MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004551	GC	3	6	265487	265492	0 %	0 %	50 %	50 %	28572401
5002	NC_004551	T	6	6	265579	265584	0 %	100 %	0 %	0 %	28572401
5003	NC_004551	AAG	2	6	265646	265651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572401
5004	NC_004551	TTGT	2	8	265689	265696	0 %	75 %	25 %	0 %	28572401
5005	NC_004551	ATCTGC	2	12	265726	265737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28572401
5006	NC_004551	AGA	2	6	265744	265749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572401
5007	NC_004551	TCT	3	9	265842	265850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572401
5008	NC_004551	CG	3	6	265851	265856	0 %	0 %	50 %	50 %	28572401
5009	NC_004551	CG	3	6	265874	265879	0 %	0 %	50 %	50 %	28572401
5010	NC_004551	AG	3	6	265887	265892	50 %	0 %	50 %	0 %	28572401
5011	NC_004551	ATTG	2	8	265911	265918	25 %	50 %	25 %	0 %	28572401
5012	NC_004551	ATT	2	6	265935	265940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572401
5013	NC_004551	GTG	2	6	266011	266016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572401
5014	NC_004551	ACT	2	6	266114	266119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572401
5015	NC_004551	GA	3	6	266214	266219	50 %	0 %	50 %	0 %	28572401
5016	NC_004551	CAG	2	6	266294	266299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572401
5017	NC_004551	GAG	2	6	266306	266311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572401
5018	NC_004551	A	8	8	266315	266322	100 %	0 %	0 %	0 %	28572401
5019	NC_004551	AGA	2	6	266474	266479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572401
5020	NC_004551	A	6	6	266517	266522	100 %	0 %	0 %	0 %	28572401
5021	NC_004551	A	6	6	266554	266559	100 %	0 %	0 %	0 %	28572401
5022	NC_004551	TAA	2	6	266668	266673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572401
5023	NC_004551	CA	3	6	266705	266710	50 %	0 %	0 %	50 %	28572401
5024	NC_004551	ACA	2	6	266743	266748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572401
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5026	NC_004551	ATCC	2	8	266914	266921	25 %	25 %	0 %	50 %	28572401
5027	NC_004551	AAG	2	6	267037	267042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572401
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5032	NC_004551	AGTTTT	2	12	267444	267455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	28572401
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5034	NC_004551	GTA	2	6	267559	267564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572401
5035	NC_004551	CGG	2	6	267679	267684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572401
5036	NC_004551	A	6	6	267693	267698	100 %	0 %	0 %	0 %	28572401
5037	NC_004551	TCT	2	6	267767	267772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572401
5038	NC_004551	GAG	2	6	267810	267815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572401
5039	NC_004551	TGCA	2	8	267833	267840	25 %	25 %	25 %	25 %	28572401
5040	NC_004551	A	6	6	267840	267845	100 %	0 %	0 %	0 %	28572401
5041	NC_004551	GTC	2	6	267900	267905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572402
5042	NC_004551	GAA	2	6	267941	267946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572402
5043	NC_004551	ATT	2	6	267956	267961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572402
5044	NC_004551	TAT	2	6	268075	268080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572402
5045	NC_004551	AT	3	6	268220	268225	50 %	50 %	0 %	0 %	28572402
5046	NC_004551	CG	3	6	268297	268302	0 %	0 %	50 %	50 %	28572402
5047	NC_004551	CTT	2	6	268307	268312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572402
5048	NC_004551	GACGAG	2	12	268328	268339	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	28572402
5049	NC_004551	TGA	2	6	268384	268389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572402
5050	NC_004551	A	8	8	268551	268558	100 %	0 %	0 %	0 %	28572402
5051	NC_004551	AGGC	2	8	268757	268764	25 %	0 %	50 %	25 %	28572402
5052	NC_004551	CAA	2	6	268828	268833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572402
5053	NC_004551	ATG	2	6	268938	268943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572402
5054	NC_004551	AT	3	6	269124	269129	50 %	50 %	0 %	0 %	28572402
5055	NC_004551	GTT	2	6	269144	269149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572402
5056	NC_004551	AAT	2	6	269170	269175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572402
5057	NC_004551	GCG	2	6	269178	269183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572402
5058	NC_004551	TCTT	3	12	269194	269205	0 %	75 %	0 %	25 %	28572402
5059	NC_004551	CGGT	2	8	269274	269281	0 %	25 %	50 %	25 %	28572402
5060	NC_004551	A	8	8	269282	269289	100 %	0 %	0 %	0 %	28572402
5061	NC_004551	A	6	6	269337	269342	100 %	0 %	0 %	0 %	28572402
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5064	NC_004551	T	6	6	269390	269395	0 %	100 %	0 %	0 %	28572402
5065	NC_004551	GAG	2	6	269450	269455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572402
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5072	NC_004551	GCT	2	6	269840	269845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572402
