MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_004551	TAT	2	6	549186	549191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572659
10003	NC_004551	TGA	2	6	549225	549230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572659
10004	NC_004551	GGT	2	6	549295	549300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572659
10005	NC_004551	G	6	6	549394	549399	0 %	0 %	100 %	0 %	28572659
10006	NC_004551	ATTTA	2	10	549428	549437	40 %	60 %	0 %	0 %	28572659
10007	NC_004551	GCAG	2	8	549459	549466	25 %	0 %	50 %	25 %	28572659
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10010	NC_004551	GAAAA	2	10	549613	549622	80 %	0 %	20 %	0 %	28572659
10011	NC_004551	ATA	2	6	549653	549658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572659
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10014	NC_004551	ACA	2	6	549963	549968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572660
10015	NC_004551	T	6	6	550149	550154	0 %	100 %	0 %	0 %	28572660
10016	NC_004551	ATC	2	6	550188	550193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572660
10017	NC_004551	AGA	2	6	550235	550240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572660
10018	NC_004551	ATG	2	6	550405	550410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572660
10019	NC_004551	TAT	2	6	550419	550424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572660
10020	NC_004551	CA	3	6	550557	550562	50 %	0 %	0 %	50 %	28572660
10021	NC_004551	TTG	2	6	550564	550569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572660
10022	NC_004551	TA	3	6	550620	550625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_004551	AACT	2	8	550632	550639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_004551	AT	3	6	550646	550651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_004551	GGC	2	6	550778	550783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_004551	CATC	2	8	550784	550791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_004551	TGT	2	6	550798	550803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_004551	AGC	2	6	550842	550847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_004551	CAG	2	6	550888	550893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_004551	TGG	2	6	550913	550918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_004551	ACC	2	6	550927	550932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_004551	CGG	2	6	550951	550956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_004551	CCGC	2	8	551060	551067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10034	NC_004551	CTT	2	6	551128	551133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572661
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10038	NC_004551	TGC	2	6	551396	551401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572661
10039	NC_004551	CTG	2	6	551433	551438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572661
10040	NC_004551	CCT	2	6	551487	551492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572661
10041	NC_004551	T	6	6	551518	551523	0 %	100 %	0 %	0 %	28572661
10042	NC_004551	AAG	2	6	551530	551535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572661
10043	NC_004551	TTGCA	2	10	551560	551569	20 %	40 %	20 %	20 %	28572661
10044	NC_004551	GCAA	2	8	551633	551640	50 %	0 %	25 %	25 %	28572661
10045	NC_004551	CAT	2	6	551706	551711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572661
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10059	NC_004551	TGG	2	6	552423	552428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572662
10060	NC_004551	AGA	2	6	552566	552571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572662
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10062	NC_004551	AC	3	6	552736	552741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_004551	AGG	2	6	552764	552769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_004551	GCCC	2	8	552776	552783	0 %	0 %	25 %	75 %	28572663
10065	NC_004551	A	7	7	552839	552845	100 %	0 %	0 %	0 %	28572663
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10072	NC_004551	CAA	2	6	553187	553192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572663
10073	NC_004551	TCCC	2	8	553244	553251	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10074	NC_004551	CAA	2	6	553300	553305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_004551	AAG	2	6	553348	553353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572664
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10081	NC_004551	TGC	2	6	553738	553743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572664
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10092	NC_004551	CGG	2	6	554449	554454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572664
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10095	NC_004551	GGT	2	6	554549	554554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572664
10096	NC_004551	GCG	2	6	554576	554581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572664
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10099	NC_004551	ATCAA	2	10	554688	554697	60 %	20 %	0 %	20 %	28572664
10100	NC_004551	TGA	2	6	554710	554715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572664
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10103	NC_004551	GGA	2	6	554855	554860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572664
10104	NC_004551	GTGG	2	8	554877	554884	0 %	25 %	75 %	0 %	28572664
10105	NC_004551	AAT	2	6	554974	554979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572664
10106	NC_004551	GTT	2	6	555127	555132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572664
10107	NC_004551	GAA	2	6	555143	555148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572664
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10109	NC_004551	TCT	2	6	555264	555269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572664
10110	NC_004551	GCT	3	9	555311	555319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572664
10111	NC_004551	AAC	2	6	555364	555369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572664
10112	NC_004551	AAT	2	6	555524	555529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572664
10113	NC_004551	CA	3	6	555531	555536	50 %	0 %	0 %	50 %	28572664
10114	NC_004551	T	6	6	555561	555566	0 %	100 %	0 %	0 %	28572664
10115	NC_004551	CCA	2	6	555599	555604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572664
10116	NC_004551	GAT	2	6	555611	555616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572664
10117	NC_004551	ATACAA	2	12	555646	555657	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	28572664
10118	NC_004551	AGA	2	6	555838	555843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572664
10119	NC_004551	TGGCTT	2	12	555982	555993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28572664
10120	NC_004551	TCGG	2	8	556003	556010	0 %	25 %	50 %	25 %	28572664
10121	NC_004551	T	7	7	556021	556027	0 %	100 %	0 %	0 %	28572664
10122	NC_004551	A	6	6	556075	556080	100 %	0 %	0 %	0 %	28572664
10123	NC_004551	TTG	2	6	556086	556091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572664
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10242	NC_004551	AATA	2	8	561485	561492	75 %	25 %	0 %	0 %	28572670
10243	NC_004551	A	6	6	561545	561550	100 %	0 %	0 %	0 %	28572670
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10310	NC_004551	A	7	7	564910	564916	100 %	0 %	0 %	0 %	28572674
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10357	NC_004551	CAGG	2	8	567363	567370	25 %	0 %	50 %	25 %	28572676
10358	NC_004551	TGT	2	6	567388	567393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572676
10359	NC_004551	CAA	2	6	567399	567404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572676
10360	NC_004551	GA	3	6	567439	567444	50 %	0 %	50 %	0 %	28572676
10361	NC_004551	CAGG	2	8	567462	567469	25 %	0 %	50 %	25 %	28572676
10362	NC_004551	TCAC	2	8	567508	567515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10363	NC_004551	CAC	2	6	567573	567578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572677
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10365	NC_004551	TGCT	2	8	567623	567630	0 %	50 %	25 %	25 %	28572677
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10368	NC_004551	TC	3	6	567739	567744	0 %	50 %	0 %	50 %	28572677
10369	NC_004551	C	6	6	567778	567783	0 %	0 %	0 %	100 %	28572677
10370	NC_004551	GTC	2	6	567811	567816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572677
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10498	NC_004551	A	6	6	573951	573956	100 %	0 %	0 %	0 %	28572686
10499	NC_004551	CAAA	2	8	573977	573984	75 %	0 %	0 %	25 %	28572686
10500	NC_004551	AGC	2	6	573988	573993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572686

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