MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_004113	AGC	2	6	2345802	2345807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299799
43502	NC_004113	TCG	2	6	2345826	2345831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299799
43503	NC_004113	AT	3	6	2345854	2345859	50 %	50 %	0 %	0 %	22299799
43504	NC_004113	CCA	2	6	2346021	2346026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299799
43505	NC_004113	CAG	2	6	2346272	2346277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299799
43506	NC_004113	CAC	2	6	2346329	2346334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299799
43507	NC_004113	CGC	2	6	2346367	2346372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299799
43508	NC_004113	TGG	2	6	2346390	2346395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299799
43509	NC_004113	CCG	2	6	2346441	2346446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299799
43510	NC_004113	ACC	2	6	2346490	2346495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299799
43511	NC_004113	C	7	7	2346540	2346546	0 %	0 %	0 %	100 %	22299799
43512	NC_004113	CAT	2	6	2346559	2346564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299799
43513	NC_004113	GCG	2	6	2346635	2346640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299799
43514	NC_004113	G	6	6	2346667	2346672	0 %	0 %	100 %	0 %	22299799
43515	NC_004113	ACCA	2	8	2346747	2346754	50 %	0 %	0 %	50 %	22299800
43516	NC_004113	AAC	2	6	2346866	2346871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299800
43517	NC_004113	TGA	2	6	2346900	2346905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299800
43518	NC_004113	TGCT	2	8	2347038	2347045	0 %	50 %	25 %	25 %	22299801
43519	NC_004113	AGT	2	6	2347068	2347073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299801
43520	NC_004113	G	6	6	2347083	2347088	0 %	0 %	100 %	0 %	22299801
43521	NC_004113	CAGC	2	8	2347224	2347231	25 %	0 %	25 %	50 %	22299801
43522	NC_004113	TATC	2	8	2347262	2347269	25 %	50 %	0 %	25 %	22299801
43523	NC_004113	ACT	2	6	2347330	2347335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299801
43524	NC_004113	TGAA	2	8	2347342	2347349	50 %	25 %	25 %	0 %	22299801
43525	NC_004113	GCC	2	6	2347416	2347421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299801
43526	NC_004113	CAA	2	6	2347440	2347445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299801
43527	NC_004113	CAC	2	6	2347510	2347515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299801
43528	NC_004113	ACA	2	6	2347533	2347538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299801
43529	NC_004113	C	7	7	2347559	2347565	0 %	0 %	0 %	100 %	22299801
43530	NC_004113	CCG	2	6	2347575	2347580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299801
43531	NC_004113	CTC	2	6	2347621	2347626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299801
43532	NC_004113	TGA	2	6	2347687	2347692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43533	NC_004113	CGCT	2	8	2347743	2347750	0 %	25 %	25 %	50 %	22299802
43534	NC_004113	ATT	2	6	2347861	2347866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299802
43535	NC_004113	ACA	2	6	2347871	2347876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299802
43536	NC_004113	CCTA	2	8	2347913	2347920	25 %	25 %	0 %	50 %	22299802
43537	NC_004113	CGG	3	9	2347922	2347930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299802
43538	NC_004113	GCT	2	6	2347936	2347941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299802
43539	NC_004113	C	6	6	2347961	2347966	0 %	0 %	0 %	100 %	22299802
43540	NC_004113	CCA	2	6	2348042	2348047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299802
43541	NC_004113	TGGC	2	8	2348069	2348076	0 %	25 %	50 %	25 %	22299802
43542	NC_004113	TGG	2	6	2348089	2348094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299802
43543	NC_004113	GACA	2	8	2348144	2348151	50 %	0 %	25 %	25 %	22299802
43544	NC_004113	CTT	2	6	2348181	2348186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299802
43545	NC_004113	T	6	6	2348191	2348196	0 %	100 %	0 %	0 %	22299802
43546	NC_004113	GAA	2	6	2348212	2348217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299802
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43548	NC_004113	CGGG	2	8	2348257	2348264	0 %	0 %	75 %	25 %	22299802
43549	NC_004113	CG	3	6	2348379	2348384	0 %	0 %	50 %	50 %	22299802
43550	NC_004113	GCG	2	6	2348391	2348396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299802
43551	NC_004113	CG	3	6	2348492	2348497	0 %	0 %	50 %	50 %	22299802
