MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_004113	T	6	6	2401156	2401161	0 %	100 %	0 %	0 %	22299853
44502	NC_004113	T	6	6	2401259	2401264	0 %	100 %	0 %	0 %	22299854
44503	NC_004113	GCCA	2	8	2401293	2401300	25 %	0 %	25 %	50 %	22299854
44504	NC_004113	TG	3	6	2401361	2401366	0 %	50 %	50 %	0 %	22299854
44505	NC_004113	C	6	6	2401425	2401430	0 %	0 %	0 %	100 %	22299854
44506	NC_004113	GCA	2	6	2401450	2401455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299854
44507	NC_004113	CAT	2	6	2401501	2401506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299854
44508	NC_004113	T	7	7	2401656	2401662	0 %	100 %	0 %	0 %	22299854
44509	NC_004113	C	6	6	2401695	2401700	0 %	0 %	0 %	100 %	22299854
44510	NC_004113	GCT	2	6	2401710	2401715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299854
44511	NC_004113	CAG	2	6	2401834	2401839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299854
44512	NC_004113	AG	3	6	2401850	2401855	50 %	0 %	50 %	0 %	22299854
44513	NC_004113	T	6	6	2401936	2401941	0 %	100 %	0 %	0 %	22299854
44514	NC_004113	TTTC	2	8	2402070	2402077	0 %	75 %	0 %	25 %	22299854
44515	NC_004113	AAT	2	6	2402087	2402092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299854
44516	NC_004113	GCG	2	6	2402197	2402202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299854
44517	NC_004113	CGT	2	6	2402245	2402250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299854
44518	NC_004113	GCC	2	6	2402291	2402296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299854
44519	NC_004113	C	7	7	2402443	2402449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44520	NC_004113	GAG	2	6	2402657	2402662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44521	NC_004113	ACAA	2	8	2402666	2402673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44522	NC_004113	CAT	2	6	2402785	2402790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299855
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44529	NC_004113	GCCAG	2	10	2403159	2403168	20 %	0 %	40 %	40 %	22299855
44530	NC_004113	GC	3	6	2403185	2403190	0 %	0 %	50 %	50 %	22299855
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44535	NC_004113	TGCC	2	8	2403499	2403506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44536	NC_004113	CA	3	6	2403580	2403585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44537	NC_004113	TGC	2	6	2403713	2403718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44540	NC_004113	TTC	2	6	2403757	2403762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44541	NC_004113	CAA	2	6	2403782	2403787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44542	NC_004113	GCA	2	6	2403862	2403867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44544	NC_004113	GTG	2	6	2403885	2403890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44545	NC_004113	TGG	2	6	2403916	2403921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44548	NC_004113	GATCT	2	10	2404145	2404154	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44549	NC_004113	TGC	2	6	2404224	2404229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44550	NC_004113	CGGC	2	8	2404330	2404337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44551	NC_004113	ACA	2	6	2404350	2404355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44552	NC_004113	CTTCGA	2	12	2404369	2404380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44553	NC_004113	GGC	2	6	2404437	2404442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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44603	NC_004113	CCA	3	9	2407152	2407160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299858
44604	NC_004113	TAT	2	6	2407308	2407313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44605	NC_004113	GTA	2	6	2407336	2407341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44606	NC_004113	CTTG	2	8	2407526	2407533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44607	NC_004113	TTC	2	6	2407551	2407556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44608	NC_004113	CAT	2	6	2407592	2407597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44610	NC_004113	TGAGC	2	10	2407684	2407693	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44611	NC_004113	ATC	2	6	2407698	2407703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299859
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44618	NC_004113	AGCG	2	8	2408055	2408062	25 %	0 %	50 %	25 %	22299859
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44622	NC_004113	CAA	2	6	2408201	2408206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299859
44623	NC_004113	GCT	2	6	2408256	2408261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299859
44624	NC_004113	GAT	2	6	2408270	2408275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299859
44625	NC_004113	A	6	6	2408278	2408283	100 %	0 %	0 %	0 %	22299859
44626	NC_004113	CGA	2	6	2408312	2408317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299859
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44628	NC_004113	CAT	2	6	2408427	2408432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299859
44629	NC_004113	TGG	2	6	2408457	2408462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299859
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44632	NC_004113	AC	3	6	2408536	2408541	50 %	0 %	0 %	50 %	22299859
44633	NC_004113	TTGTG	2	10	2408566	2408575	0 %	60 %	40 %	0 %	22299859
44634	NC_004113	ATC	2	6	2408583	2408588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299860
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44645	NC_004113	GC	3	6	2409268	2409273	0 %	0 %	50 %	50 %	22299860
44646	NC_004113	GGAT	2	8	2409285	2409292	25 %	25 %	50 %	0 %	22299860
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44652	NC_004113	A	6	6	2409603	2409608	100 %	0 %	0 %	0 %	22299860
44653	NC_004113	GTA	2	6	2409649	2409654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299861
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44669	NC_004113	GAAA	2	8	2410121	2410128	75 %	0 %	25 %	0 %	22299861
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44675	NC_004113	AC	3	6	2410673	2410678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44676	NC_004113	GAT	2	6	2410696	2410701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44719	NC_004113	TGT	2	6	2413277	2413282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299865
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44725	NC_004113	CCCT	2	8	2413598	2413605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44726	NC_004113	TTG	2	6	2413658	2413663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44727	NC_004113	G	6	6	2413668	2413673	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44728	NC_004113	CTG	2	6	2413747	2413752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299866
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44731	NC_004113	CAG	2	6	2413830	2413835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299866
44732	NC_004113	GAA	2	6	2413908	2413913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299866
44733	NC_004113	ATG	2	6	2413957	2413962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299866
44734	NC_004113	AGC	2	6	2413993	2413998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299866
44735	NC_004113	CCTGC	2	10	2414004	2414013	0 %	20 %	20 %	60 %	22299866
44736	NC_004113	ATT	2	6	2414016	2414021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299866
44737	NC_004113	CTG	2	6	2414035	2414040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299866
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44975	NC_004113	CGGATC	2	12	2428779	2428790	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299876
44976	NC_004113	CCA	2	6	2428836	2428841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299876
44977	NC_004113	TGC	2	6	2428874	2428879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299876
44978	NC_004113	GCT	2	6	2428951	2428956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299876
44979	NC_004113	ATCA	2	8	2428969	2428976	50 %	25 %	0 %	25 %	22299876
44980	NC_004113	CCACA	2	10	2429032	2429041	40 %	0 %	0 %	60 %	22299876
44981	NC_004113	CTC	2	6	2429107	2429112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299876
44982	NC_004113	CCA	2	6	2429156	2429161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299876
44983	NC_004113	GTT	2	6	2429189	2429194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299876
44984	NC_004113	GCGGA	2	10	2429207	2429216	20 %	0 %	60 %	20 %	22299876
44985	NC_004113	CTG	2	6	2429269	2429274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299876
44986	NC_004113	CCA	2	6	2429304	2429309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299876
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44994	NC_004113	GGCA	2	8	2429662	2429669	25 %	0 %	50 %	25 %	22299877
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44999	NC_004113	CAC	2	6	2429868	2429873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299877
45000	NC_004113	CAC	2	6	2429932	2429937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299878

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