MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_004113	T	6	6	2214490	2214495	0 %	100 %	0 %	0 %	22299672
41003	NC_004113	GCC	2	6	2214584	2214589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299672
41004	NC_004113	CAA	2	6	2214686	2214691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299672
41005	NC_004113	ATT	2	6	2214725	2214730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299672
41006	NC_004113	CTG	2	6	2214785	2214790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299672
41007	NC_004113	GTG	2	6	2214834	2214839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299672
41008	NC_004113	GAG	2	6	2214947	2214952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299672
41009	NC_004113	TGC	2	6	2214976	2214981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299672
41010	NC_004113	CGG	2	6	2215063	2215068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299672
41011	NC_004113	GCG	2	6	2215216	2215221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299672
41012	NC_004113	GTT	2	6	2215225	2215230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299672
41013	NC_004113	GGGTT	3	15	2215294	2215308	0 %	40 %	60 %	0 %	22299673
41014	NC_004113	AGTA	2	8	2215360	2215367	50 %	25 %	25 %	0 %	22299673
41015	NC_004113	TGC	2	6	2215374	2215379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299673
41016	NC_004113	TGT	2	6	2215380	2215385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299673
41017	NC_004113	CAG	2	6	2215390	2215395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299673
41018	NC_004113	TGC	2	6	2215547	2215552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299673
41019	NC_004113	TGGCG	2	10	2215607	2215616	0 %	20 %	60 %	20 %	22299673
41020	NC_004113	TTA	2	6	2215720	2215725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41021	NC_004113	CACATA	2	12	2215726	2215737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41022	NC_004113	AGCT	2	8	2215740	2215747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41023	NC_004113	A	6	6	2215753	2215758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41024	NC_004113	A	6	6	2215842	2215847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41025	NC_004113	TCA	2	6	2215883	2215888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299674
41026	NC_004113	CAT	2	6	2215950	2215955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299674
41027	NC_004113	ACT	2	6	2215968	2215973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299674
41028	NC_004113	GCC	2	6	2216024	2216029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41029	NC_004113	A	6	6	2216042	2216047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41030	NC_004113	TTCT	2	8	2216076	2216083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41031	NC_004113	TGG	2	6	2216094	2216099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41032	NC_004113	TAATT	2	10	2216112	2216121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41033	NC_004113	TCT	2	6	2216139	2216144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41034	NC_004113	CAA	2	6	2216196	2216201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41035	NC_004113	CTT	2	6	2216217	2216222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41036	NC_004113	CTAACG	2	12	2216234	2216245	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41037	NC_004113	CGA	2	6	2216280	2216285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41038	NC_004113	CGA	2	6	2216315	2216320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41039	NC_004113	AAC	2	6	2216350	2216355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41040	NC_004113	CAC	2	6	2216373	2216378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41041	NC_004113	CCA	2	6	2216427	2216432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41042	NC_004113	ATG	2	6	2216498	2216503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299675
41043	NC_004113	CCAA	2	8	2216531	2216538	50 %	0 %	0 %	50 %	22299675
41044	NC_004113	ACA	2	6	2216572	2216577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299675
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41046	NC_004113	TCA	2	6	2216696	2216701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299675
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41050	NC_004113	CGT	2	6	2216956	2216961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299675
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41053	NC_004113	ATCA	2	8	2217073	2217080	50 %	25 %	0 %	25 %	22299675
41054	NC_004113	CGG	2	6	2217186	2217191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299675
41055	NC_004113	TTA	2	6	2217239	2217244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299675
41056	NC_004113	CAG	2	6	2217317	2217322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41057	NC_004113	AG	3	6	2217321	2217326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41058	NC_004113	G	6	6	2217330	2217335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41059	NC_004113	GCT	2	6	2217357	2217362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41061	NC_004113	TTC	2	6	2217470	2217475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41062	NC_004113	CTG	2	6	2217477	2217482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41063	NC_004113	ACA	2	6	2217666	2217671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41064	NC_004113	GCA	2	6	2217686	2217691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41066	NC_004113	GTT	2	6	2217752	2217757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41067	NC_004113	CGG	2	6	2217785	2217790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299676
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41069	NC_004113	TGA	2	6	2217824	2217829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299676
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41092	NC_004113	T	7	7	2219429	2219435	0 %	100 %	0 %	0 %	22299678
41093	NC_004113	GTGG	2	8	2219460	2219467	0 %	25 %	75 %	0 %	22299678
41094	NC_004113	AGC	2	6	2219517	2219522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299678
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41105	NC_004113	CGT	2	6	2220093	2220098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299679
41106	NC_004113	CCTG	2	8	2220123	2220130	0 %	25 %	25 %	50 %	22299679
41107	NC_004113	G	6	6	2220232	2220237	0 %	0 %	100 %	0 %	22299679
41108	NC_004113	CCAT	2	8	2220291	2220298	25 %	25 %	0 %	50 %	22299679
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41112	NC_004113	A	6	6	2220449	2220454	100 %	0 %	0 %	0 %	22299679
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41120	NC_004113	CAC	2	6	2220894	2220899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299680
41121	NC_004113	TCT	2	6	2220953	2220958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299680
41122	NC_004113	GCG	2	6	2221017	2221022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299680
41123	NC_004113	CTC	2	6	2221026	2221031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299680
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41130	NC_004113	GC	3	6	2221357	2221362	0 %	0 %	50 %	50 %	22299680
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41134	NC_004113	CTAT	2	8	2221703	2221710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41135	NC_004113	CGA	2	6	2221763	2221768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41139	NC_004113	TTA	2	6	2221926	2221931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41140	NC_004113	GAGT	2	8	2222024	2222031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41141	NC_004113	TTAT	2	8	2222065	2222072	25 %	75 %	0 %	0 %	22299681
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41221	NC_004113	GCCTT	2	10	2225797	2225806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41222	NC_004113	T	6	6	2225823	2225828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41227	NC_004113	TGGCG	2	10	2226063	2226072	0 %	20 %	60 %	20 %	22299689
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41233	NC_004113	T	6	6	2226186	2226191	0 %	100 %	0 %	0 %	22299689
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41240	NC_004113	CTC	2	6	2226621	2226626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299689
41241	NC_004113	T	6	6	2226660	2226665	0 %	100 %	0 %	0 %	22299689
41242	NC_004113	GCC	2	6	2226722	2226727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299689
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41244	NC_004113	CTG	2	6	2226888	2226893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299689
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41308	NC_004113	GCG	2	6	2230204	2230209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299692
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41312	NC_004113	GC	3	6	2230261	2230266	0 %	0 %	50 %	50 %	22299692
41313	NC_004113	GTA	2	6	2230311	2230316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299692
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41329	NC_004113	GCGG	2	8	2231028	2231035	0 %	0 %	75 %	25 %	22299693
41330	NC_004113	TG	3	6	2231071	2231076	0 %	50 %	50 %	0 %	22299693
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41354	NC_004113	ATT	2	6	2232462	2232467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41355	NC_004113	TGC	2	6	2232536	2232541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41356	NC_004113	C	6	6	2232574	2232579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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41358	NC_004113	GCA	2	6	2232641	2232646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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