MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004551	GACG	2	8	27474	27481	25 %	0 %	50 %	25 %	28572203
502	NC_004551	CATC	2	8	27595	27602	25 %	25 %	0 %	50 %	28572203
503	NC_004551	ACAA	2	8	27629	27636	75 %	0 %	0 %	25 %	28572203
504	NC_004551	CGGG	2	8	27688	27695	0 %	0 %	75 %	25 %	28572203
505	NC_004551	CAC	2	6	27713	27718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572203
506	NC_004551	TGT	2	6	27830	27835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572203
507	NC_004551	GAAC	2	8	27887	27894	50 %	0 %	25 %	25 %	28572203
508	NC_004551	AAC	2	6	27958	27963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572203
509	NC_004551	AT	3	6	28033	28038	50 %	50 %	0 %	0 %	28572203
510	NC_004551	TCAAT	2	10	28039	28048	40 %	40 %	0 %	20 %	28572203
511	NC_004551	AG	3	6	28065	28070	50 %	0 %	50 %	0 %	28572203
512	NC_004551	AT	3	6	28102	28107	50 %	50 %	0 %	0 %	28572203
513	NC_004551	TGT	2	6	28145	28150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572203
514	NC_004551	ACA	2	6	28169	28174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572203
515	NC_004551	GAA	2	6	28191	28196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572203
516	NC_004551	GA	3	6	28211	28216	50 %	0 %	50 %	0 %	28572203
517	NC_004551	TGG	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004551	GCA	2	6	28421	28426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572204
519	NC_004551	AT	3	6	28432	28437	50 %	50 %	0 %	0 %	28572204
520	NC_004551	TGT	2	6	28451	28456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572204
521	NC_004551	GAT	2	6	28481	28486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572204
522	NC_004551	GCT	2	6	28533	28538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572204
523	NC_004551	ATCA	2	8	28810	28817	50 %	25 %	0 %	25 %	28572204
524	NC_004551	GCACG	2	10	29025	29034	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
525	NC_004551	AGGA	2	8	29172	29179	50 %	0 %	50 %	0 %	28572205
526	NC_004551	GA	3	6	29208	29213	50 %	0 %	50 %	0 %	28572205
527	NC_004551	A	6	6	29216	29221	100 %	0 %	0 %	0 %	28572205
528	NC_004551	AAG	2	6	29241	29246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572205
529	NC_004551	CAG	2	6	29257	29262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572205
530	NC_004551	CCGA	2	8	29328	29335	25 %	0 %	25 %	50 %	28572205
531	NC_004551	CCGC	2	8	29349	29356	0 %	0 %	25 %	75 %	28572205
532	NC_004551	AGA	2	6	29405	29410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572205
533	NC_004551	CAA	2	6	29416	29421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572205
534	NC_004551	CTC	2	6	29483	29488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_004551	GCC	2	6	29544	29549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_004551	CAGTA	2	10	29651	29660	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
537	NC_004551	ACACA	2	10	29661	29670	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
538	NC_004551	AGA	2	6	29744	29749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004551	TGTA	2	8	29778	29785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004551	TAC	2	6	29787	29792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_004551	ACT	2	6	29799	29804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572206
542	NC_004551	AC	3	6	29830	29835	50 %	0 %	0 %	50 %	28572206
543	NC_004551	CAT	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572206
544	NC_004551	CAT	2	6	29905	29910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572206
545	NC_004551	AAT	2	6	29972	29977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572206
546	NC_004551	GTT	2	6	30033	30038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572206
547	NC_004551	TGTT	2	8	30046	30053	0 %	75 %	25 %	0 %	28572206
548	NC_004551	AAG	2	6	30089	30094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572206
549	NC_004551	GTTG	2	8	30126	30133	0 %	50 %	50 %	0 %	28572206
550	NC_004551	AAC	2	6	30149	30154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572206
551	NC_004551	GAT	2	6	30239	30244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572206
552	NC_004551	TCC	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572206
553	NC_004551	CAG	2	6	30286	30291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572206
554	NC_004551	TCT	2	6	30333	30338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572206
555	NC_004551	A	6	6	30364	30369	100 %	0 %	0 %	0 %	28572206
556	NC_004551	ACT	2	6	30390	30395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572206
557	NC_004551	TGC	2	6	30410	30415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572206
558	NC_004551	GCA	2	6	30465	30470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572206
559	NC_004551	GCA	2	6	30501	30506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572206
560	NC_004551	AATT	2	8	30508	30515	50 %	50 %	0 %	0 %	28572206
561	NC_004551	GGC	2	6	30533	30538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572206
562	NC_004551	CT	3	6	30594	30599	0 %	50 %	0 %	50 %	28572206
563	NC_004551	ACC	2	6	30632	30637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572206
564	NC_004551	GCC	2	6	30671	30676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572207
565	NC_004551	CCA	2	6	30694	30699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572207
566	NC_004551	TAT	2	6	30705	30710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572207
