MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_004113	GCG	2	6	2240056	2240061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299702
41503	NC_004113	GCA	2	6	2240099	2240104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299702
41504	NC_004113	AG	3	6	2240176	2240181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41505	NC_004113	AGA	2	6	2240261	2240266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299703
41506	NC_004113	TGG	2	6	2240284	2240289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299703
41507	NC_004113	CAG	2	6	2240453	2240458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299703
41508	NC_004113	GGT	2	6	2240642	2240647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299704
41509	NC_004113	GTG	2	6	2240676	2240681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299704
41510	NC_004113	TGGCC	2	10	2240720	2240729	0 %	20 %	40 %	40 %	22299704
41511	NC_004113	C	7	7	2240805	2240811	0 %	0 %	0 %	100 %	22299704
41512	NC_004113	G	6	6	2240938	2240943	0 %	0 %	100 %	0 %	22299704
41513	NC_004113	CAT	2	6	2241091	2241096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299704
41514	NC_004113	GGT	2	6	2241191	2241196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299704
41515	NC_004113	GCA	2	6	2241197	2241202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299704
41516	NC_004113	AAGA	2	8	2241285	2241292	75 %	0 %	25 %	0 %	22299704
41517	NC_004113	TGC	2	6	2241353	2241358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299705
41518	NC_004113	CTG	2	6	2241364	2241369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299705
41519	NC_004113	GGC	2	6	2241438	2241443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299705
41520	NC_004113	GTT	2	6	2241571	2241576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299705
41521	NC_004113	CCTA	2	8	2241686	2241693	25 %	25 %	0 %	50 %	22299705
41522	NC_004113	G	6	6	2241703	2241708	0 %	0 %	100 %	0 %	22299705
41523	NC_004113	AGCA	2	8	2241737	2241744	50 %	0 %	25 %	25 %	22299705
41524	NC_004113	ACC	2	6	2241772	2241777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299705
41525	NC_004113	CTG	2	6	2241802	2241807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299705
41526	NC_004113	TACC	2	8	2241825	2241832	25 %	25 %	0 %	50 %	22299705
41527	NC_004113	CTT	2	6	2241856	2241861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299705
41528	NC_004113	CGC	2	6	2241937	2241942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299705
41529	NC_004113	GATG	2	8	2241948	2241955	25 %	25 %	50 %	0 %	22299705
41530	NC_004113	CGA	2	6	2241986	2241991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299705
41531	NC_004113	CG	3	6	2241993	2241998	0 %	0 %	50 %	50 %	22299705
41532	NC_004113	CAC	2	6	2242059	2242064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299705
41533	NC_004113	TCT	2	6	2242089	2242094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299705
41534	NC_004113	AG	3	6	2242121	2242126	50 %	0 %	50 %	0 %	22299705
41535	NC_004113	CA	3	6	2242133	2242138	50 %	0 %	0 %	50 %	22299706
41536	NC_004113	TTC	2	6	2242254	2242259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299706
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41539	NC_004113	CGC	2	6	2242360	2242365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299706
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41541	NC_004113	CGC	2	6	2242422	2242427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299706
41542	NC_004113	TCC	2	6	2242456	2242461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299706
41543	NC_004113	TTGA	3	12	2242476	2242487	25 %	50 %	25 %	0 %	22299706
41544	NC_004113	AAC	2	6	2242698	2242703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299706
41545	NC_004113	ATA	2	6	2242770	2242775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299706
41546	NC_004113	AG	3	6	2242887	2242892	50 %	0 %	50 %	0 %	22299706
41547	NC_004113	CCCACG	2	12	2242894	2242905	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22299706
41548	NC_004113	GGAT	2	8	2242906	2242913	25 %	25 %	50 %	0 %	22299706
41549	NC_004113	ATGA	2	8	2242993	2243000	50 %	25 %	25 %	0 %	22299706
41550	NC_004113	CAG	2	6	2243062	2243067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41551	NC_004113	AAAC	2	8	2243121	2243128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41552	NC_004113	ACT	2	6	2243235	2243240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299707
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41554	NC_004113	GGC	2	6	2243333	2243338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299707
41555	NC_004113	GGT	2	6	2243499	2243504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299707
41556	NC_004113	AAG	2	6	2243511	2243516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299707
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41565	NC_004113	A	6	6	2244099	2244104	100 %	0 %	0 %	0 %	22299707
41566	NC_004113	CTA	2	6	2244113	2244118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299707
41567	NC_004113	AAAG	2	8	2244143	2244150	75 %	0 %	25 %	0 %	22299707
41568	NC_004113	AGT	2	6	2244289	2244294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299707
41569	NC_004113	GAA	2	6	2244307	2244312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41570	NC_004113	A	7	7	2244311	2244317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41571	NC_004113	TTC	2	6	2244328	2244333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41572	NC_004113	GGC	2	6	2244465	2244470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299708
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41579	NC_004113	ATCT	2	8	2244721	2244728	25 %	50 %	0 %	25 %	22299708
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41584	NC_004113	TAC	2	6	2244904	2244909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299708
41585	NC_004113	GGGC	2	8	2244935	2244942	0 %	0 %	75 %	25 %	22299708
41586	NC_004113	TGGT	2	8	2244947	2244954	0 %	50 %	50 %	0 %	22299708
41587	NC_004113	TTG	2	6	2245151	2245156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299708
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41590	NC_004113	GCC	2	6	2245349	2245354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299708
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41593	NC_004113	T	6	6	2245463	2245468	0 %	100 %	0 %	0 %	22299709
41594	NC_004113	GCT	2	6	2245482	2245487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299709
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41602	NC_004113	GCT	2	6	2245704	2245709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299709
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41605	NC_004113	TTG	2	6	2245843	2245848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299709
41606	NC_004113	CG	3	6	2245888	2245893	0 %	0 %	50 %	50 %	22299709
41607	NC_004113	TGGG	2	8	2245979	2245986	0 %	25 %	75 %	0 %	22299709
41608	NC_004113	T	6	6	2246073	2246078	0 %	100 %	0 %	0 %	22299709
41609	NC_004113	TGCAGC	2	12	2246205	2246216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299709
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41613	NC_004113	A	6	6	2246351	2246356	100 %	0 %	0 %	0 %	22299710
41614	NC_004113	GCTG	2	8	2246357	2246364	0 %	25 %	50 %	25 %	22299710
41615	NC_004113	TAC	2	6	2246385	2246390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299710
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41619	NC_004113	AAACC	2	10	2246628	2246637	60 %	0 %	0 %	40 %	22299710
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41857	NC_004113	CTG	2	6	2258844	2258849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299718
41858	NC_004113	CGG	2	6	2258910	2258915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299718
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41926	NC_004113	AGGG	2	8	2263134	2263141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41927	NC_004113	AAT	2	6	2263195	2263200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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