MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_004113	AGC	2	6	2509296	2509301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299939
46502	NC_004113	CA	3	6	2509403	2509408	50 %	0 %	0 %	50 %	22299939
46503	NC_004113	ACC	2	6	2509472	2509477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299939
46504	NC_004113	TGG	2	6	2509510	2509515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299939
46505	NC_004113	CAATC	2	10	2509534	2509543	40 %	20 %	0 %	40 %	22299939
46506	NC_004113	C	6	6	2509543	2509548	0 %	0 %	0 %	100 %	22299939
46507	NC_004113	G	7	7	2509586	2509592	0 %	0 %	100 %	0 %	22299939
46508	NC_004113	GCC	2	6	2509701	2509706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299939
46509	NC_004113	CAC	2	6	2509732	2509737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299939
46510	NC_004113	C	7	7	2509821	2509827	0 %	0 %	0 %	100 %	22299939
46511	NC_004113	CCA	2	6	2509834	2509839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299939
46512	NC_004113	TCA	2	6	2509873	2509878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299939
46513	NC_004113	CAT	2	6	2509892	2509897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299939
46514	NC_004113	CAG	2	6	2509907	2509912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46515	NC_004113	ACA	2	6	2509919	2509924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299940
46516	NC_004113	ACC	2	6	2509984	2509989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299940
46517	NC_004113	TGC	2	6	2510010	2510015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46518	NC_004113	CCAAG	2	10	2510066	2510075	40 %	0 %	20 %	40 %	22299940
46519	NC_004113	C	6	6	2510137	2510142	0 %	0 %	0 %	100 %	22299940
46520	NC_004113	ATG	2	6	2510152	2510157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299940
46521	NC_004113	TCA	2	6	2510162	2510167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299940
46522	NC_004113	CCA	2	6	2510211	2510216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299940
46523	NC_004113	ACC	2	6	2510230	2510235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299940
46524	NC_004113	GCT	2	6	2510236	2510241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46525	NC_004113	AAT	2	6	2510245	2510250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299940
46526	NC_004113	CAT	2	6	2510313	2510318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299940
46527	NC_004113	CCCA	2	8	2510346	2510353	25 %	0 %	0 %	75 %	22299940
46528	NC_004113	GCA	2	6	2510440	2510445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46529	NC_004113	GA	3	6	2510494	2510499	50 %	0 %	50 %	0 %	22299940
46530	NC_004113	AGG	2	6	2510500	2510505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299940
46531	NC_004113	TGC	2	6	2510551	2510556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46532	NC_004113	TTG	2	6	2510559	2510564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299940
46533	NC_004113	TGC	2	6	2510584	2510589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46534	NC_004113	C	6	6	2510603	2510608	0 %	0 %	0 %	100 %	22299940
46535	NC_004113	CAG	2	6	2510621	2510626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46536	NC_004113	ATG	2	6	2510638	2510643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299940
46537	NC_004113	G	6	6	2510675	2510680	0 %	0 %	100 %	0 %	22299940
46538	NC_004113	TGG	2	6	2510752	2510757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299940
46539	NC_004113	AAG	2	6	2510793	2510798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299940
46540	NC_004113	TGA	3	9	2510891	2510899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299940
46541	NC_004113	GCC	2	6	2511042	2511047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299940
46542	NC_004113	CCA	2	6	2511120	2511125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299940
46543	NC_004113	CAC	2	6	2511291	2511296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299940
46544	NC_004113	CAG	2	6	2511339	2511344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46545	NC_004113	GCA	2	6	2511347	2511352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46546	NC_004113	T	6	6	2511356	2511361	0 %	100 %	0 %	0 %	22299940
46547	NC_004113	CAG	2	6	2511362	2511367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46548	NC_004113	GTA	2	6	2511375	2511380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299940
46549	NC_004113	GCA	2	6	2511440	2511445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299940
46550	NC_004113	CCG	2	6	2511473	2511478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299940
46551	NC_004113	ATC	2	6	2511571	2511576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299940
46552	NC_004113	TGT	2	6	2511804	2511809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46553	NC_004113	ATG	2	6	2511921	2511926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46554	NC_004113	T	7	7	2512039	2512045	0 %	100 %	0 %	0 %	22299941
46555	NC_004113	CTC	2	6	2512082	2512087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299941
46556	NC_004113	TTC	2	6	2512125	2512130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299941
46557	NC_004113	CGA	2	6	2512162	2512167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299941
46558	NC_004113	AGG	2	6	2512215	2512220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299941
46559	NC_004113	TCT	2	6	2512246	2512251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299941
46560	NC_004113	TCT	2	6	2512283	2512288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299941
46561	NC_004113	CAA	2	6	2512518	2512523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299942
46562	NC_004113	GTT	2	6	2512541	2512546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299942
46563	NC_004113	GT	3	6	2512550	2512555	0 %	50 %	50 %	0 %	22299942
46564	NC_004113	GAA	2	6	2512649	2512654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299942
46565	NC_004113	CAG	2	6	2512701	2512706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299942
46566	NC_004113	CTT	2	6	2512739	2512744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299942