567	NC_004551	ATTG	2	8	30721	30728	25 %	50 %	25 %	0 %	28572207
568	NC_004551	AC	3	6	30795	30800	50 %	0 %	0 %	50 %	28572207
569	NC_004551	AAT	2	6	30874	30879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572207
570	NC_004551	CTCAA	2	10	30899	30908	40 %	20 %	0 %	40 %	28572207
571	NC_004551	C	6	6	30910	30915	0 %	0 %	0 %	100 %	28572207
572	NC_004551	TCA	2	6	30980	30985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572207
573	NC_004551	TCT	2	6	31040	31045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572207
574	NC_004551	ATT	2	6	31102	31107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572207
575	NC_004551	GCC	2	6	31175	31180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572207
576	NC_004551	TCA	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572207
577	NC_004551	AT	3	6	31269	31274	50 %	50 %	0 %	0 %	28572207
578	NC_004551	GCA	2	6	31301	31306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572207
579	NC_004551	GCC	2	6	31317	31322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572207
580	NC_004551	TCA	2	6	31445	31450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572207
581	NC_004551	CGA	2	6	31483	31488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572207
582	NC_004551	CACTGT	2	12	31540	31551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28572207
583	NC_004551	ATT	2	6	31699	31704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004551	TGCA	2	8	31731	31738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_004551	CAC	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_004551	AGT	2	6	31773	31778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004551	GCT	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004551	AAG	2	6	32051	32056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572208
589	NC_004551	CT	3	6	32080	32085	0 %	50 %	0 %	50 %	28572208
590	NC_004551	TG	3	6	32115	32120	0 %	50 %	50 %	0 %	28572208
591	NC_004551	ACT	2	6	32283	32288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572208
592	NC_004551	GA	3	6	32316	32321	50 %	0 %	50 %	0 %	28572208
593	NC_004551	ACT	2	6	32369	32374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572208
594	NC_004551	TGC	3	9	32401	32409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572208
595	NC_004551	GGT	2	6	32435	32440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572208
596	NC_004551	AC	3	6	32495	32500	50 %	0 %	0 %	50 %	28572208
597	NC_004551	TAT	2	6	32579	32584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572209
598	NC_004551	TGG	2	6	32591	32596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572209
599	NC_004551	GAT	2	6	32666	32671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572209
600	NC_004551	TAT	2	6	32673	32678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572209
601	NC_004551	ATG	2	6	32694	32699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572209
602	NC_004551	AAC	2	6	32726	32731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572209
603	NC_004551	AT	3	6	32896	32901	50 %	50 %	0 %	0 %	28572209
604	NC_004551	GTT	2	6	33000	33005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572209
605	NC_004551	GAA	2	6	33039	33044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572209
606	NC_004551	TTTA	2	8	33175	33182	25 %	75 %	0 %	0 %	28572209
607	NC_004551	GTTG	2	8	33309	33316	0 %	50 %	50 %	0 %	28572209
608	NC_004551	TGGA	2	8	33341	33348	25 %	25 %	50 %	0 %	28572209
609	NC_004551	GAT	3	9	33351	33359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572209
610	NC_004551	CCT	2	6	33419	33424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572209
611	NC_004551	ACT	2	6	33456	33461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572210
612	NC_004551	T	7	7	33535	33541	0 %	100 %	0 %	0 %	28572210
613	NC_004551	A	8	8	33583	33590	100 %	0 %	0 %	0 %	28572210
614	NC_004551	A	6	6	33709	33714	100 %	0 %	0 %	0 %	28572210
615	NC_004551	ATG	2	6	33758	33763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572210
616	NC_004551	AT	3	6	33852	33857	50 %	50 %	0 %	0 %	28572210
617	NC_004551	GGAT	2	8	33910	33917	25 %	25 %	50 %	0 %	28572210
618	NC_004551	AG	3	6	33990	33995	50 %	0 %	50 %	0 %	28572210
619	NC_004551	CAA	2	6	34185	34190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572210
620	NC_004551	ACTC	2	8	34198	34205	25 %	25 %	0 %	50 %	28572210
621	NC_004551	A	6	6	34235	34240	100 %	0 %	0 %	0 %	28572210
622	NC_004551	TC	3	6	34241	34246	0 %	50 %	0 %	50 %	28572210
623	NC_004551	TCATTG	2	12	34296	34307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28572210
624	NC_004551	TGT	2	6	34341	34346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572211
625	NC_004551	TAG	2	6	34351	34356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572211
626	NC_004551	T	7	7	34480	34486	0 %	100 %	0 %	0 %	28572211
627	NC_004551	TCA	2	6	34516	34521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572211
628	NC_004551	CAA	2	6	34524	34529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572211
629	NC_004551	GGTCTG	2	12	34532	34543	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28572211
630	NC_004551	ATAC	2	8	34575	34582	50 %	25 %	0 %	25 %	28572211
631	NC_004551	CAA	2	6	34637	34642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572211
632	NC_004551	TA	3	6	34702	34707	50 %	50 %	0 %	0 %	28572211
633	NC_004551	TC	3	6	34709	34714	0 %	50 %	0 %	50 %	28572211
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