MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004551	TTC	2	6	351873	351878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161501891
6502	NC_004551	TCTT	2	8	351993	352000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6503	NC_004551	GAAG	2	8	352004	352011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_004551	GT	3	6	352015	352020	0 %	50 %	50 %	0 %	28572474
6505	NC_004551	TTG	2	6	352263	352268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572474
6506	NC_004551	GA	3	6	352298	352303	50 %	0 %	50 %	0 %	28572474
6507	NC_004551	GCA	2	6	352449	352454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572474
6508	NC_004551	TCC	2	6	352492	352497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572474
6509	NC_004551	ATG	2	6	352530	352535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572474
6510	NC_004551	TTG	2	6	352692	352697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572474
6511	NC_004551	CTT	2	6	352733	352738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572474
6512	NC_004551	GC	3	6	352817	352822	0 %	0 %	50 %	50 %	28572474
6513	NC_004551	TTC	2	6	352867	352872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572475
6514	NC_004551	TGG	2	6	352895	352900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572475
6515	NC_004551	GTTG	2	8	352910	352917	0 %	50 %	50 %	0 %	28572475
6516	NC_004551	GGT	2	6	352995	353000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572475
6517	NC_004551	G	6	6	353011	353016	0 %	0 %	100 %	0 %	28572475
6518	NC_004551	GTC	2	6	353026	353031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572475
6519	NC_004551	GA	3	6	353193	353198	50 %	0 %	50 %	0 %	28572475
6520	NC_004551	GTT	2	6	353217	353222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572475
6521	NC_004551	AG	3	6	353278	353283	50 %	0 %	50 %	0 %	28572475
6522	NC_004551	GAT	2	6	353346	353351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572475
6523	NC_004551	AAAT	2	8	353356	353363	75 %	25 %	0 %	0 %	28572475
6524	NC_004551	GTT	2	6	353424	353429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572475
6525	NC_004551	TGTGG	2	10	353550	353559	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_004551	TG	3	6	353657	353662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_004551	CAT	2	6	353715	353720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572476
6528	NC_004551	GCG	2	6	353726	353731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572476
6529	NC_004551	AACAA	2	10	353749	353758	80 %	0 %	0 %	20 %	28572476
6530	NC_004551	CTT	2	6	353929	353934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572476
6531	NC_004551	ATG	2	6	353987	353992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572476
6532	NC_004551	GC	3	6	354031	354036	0 %	0 %	50 %	50 %	28572476
6533	NC_004551	AGA	2	6	354072	354077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572476
6534	NC_004551	CGC	2	6	354103	354108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572476
6535	NC_004551	CGT	2	6	354160	354165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572476
6536	NC_004551	ACTA	2	8	354183	354190	50 %	25 %	0 %	25 %	28572476
6537	NC_004551	GTA	2	6	354205	354210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572476
6538	NC_004551	GAT	2	6	354211	354216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572476
6539	NC_004551	TTG	2	6	354217	354222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572476
6540	NC_004551	CTT	2	6	354241	354246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572476
6541	NC_004551	TTC	2	6	354318	354323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_004551	TTTG	2	8	354434	354441	0 %	75 %	25 %	0 %	28572477
6543	NC_004551	CCAC	2	8	354493	354500	25 %	0 %	0 %	75 %	28572477
6544	NC_004551	CG	3	6	354502	354507	0 %	0 %	50 %	50 %	28572477
6545	NC_004551	TGT	2	6	354545	354550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572477
6546	NC_004551	T	6	6	354570	354575	0 %	100 %	0 %	0 %	28572477
6547	NC_004551	T	6	6	354633	354638	0 %	100 %	0 %	0 %	28572477
6548	NC_004551	CATT	2	8	354660	354667	25 %	50 %	0 %	25 %	28572477
6549	NC_004551	T	7	7	354673	354679	0 %	100 %	0 %	0 %	28572477
6550	NC_004551	TA	3	6	354681	354686	50 %	50 %	0 %	0 %	28572477
6551	NC_004551	TCT	2	6	354818	354823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572477
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6553	NC_004551	TC	3	6	354882	354887	0 %	50 %	0 %	50 %	28572477
6554	NC_004551	T	6	6	354888	354893	0 %	100 %	0 %	0 %	28572477
6555	NC_004551	TGC	2	6	354913	354918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572477
6556	NC_004551	GCC	2	6	354948	354953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572477
6557	NC_004551	TA	3	6	354999	355004	50 %	50 %	0 %	0 %	28572477
