MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_004113	GGA	2	6	2373124	2373129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44002	NC_004113	GCC	2	6	2373175	2373180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44003	NC_004113	A	6	6	2373216	2373221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_004113	GAA	2	6	2373296	2373301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299825
44005	NC_004113	CAAT	2	8	2373328	2373335	50 %	25 %	0 %	25 %	22299825
44006	NC_004113	TGGCA	2	10	2373383	2373392	20 %	20 %	40 %	20 %	22299825
44007	NC_004113	GCC	2	6	2373414	2373419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44008	NC_004113	GGT	3	9	2373444	2373452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_004113	ATC	2	6	2373479	2373484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44010	NC_004113	TTCT	2	8	2373549	2373556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44011	NC_004113	GCA	2	6	2373565	2373570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44012	NC_004113	TCC	2	6	2373594	2373599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44013	NC_004113	CCA	2	6	2373643	2373648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44014	NC_004113	GGA	2	6	2373734	2373739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44015	NC_004113	CTC	2	6	2373795	2373800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44016	NC_004113	TGG	2	6	2373895	2373900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299826
44017	NC_004113	CTG	2	6	2373906	2373911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299826
44018	NC_004113	TGG	2	6	2374076	2374081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299826
44019	NC_004113	TGG	2	6	2374105	2374110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299826
44020	NC_004113	TTGC	2	8	2374115	2374122	0 %	50 %	25 %	25 %	22299826
44021	NC_004113	A	7	7	2374172	2374178	100 %	0 %	0 %	0 %	22299826
44022	NC_004113	GAA	2	6	2374365	2374370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299826
44023	NC_004113	ATT	2	6	2374471	2374476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299826
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44025	NC_004113	GAATT	2	10	2374618	2374627	40 %	40 %	20 %	0 %	22299826
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44029	NC_004113	TCGGG	2	10	2374908	2374917	0 %	20 %	60 %	20 %	22299826
44030	NC_004113	GGC	2	6	2375070	2375075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299826
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44033	NC_004113	CG	3	6	2375209	2375214	0 %	0 %	50 %	50 %	22299826
44034	NC_004113	GAG	2	6	2375304	2375309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299826
44035	NC_004113	TTG	2	6	2375398	2375403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299826
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44038	NC_004113	TGG	2	6	2375560	2375565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299826
44039	NC_004113	AAG	2	6	2375604	2375609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299826
44040	NC_004113	CGC	2	6	2375616	2375621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299826
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44042	NC_004113	AC	3	6	2375700	2375705	50 %	0 %	0 %	50 %	22299827
44043	NC_004113	G	7	7	2375825	2375831	0 %	0 %	100 %	0 %	22299827
44044	NC_004113	T	6	6	2375837	2375842	0 %	100 %	0 %	0 %	22299827
44045	NC_004113	ATC	2	6	2375896	2375901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299827
44046	NC_004113	GAAGC	2	10	2375945	2375954	40 %	0 %	40 %	20 %	22299828
44047	NC_004113	C	6	6	2376012	2376017	0 %	0 %	0 %	100 %	22299828
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44051	NC_004113	CGC	2	6	2376157	2376162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299828
44052	NC_004113	GCT	2	6	2376211	2376216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299828
44053	NC_004113	GTC	2	6	2376217	2376222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299828
44054	NC_004113	TGA	2	6	2376229	2376234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299828
44055	NC_004113	GGGTTT	2	12	2376235	2376246	0 %	50 %	50 %	0 %	22299828
44056	NC_004113	GCA	3	9	2376309	2376317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299828
44057	NC_004113	TGC	2	6	2376414	2376419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299828
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44085	NC_004113	ACA	2	6	2377580	2377585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44086	NC_004113	CTCAAC	2	12	2377591	2377602	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44087	NC_004113	C	6	6	2377617	2377622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44088	NC_004113	GCG	2	6	2377636	2377641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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44093	NC_004113	TGAT	2	8	2377995	2378002	25 %	50 %	25 %	0 %	22299829
44094	NC_004113	TCG	2	6	2378008	2378013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299829