46567	NC_004113	AAG	2	6	2512773	2512778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299942
46568	NC_004113	CCT	2	6	2512785	2512790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299942
46569	NC_004113	AGA	2	6	2512801	2512806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299942
46570	NC_004113	TAC	2	6	2512829	2512834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299942
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46572	NC_004113	CTTC	2	8	2512911	2512918	0 %	50 %	0 %	50 %	22299942
46573	NC_004113	TGC	2	6	2512949	2512954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299942
46574	NC_004113	GATC	2	8	2512985	2512992	25 %	25 %	25 %	25 %	22299942
46575	NC_004113	TCA	2	6	2512997	2513002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299942
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46578	NC_004113	CGG	2	6	2513160	2513165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299942
46579	NC_004113	GAA	2	6	2513306	2513311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299942
46580	NC_004113	CAA	2	6	2513381	2513386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299942
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46584	NC_004113	ATC	2	6	2513643	2513648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299942
46585	NC_004113	ACT	2	6	2513694	2513699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46586	NC_004113	TTA	2	6	2513939	2513944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299943
46587	NC_004113	GA	3	6	2514000	2514005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46588	NC_004113	CTG	2	6	2514038	2514043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46589	NC_004113	TGG	2	6	2514110	2514115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299944
46590	NC_004113	CCG	2	6	2514128	2514133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299944
46591	NC_004113	AGG	2	6	2514245	2514250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299944
46592	NC_004113	CAG	2	6	2514253	2514258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299944
46593	NC_004113	GCG	2	6	2514267	2514272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299944
46594	NC_004113	GTCA	2	8	2514310	2514317	25 %	25 %	25 %	25 %	22299944
46595	NC_004113	CAA	2	6	2514363	2514368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299944
46596	NC_004113	CGG	2	6	2514370	2514375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299944
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46598	NC_004113	GCT	2	6	2514451	2514456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299944
46599	NC_004113	CCA	2	6	2514509	2514514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299944
46600	NC_004113	CCAAGC	2	12	2514567	2514578	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22299944
46601	NC_004113	GTG	2	6	2514613	2514618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299944
46602	NC_004113	GGC	2	6	2514636	2514641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299944
46603	NC_004113	CCT	2	6	2514643	2514648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299944
46604	NC_004113	GCA	2	6	2514670	2514675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299944
46605	NC_004113	GTC	2	6	2514697	2514702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299944
46606	NC_004113	CTA	2	6	2514747	2514752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299944
46607	NC_004113	GATT	2	8	2514768	2514775	25 %	50 %	25 %	0 %	22299945
46608	NC_004113	TGG	3	9	2514781	2514789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299945
46609	NC_004113	TCC	2	6	2514866	2514871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299945
46610	NC_004113	AATAGC	2	12	2514907	2514918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22299945
46611	NC_004113	GGT	2	6	2514924	2514929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299945
46612	NC_004113	TTC	2	6	2514944	2514949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299945
46613	NC_004113	CCA	2	6	2515032	2515037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299945
46614	NC_004113	CAC	2	6	2515068	2515073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299945
46615	NC_004113	GCC	2	6	2515138	2515143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299945
46616	NC_004113	CAG	2	6	2515189	2515194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299945
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46618	NC_004113	C	7	7	2515297	2515303	0 %	0 %	0 %	100 %	22299945
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46664	NC_004113	CGCC	2	8	2517443	2517450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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46742	NC_004113	TTC	2	6	2522117	2522122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299952
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46775	NC_004113	GGGA	2	8	2523916	2523923	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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46978	NC_004113	GATCAG	2	12	2534989	2535000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22299964
46979	NC_004113	GTG	2	6	2535014	2535019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46981	NC_004113	AGC	2	6	2535054	2535059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299965
46982	NC_004113	GTG	2	6	2535073	2535078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299965
46983	NC_004113	TGGGG	2	10	2535121	2535130	0 %	20 %	80 %	0 %	22299965
46984	NC_004113	T	6	6	2535170	2535175	0 %	100 %	0 %	0 %	22299965
46985	NC_004113	CGC	2	6	2535223	2535228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299965
46986	NC_004113	ATC	2	6	2535267	2535272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299965
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46990	NC_004113	TAG	2	6	2535463	2535468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299965
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46995	NC_004113	G	6	6	2535716	2535721	0 %	0 %	100 %	0 %	22299965
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