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5074	NC_004551	GCA	2	6	269872	269877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572402
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5077	NC_004551	GC	3	6	270075	270080	0 %	0 %	50 %	50 %	28572402
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5089	NC_004551	GATA	2	8	270575	270582	50 %	25 %	25 %	0 %	28572402
5090	NC_004551	ATC	2	6	270610	270615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572402
5091	NC_004551	AT	3	6	270701	270706	50 %	50 %	0 %	0 %	28572402
5092	NC_004551	ATA	2	6	270717	270722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572402
5093	NC_004551	TGA	2	6	270751	270756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572402
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5095	NC_004551	T	6	6	270830	270835	0 %	100 %	0 %	0 %	28572403
5096	NC_004551	GTTT	2	8	270859	270866	0 %	75 %	25 %	0 %	28572403
5097	NC_004551	TTC	2	6	270883	270888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572403
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5105	NC_004551	T	8	8	271406	271413	0 %	100 %	0 %	0 %	28572403
5106	NC_004551	TCT	2	6	271448	271453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572403
5107	NC_004551	CAA	2	6	271515	271520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572403
5108	NC_004551	TG	4	8	271557	271564	0 %	50 %	50 %	0 %	28572403
5109	NC_004551	CAG	2	6	271569	271574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572403
5110	NC_004551	AGA	2	6	271580	271585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572403
5111	NC_004551	GCT	2	6	271607	271612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572403
5112	NC_004551	GCA	2	6	271634	271639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572403
5113	NC_004551	TC	3	6	271658	271663	0 %	50 %	0 %	50 %	28572403
5114	NC_004551	GC	3	6	271765	271770	0 %	0 %	50 %	50 %	28572403
5115	NC_004551	TTA	2	6	271851	271856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572403
5116	NC_004551	ATC	2	6	271870	271875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572403
5117	NC_004551	GTA	2	6	271881	271886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572403
5118	NC_004551	GTG	2	6	271897	271902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572403
5119	NC_004551	GTA	2	6	271929	271934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572403
5120	NC_004551	T	6	6	272019	272024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_004551	AAT	2	6	272074	272079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572404
5122	NC_004551	T	6	6	272092	272097	0 %	100 %	0 %	0 %	28572404
5123	NC_004551	AAT	2	6	272153	272158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572404
5124	NC_004551	AAG	2	6	272195	272200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572404
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5126	NC_004551	T	7	7	272364	272370	0 %	100 %	0 %	0 %	28572404
5127	NC_004551	GCA	2	6	272436	272441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572404
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5129	NC_004551	GC	3	6	272580	272585	0 %	0 %	50 %	50 %	28572404
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5131	NC_004551	CTGT	2	8	272670	272677	0 %	50 %	25 %	25 %	28572404
5132	NC_004551	TGAT	2	8	272725	272732	25 %	50 %	25 %	0 %	28572404
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5231	NC_004551	GATT	2	8	278374	278381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_004551	TTGG	2	8	279122	279129	0 %	50 %	50 %	0 %	28572410
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5252	NC_004551	TATAGA	2	12	279727	279738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28572411
5253	NC_004551	CAA	2	6	279978	279983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572411
5254	NC_004551	AAG	2	6	280207	280212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572411
5255	NC_004551	AG	3	6	280278	280283	50 %	0 %	50 %	0 %	28572411
5256	NC_004551	GTT	2	6	280352	280357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572411
5257	NC_004551	AAG	2	6	280359	280364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572411
5258	NC_004551	T	6	6	280381	280386	0 %	100 %	0 %	0 %	28572411
5259	NC_004551	AGC	2	6	280456	280461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572411
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5261	NC_004551	ATGCG	2	10	280476	280485	20 %	20 %	40 %	20 %	28572411
5262	NC_004551	TGA	2	6	280579	280584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572411
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5265	NC_004551	GC	3	6	280783	280788	0 %	0 %	50 %	50 %	28572411
5266	NC_004551	GAT	2	6	280840	280845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572411
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5268	NC_004551	TAT	2	6	280954	280959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572411
5269	NC_004551	TC	3	6	281033	281038	0 %	50 %	0 %	50 %	28572411
5270	NC_004551	ATT	2	6	281081	281086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572411