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44098	NC_004113	G	8	8	2378211	2378218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44099	NC_004113	TA	3	6	2378281	2378286	50 %	50 %	0 %	0 %	22299830
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44102	NC_004113	T	7	7	2378535	2378541	0 %	100 %	0 %	0 %	22299830
44103	NC_004113	TGA	2	6	2378561	2378566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299830
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44105	NC_004113	T	6	6	2378589	2378594	0 %	100 %	0 %	0 %	22299830
44106	NC_004113	TCAA	2	8	2378606	2378613	50 %	25 %	0 %	25 %	22299830
44107	NC_004113	TGA	2	6	2378649	2378654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299830
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44111	NC_004113	TGG	2	6	2378927	2378932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299830
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44115	NC_004113	G	6	6	2379336	2379341	0 %	0 %	100 %	0 %	22299830
44116	NC_004113	CAGG	2	8	2379370	2379377	25 %	0 %	50 %	25 %	22299830
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44231	NC_004113	GAT	2	6	2385363	2385368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299836
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44239	NC_004113	ACC	2	6	2385966	2385971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299837
44240	NC_004113	GCT	2	6	2385984	2385989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299837
44241	NC_004113	GGT	2	6	2385992	2385997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299837
44242	NC_004113	CTG	2	6	2386004	2386009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299837
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44249	NC_004113	TGGT	2	8	2386533	2386540	0 %	50 %	50 %	0 %	22299838
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44277	NC_004113	ACA	2	6	2388403	2388408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44331	NC_004113	CT	3	6	2391175	2391180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44332	NC_004113	GGCG	2	8	2391319	2391326	0 %	0 %	75 %	25 %	22299845
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44346	NC_004113	GCA	3	9	2391993	2392001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299846
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44353	NC_004113	CAG	2	6	2392394	2392399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299846
44354	NC_004113	CTT	2	6	2392407	2392412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299846
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44357	NC_004113	TTG	2	6	2392633	2392638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44358	NC_004113	TGC	2	6	2392653	2392658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44475	NC_004113	GAT	2	6	2399530	2399535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299852
44476	NC_004113	GGT	3	9	2399541	2399549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299852
44477	NC_004113	GGC	2	6	2399655	2399660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299852
44478	NC_004113	CTG	2	6	2399738	2399743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299852
44479	NC_004113	TGG	2	6	2399768	2399773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299852
44480	NC_004113	G	6	6	2399870	2399875	0 %	0 %	100 %	0 %	22299852
44481	NC_004113	CTC	2	6	2399927	2399932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299852
44482	NC_004113	TGC	2	6	2399958	2399963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299852
44483	NC_004113	TGG	2	6	2399994	2399999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299852
44484	NC_004113	CTG	2	6	2400012	2400017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299852
44485	NC_004113	CCCTT	2	10	2400030	2400039	0 %	40 %	0 %	60 %	22299852
44486	NC_004113	ATT	2	6	2400082	2400087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299852
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44488	NC_004113	ACT	2	6	2400245	2400250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299852
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44490	NC_004113	GTT	2	6	2400339	2400344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299853
44491	NC_004113	CATT	2	8	2400395	2400402	25 %	50 %	0 %	25 %	22299853
44492	NC_004113	TCG	2	6	2400474	2400479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299853
44493	NC_004113	CTCC	2	8	2400489	2400496	0 %	25 %	0 %	75 %	22299853
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44495	NC_004113	GCA	2	6	2400783	2400788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299853
44496	NC_004113	TGT	2	6	2400796	2400801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299853
44497	NC_004113	C	6	6	2400815	2400820	0 %	0 %	0 %	100 %	22299853
44498	NC_004113	ATG	2	6	2400854	2400859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299853
44499	NC_004113	AGC	2	6	2400934	2400939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299853
44500	NC_004113	GTT	2	6	2401152	2401157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299853

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