MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_004113	CCA	2	6	2267824	2267829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299726
42003	NC_004113	CTGC	2	8	2267833	2267840	0 %	25 %	25 %	50 %	22299726
42004	NC_004113	AGA	2	6	2267863	2267868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299726
42005	NC_004113	CA	3	6	2267892	2267897	50 %	0 %	0 %	50 %	22299726
42006	NC_004113	AAT	2	6	2267972	2267977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299726
42007	NC_004113	CCG	2	6	2267981	2267986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299726
42008	NC_004113	ATA	2	6	2268020	2268025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299726
42009	NC_004113	GAG	2	6	2268029	2268034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299726
42010	NC_004113	TGG	3	9	2268058	2268066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299726
42011	NC_004113	AGG	2	6	2268087	2268092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299726
42012	NC_004113	GCC	2	6	2268135	2268140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299726
42013	NC_004113	CCA	2	6	2268244	2268249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299726
42014	NC_004113	TGA	2	6	2268327	2268332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299726
42015	NC_004113	TTTC	2	8	2268340	2268347	0 %	75 %	0 %	25 %	22299726
42016	NC_004113	GATT	2	8	2268397	2268404	25 %	50 %	25 %	0 %	22299726
42017	NC_004113	GAG	2	6	2268427	2268432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299726
42018	NC_004113	CA	3	6	2268468	2268473	50 %	0 %	0 %	50 %	22299726
42019	NC_004113	CCTTG	2	10	2268539	2268548	0 %	40 %	20 %	40 %	22299726
42020	NC_004113	TCA	2	6	2268591	2268596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299726
42021	NC_004113	GCA	2	6	2268612	2268617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299726
42022	NC_004113	GGC	2	6	2268644	2268649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299726
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42024	NC_004113	CTT	2	6	2268783	2268788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299726
42025	NC_004113	CTCA	2	8	2268812	2268819	25 %	25 %	0 %	50 %	22299726
42026	NC_004113	ATCA	2	8	2268875	2268882	50 %	25 %	0 %	25 %	22299726
42027	NC_004113	T	6	6	2268895	2268900	0 %	100 %	0 %	0 %	22299726
42028	NC_004113	TAT	2	6	2268946	2268951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42029	NC_004113	CTG	3	9	2269004	2269012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42030	NC_004113	AGT	3	9	2269042	2269050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42031	NC_004113	TGT	2	6	2269093	2269098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299727
42032	NC_004113	TGG	2	6	2269171	2269176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299727
42033	NC_004113	CCG	2	6	2269196	2269201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299727
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42038	NC_004113	TGC	2	6	2269631	2269636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299727
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42043	NC_004113	AGT	3	9	2269763	2269771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299727
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42054	NC_004113	GCT	2	6	2270620	2270625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299729
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42057	NC_004113	TGAG	2	8	2270918	2270925	25 %	25 %	50 %	0 %	22299729
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42070	NC_004113	TGC	2	6	2271617	2271622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299730
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42073	NC_004113	CAAT	2	8	2271812	2271819	50 %	25 %	0 %	25 %	22299731
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42079	NC_004113	TCAA	2	8	2272317	2272324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42100	NC_004113	GCC	2	6	2273570	2273575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299733
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42103	NC_004113	TTGC	2	8	2273748	2273755	0 %	50 %	25 %	25 %	22299733
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42108	NC_004113	CCAT	2	8	2274065	2274072	25 %	25 %	0 %	50 %	22299733
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42113	NC_004113	GTT	2	6	2274279	2274284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42114	NC_004113	ACA	2	6	2274315	2274320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42115	NC_004113	TGG	2	6	2274353	2274358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299734
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42238	NC_004113	GCA	2	6	2280206	2280211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299737
42239	NC_004113	CAA	2	6	2280269	2280274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299737
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42241	NC_004113	CCA	2	6	2280384	2280389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299737
42242	NC_004113	GAG	2	6	2280417	2280422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299737
42243	NC_004113	TCG	2	6	2280505	2280510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299737
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42245	NC_004113	GCA	2	6	2280742	2280747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299737
42246	NC_004113	GA	3	6	2280867	2280872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42247	NC_004113	GGC	2	6	2280894	2280899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42248	NC_004113	ATC	2	6	2280909	2280914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42250	NC_004113	AC	3	6	2280987	2280992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42251	NC_004113	T	8	8	2281026	2281033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42252	NC_004113	CAGG	2	8	2281043	2281050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42253	NC_004113	GCA	2	6	2281116	2281121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42254	NC_004113	TCG	2	6	2281149	2281154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42256	NC_004113	GGC	2	6	2281236	2281241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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42259	NC_004113	GGC	2	6	2281381	2281386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299738
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42266	NC_004113	TGG	2	6	2281605	2281610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299739
42267	NC_004113	GTTT	2	8	2281618	2281625	0 %	75 %	25 %	0 %	22299739
42268	NC_004113	CGG	2	6	2281630	2281635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299739
42269	NC_004113	ATG	2	6	2281669	2281674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299739
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42297	NC_004113	AGGG	2	8	2283011	2283018	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42298	NC_004113	AAT	2	6	2283072	2283077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42301	NC_004113	GAA	2	6	2283273	2283278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299742
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42308	NC_004113	CTA	2	6	2283714	2283719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299742
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42314	NC_004113	GAA	2	6	2284241	2284246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299742
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42334	NC_004113	ACC	2	6	2285324	2285329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42335	NC_004113	CAAGCA	2	12	2285349	2285360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42336	NC_004113	CGG	2	6	2285377	2285382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42337	NC_004113	TC	3	6	2285399	2285404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42338	NC_004113	GCT	2	6	2285483	2285488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42340	NC_004113	CAT	2	6	2285522	2285527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42341	NC_004113	CAAT	2	8	2285544	2285551	50 %	25 %	0 %	25 %	22299745
42342	NC_004113	ATGG	2	8	2285558	2285565	25 %	25 %	50 %	0 %	22299745
42343	NC_004113	CGC	2	6	2285627	2285632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299745
42344	NC_004113	T	6	6	2285698	2285703	0 %	100 %	0 %	0 %	22299745
42345	NC_004113	CTC	2	6	2285882	2285887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299745
42346	NC_004113	ATC	2	6	2285937	2285942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299745
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42349	NC_004113	GCT	2	6	2286147	2286152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299745
42350	NC_004113	C	6	6	2286360	2286365	0 %	0 %	0 %	100 %	22299745
42351	NC_004113	GGC	2	6	2286509	2286514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299745
42352	NC_004113	ACC	2	6	2286615	2286620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299745
42353	NC_004113	T	6	6	2286647	2286652	0 %	100 %	0 %	0 %	22299745
42354	NC_004113	GGAGC	2	10	2286671	2286680	20 %	0 %	60 %	20 %	22299745
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42478	NC_004113	CAC	2	6	2293542	2293547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299752
42479	NC_004113	CCG	2	6	2293553	2293558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299752
42480	NC_004113	TGG	2	6	2293612	2293617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299752
42481	NC_004113	CTG	2	6	2293710	2293715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299752
42482	NC_004113	TGG	2	6	2293726	2293731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299752
42483	NC_004113	TGGTG	2	10	2293738	2293747	0 %	40 %	60 %	0 %	22299752
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