MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_004113	GCA	2	6	2536088	2536093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299965
47003	NC_004113	TTGG	2	8	2536095	2536102	0 %	50 %	50 %	0 %	22299965
47004	NC_004113	GACTC	2	10	2536104	2536113	20 %	20 %	20 %	40 %	22299965
47005	NC_004113	A	6	6	2536124	2536129	100 %	0 %	0 %	0 %	22299965
47006	NC_004113	A	6	6	2536192	2536197	100 %	0 %	0 %	0 %	22299965
47007	NC_004113	TGA	2	6	2536207	2536212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299965
47008	NC_004113	TAGA	2	8	2536260	2536267	50 %	25 %	25 %	0 %	22299965
47009	NC_004113	GATTG	2	10	2536289	2536298	20 %	40 %	40 %	0 %	22299965
47010	NC_004113	TGG	2	6	2536306	2536311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299965
47011	NC_004113	GCT	2	6	2536354	2536359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299965
47012	NC_004113	GAG	2	6	2536392	2536397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299965
47013	NC_004113	G	9	9	2536502	2536510	0 %	0 %	100 %	0 %	22299965
47014	NC_004113	AGGGA	2	10	2536534	2536543	40 %	0 %	60 %	0 %	22299965
47015	NC_004113	AAC	3	9	2536584	2536592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299965
47016	NC_004113	AGTG	2	8	2536710	2536717	25 %	25 %	50 %	0 %	22299965
47017	NC_004113	GAA	2	6	2536996	2537001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47018	NC_004113	CAA	2	6	2537054	2537059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47019	NC_004113	TC	3	6	2537092	2537097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47020	NC_004113	CCG	2	6	2537110	2537115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47021	NC_004113	TGA	3	9	2537167	2537175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299966
47022	NC_004113	GGA	2	6	2537470	2537475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299966
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47024	NC_004113	CTG	2	6	2537651	2537656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299966
47025	NC_004113	GAT	2	6	2537720	2537725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299966
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47027	NC_004113	CTG	2	6	2537975	2537980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299967
47028	NC_004113	CGG	2	6	2538048	2538053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299967
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47033	NC_004113	CGA	2	6	2538546	2538551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299967
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47038	NC_004113	G	8	8	2538763	2538770	0 %	0 %	100 %	0 %	22299967
47039	NC_004113	AAAT	2	8	2538795	2538802	75 %	25 %	0 %	0 %	22299967
47040	NC_004113	CGCAGG	2	12	2538878	2538889	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22299967
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47046	NC_004113	G	6	6	2539267	2539272	0 %	0 %	100 %	0 %	22299967
47047	NC_004113	TCAA	2	8	2539334	2539341	50 %	25 %	0 %	25 %	22299967
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47051	NC_004113	GTT	2	6	2539650	2539655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299967
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47053	NC_004113	TTCA	2	8	2539727	2539734	25 %	50 %	0 %	25 %	22299967
47054	NC_004113	A	6	6	2539778	2539783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_004113	GGC	2	6	2539823	2539828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299968
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47060	NC_004113	GGT	2	6	2540189	2540194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299968
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47069	NC_004113	TGA	2	6	2540712	2540717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299968
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47240	NC_004113	TACC	2	8	2548871	2548878	25 %	25 %	0 %	50 %	22299976
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47275	NC_004113	TGC	2	6	2550430	2550435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299978
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47345	NC_004113	GCCAA	2	10	2554266	2554275	40 %	0 %	20 %	40 %	22299982
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47348	NC_004113	GCA	2	6	2554365	2554370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299982
47349	NC_004113	TGA	2	6	2554500	2554505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299982
47350	NC_004113	GACA	2	8	2554520	2554527	50 %	0 %	25 %	25 %	22299982
47351	NC_004113	AGCAGG	2	12	2554549	2554560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22299983
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47353	NC_004113	ATAGGT	2	12	2554602	2554613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299983
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47475	NC_004113	CTT	2	6	2560761	2560766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299990
47476	NC_004113	GAT	2	6	2560780	2560785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299990
47477	NC_004113	GA	3	6	2560891	2560896	50 %	0 %	50 %	0 %	22299990
47478	NC_004113	TCC	2	6	2560916	2560921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299990
47479	NC_004113	GCC	2	6	2561063	2561068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299990
47480	NC_004113	GCC	2	6	2561144	2561149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299990
47481	NC_004113	T	6	6	2561323	2561328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47482	NC_004113	TTA	2	6	2561360	2561365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47483	NC_004113	CGA	2	6	2561515	2561520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299991
47484	NC_004113	TGG	2	6	2561522	2561527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299991
47485	NC_004113	GTG	2	6	2561536	2561541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299991
47486	NC_004113	GCA	2	6	2561547	2561552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299991
47487	NC_004113	TGC	2	6	2561633	2561638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299991
47488	NC_004113	AAC	2	6	2561689	2561694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47489	NC_004113	CCTC	2	8	2561717	2561724	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47490	NC_004113	CAA	2	6	2561735	2561740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47491	NC_004113	CTG	2	6	2561767	2561772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299992
47492	NC_004113	AAG	2	6	2561844	2561849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299992
47493	NC_004113	GCT	2	6	2561877	2561882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299992
47494	NC_004113	GGGCTT	2	12	2561910	2561921	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22299992
47495	NC_004113	GCA	2	6	2562029	2562034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299992
47496	NC_004113	GTA	2	6	2562055	2562060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299992
47497	NC_004113	TCA	2	6	2562150	2562155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299993
47498	NC_004113	GCT	2	6	2562247	2562252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47499	NC_004113	GAGC	2	8	2562308	2562315	25 %	0 %	50 %	25 %	22299993
47500	NC_004113	TTC	2	6	2562318	2562323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299993

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