5271	NC_004551	GAT	2	6	281087	281092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572411
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5275	NC_004551	A	6	6	281341	281346	100 %	0 %	0 %	0 %	28572411
5276	NC_004551	TCTG	2	8	281392	281399	0 %	50 %	25 %	25 %	28572411
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5281	NC_004551	CTT	2	6	281732	281737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572411
5282	NC_004551	ATTCA	2	10	282036	282045	40 %	40 %	0 %	20 %	28572411
5283	NC_004551	CCG	2	6	282109	282114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572411
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5287	NC_004551	TTC	2	6	282238	282243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572411
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5292	NC_004551	AAC	2	6	282474	282479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572411
5293	NC_004551	TGA	2	6	282526	282531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572411
5294	NC_004551	AAGA	2	8	282578	282585	75 %	0 %	25 %	0 %	28572411
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5297	NC_004551	TTG	2	6	282853	282858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5299	NC_004551	CTTC	2	8	282959	282966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5300	NC_004551	TTG	2	6	283000	283005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5302	NC_004551	AAG	2	6	283073	283078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572412
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5304	NC_004551	TGA	2	6	283152	283157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572412
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5314	NC_004551	T	7	7	283645	283651	0 %	100 %	0 %	0 %	28572412
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5322	NC_004551	AC	3	6	284206	284211	50 %	0 %	0 %	50 %	28572413
5323	NC_004551	TTC	2	6	284227	284232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572413
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5329	NC_004551	A	8	8	284450	284457	100 %	0 %	0 %	0 %	28572413
5330	NC_004551	CTG	2	6	284517	284522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572413
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5354	NC_004551	ATT	2	6	285773	285778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572414
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5359	NC_004551	GGGT	2	8	286010	286017	0 %	25 %	75 %	0 %	28572414
5360	NC_004551	TGA	2	6	286130	286135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572415
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5365	NC_004551	GT	3	6	286453	286458	0 %	50 %	50 %	0 %	28572415
5366	NC_004551	GTT	2	6	286461	286466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572415
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5371	NC_004551	TAA	2	6	286648	286653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572415
5372	NC_004551	AG	3	6	286665	286670	50 %	0 %	50 %	0 %	28572415
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5374	NC_004551	TGG	2	6	286741	286746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572415
5375	NC_004551	TTGC	2	8	286791	286798	0 %	50 %	25 %	25 %	28572415
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5377	NC_004551	TGA	2	6	286814	286819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572415
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5401	NC_004551	T	7	7	287866	287872	0 %	100 %	0 %	0 %	28572416
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5433	NC_004551	CTCA	2	8	289904	289911	25 %	25 %	0 %	50 %	28572418
5434	NC_004551	AC	3	6	289943	289948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5482	NC_004551	CG	3	6	292957	292962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5483	NC_004551	ACA	2	6	292999	293004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5486	NC_004551	TCT	3	9	293091	293099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572421
5487	NC_004551	TAT	2	6	293116	293121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572421
5488	NC_004551	A	6	6	293124	293129	100 %	0 %	0 %	0 %	28572421
5489	NC_004551	T	6	6	293151	293156	0 %	100 %	0 %	0 %	28572421
5490	NC_004551	TTA	2	6	293218	293223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572421
5491	NC_004551	CAT	2	6	293254	293259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572421
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5494	NC_004551	CAA	2	6	293494	293499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572421
5495	NC_004551	CAA	2	6	293572	293577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572421
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5497	NC_004551	GGC	2	6	293841	293846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572421
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5499	NC_004551	AGC	2	6	293994	293999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572421
5500	NC_004551	CCT	2	6	294115	294120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572421

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