11246	NC_004551	CAA	2	6	614044	614049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11247	NC_004551	CTG	2	6	614089	614094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11248	NC_004551	CCA	2	6	614189	614194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11249	NC_004551	GT	3	6	614258	614263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11250	NC_004551	AAG	2	6	614281	614286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11251	NC_004551	TA	3	6	614288	614293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11252	NC_004551	TAC	2	6	614320	614325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11253	NC_004551	GTA	2	6	614370	614375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_004551	TAC	2	6	614413	614418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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