6558	NC_004551	GGA	2	6	355053	355058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572477
6559	NC_004551	CT	3	6	355145	355150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_004551	CTTT	2	8	355210	355217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6561	NC_004551	ATC	2	6	355270	355275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_004551	TGCG	2	8	355278	355285	0 %	25 %	50 %	25 %	28572478
6563	NC_004551	TCAAT	2	10	355303	355312	40 %	40 %	0 %	20 %	28572478
6564	NC_004551	TGGCT	2	10	355336	355345	0 %	40 %	40 %	20 %	28572478
6565	NC_004551	AATG	2	8	355350	355357	50 %	25 %	25 %	0 %	28572478
6566	NC_004551	TGC	2	6	355367	355372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572478
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6570	NC_004551	GGAAG	2	10	355635	355644	40 %	0 %	60 %	0 %	28572478
6571	NC_004551	AGA	2	6	355716	355721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572478
6572	NC_004551	TTG	2	6	355744	355749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572478
6573	NC_004551	TCAGCG	2	12	355922	355933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28572478
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6575	NC_004551	ATCG	2	8	356013	356020	25 %	25 %	25 %	25 %	28572478
6576	NC_004551	GAC	2	6	356112	356117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572478
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6578	NC_004551	TCG	2	6	356156	356161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572479
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6580	NC_004551	GCT	2	6	356217	356222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572479
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6584	NC_004551	CGT	2	6	356544	356549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572479
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6588	NC_004551	CCAGA	2	10	356717	356726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6589	NC_004551	TTA	2	6	356773	356778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_004551	CGAC	2	8	356822	356829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_004551	TTA	2	6	356847	356852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_004551	ATC	2	6	357022	357027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572480
6593	NC_004551	CCAG	2	8	357109	357116	25 %	0 %	25 %	50 %	28572480
6594	NC_004551	T	6	6	357328	357333	0 %	100 %	0 %	0 %	28572480
6595	NC_004551	CAT	2	6	357378	357383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572480
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6597	NC_004551	CTT	2	6	357565	357570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_004551	GAT	2	6	357684	357689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_004551	TTG	2	6	357691	357696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_004551	CCT	2	6	357728	357733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_004551	TGT	2	6	357743	357748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_004551	A	7	7	357808	357814	100 %	0 %	0 %	0 %	28572481
6603	NC_004551	AAG	2	6	357922	357927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572481
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6605	NC_004551	GAT	2	6	357985	357990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572481
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6608	NC_004551	TGA	2	6	358041	358046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572481
6609	NC_004551	TGT	2	6	358074	358079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572481
6610	NC_004551	GCT	2	6	358120	358125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572481
6611	NC_004551	TGC	2	6	358170	358175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572481
6612	NC_004551	CTGC	2	8	358232	358239	0 %	25 %	25 %	50 %	28572481
6613	NC_004551	ATT	2	6	358276	358281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572481
6614	NC_004551	AAGG	2	8	358306	358313	50 %	0 %	50 %	0 %	28572481
6615	NC_004551	GAG	2	6	358327	358332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572481
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6618	NC_004551	GTT	2	6	358582	358587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572481
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6620	NC_004551	GGTCA	2	10	358687	358696	20 %	20 %	40 %	20 %	28572481
6621	NC_004551	GAG	2	6	358702	358707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572481
6622	NC_004551	TCT	2	6	358740	358745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572481
6623	NC_004551	GTT	3	9	358762	358770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572481
6624	NC_004551	GAC	2	6	358782	358787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572481
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