43552	NC_004113	GAG	2	6	2348554	2348559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299802
43553	NC_004113	TGC	2	6	2348565	2348570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299802
43554	NC_004113	CT	4	8	2348617	2348624	0 %	50 %	0 %	50 %	22299802
43555	NC_004113	TGA	2	6	2348733	2348738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299802
43556	NC_004113	TTG	2	6	2348753	2348758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299802
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43558	NC_004113	CAA	2	6	2348826	2348831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299802
43559	NC_004113	TGC	2	6	2348852	2348857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299802
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43565	NC_004113	C	6	6	2349395	2349400	0 %	0 %	0 %	100 %	22299802
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43586	NC_004113	C	6	6	2350764	2350769	0 %	0 %	0 %	100 %	22299803
43587	NC_004113	TC	3	6	2350817	2350822	0 %	50 %	0 %	50 %	22299803
43588	NC_004113	GCA	2	6	2350925	2350930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299803
43589	NC_004113	CT	3	6	2351119	2351124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43590	NC_004113	CCGA	2	8	2351128	2351135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43591	NC_004113	CCA	2	6	2351197	2351202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43592	NC_004113	CCT	2	6	2351249	2351254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299804
43593	NC_004113	CCCA	2	8	2351312	2351319	25 %	0 %	0 %	75 %	22299804
43594	NC_004113	GAA	2	6	2351458	2351463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299804
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43601	NC_004113	CAA	2	6	2351832	2351837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299804
43602	NC_004113	T	7	7	2351892	2351898	0 %	100 %	0 %	0 %	22299805
43603	NC_004113	GCA	2	6	2351907	2351912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299805
43604	NC_004113	AGGAA	2	10	2351947	2351956	60 %	0 %	40 %	0 %	22299805
43605	NC_004113	G	7	7	2352062	2352068	0 %	0 %	100 %	0 %	22299805
43606	NC_004113	TCC	2	6	2352104	2352109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299805
43607	NC_004113	G	6	6	2352146	2352151	0 %	0 %	100 %	0 %	22299805
43608	NC_004113	CCAG	2	8	2352205	2352212	25 %	0 %	25 %	50 %	22299805
43609	NC_004113	CTG	2	6	2352268	2352273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299805
43610	NC_004113	TGG	2	6	2352379	2352384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299805
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43612	NC_004113	CTG	2	6	2352396	2352401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299805
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43614	NC_004113	TTGGG	2	10	2352576	2352585	0 %	40 %	60 %	0 %	22299805
43615	NC_004113	TCG	2	6	2352598	2352603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299805
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43618	NC_004113	T	6	6	2352821	2352826	0 %	100 %	0 %	0 %	22299806
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43620	NC_004113	GTG	2	6	2352837	2352842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299806
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43976	NC_004113	TGGG	2	8	2371762	2371769	0 %	25 %	75 %	0 %	22299823
43977	NC_004113	CTC	2	6	2371831	2371836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299823
43978	NC_004113	CGG	2	6	2371843	2371848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299823
43979	NC_004113	GAG	2	6	2371900	2371905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299823
43980	NC_004113	CCA	3	9	2371983	2371991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299823
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43982	NC_004113	GCA	2	6	2372172	2372177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299823
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43984	NC_004113	GACT	2	8	2372356	2372363	25 %	25 %	25 %	25 %	22299824
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43986	NC_004113	CTGG	2	8	2372408	2372415	0 %	25 %	50 %	25 %	22299824
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43988	NC_004113	G	6	6	2372507	2372512	0 %	0 %	100 %	0 %	22299824
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43993	NC_004113	CTACGC	2	12	2372851	2372862	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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