MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_004113	GT	3	6	2161322	2161327	0 %	50 %	50 %	0 %	22299623
40002	NC_004113	AG	3	6	2161386	2161391	50 %	0 %	50 %	0 %	22299623
40003	NC_004113	AGC	3	9	2161414	2161422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299623
40004	NC_004113	GCG	2	6	2161456	2161461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299623
40005	NC_004113	GCA	2	6	2161473	2161478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299623
40006	NC_004113	AGC	2	6	2161547	2161552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299623
40007	NC_004113	GCA	2	6	2161671	2161676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299623
40008	NC_004113	TTG	2	6	2161721	2161726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299623
40009	NC_004113	GAT	2	6	2161795	2161800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299623
40010	NC_004113	GCTTG	2	10	2161835	2161844	0 %	40 %	40 %	20 %	22299623
40011	NC_004113	TGC	2	6	2161856	2161861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299623
40012	NC_004113	GGC	2	6	2161884	2161889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299623
40013	NC_004113	TGC	2	6	2161892	2161897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299623
40014	NC_004113	TC	3	6	2161968	2161973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40015	NC_004113	AGGG	2	8	2162029	2162036	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40016	NC_004113	AAC	2	6	2162078	2162083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299624
40017	NC_004113	GCA	2	6	2162108	2162113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299624
40018	NC_004113	TGGT	2	8	2162131	2162138	0 %	50 %	50 %	0 %	22299624
40019	NC_004113	CTC	2	6	2162172	2162177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299624
40020	NC_004113	CTG	2	6	2162226	2162231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299624
40021	NC_004113	CTC	2	6	2162238	2162243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299624
40022	NC_004113	CTG	2	6	2162382	2162387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299624
40023	NC_004113	CAC	2	6	2162407	2162412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299624
40024	NC_004113	GAA	2	6	2162445	2162450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299624
40025	NC_004113	CCCTCC	2	12	2162476	2162487	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	22299624
40026	NC_004113	TGG	2	6	2162584	2162589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299624
40027	NC_004113	GCA	2	6	2162709	2162714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299624
40028	NC_004113	GCA	2	6	2162717	2162722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299624
40029	NC_004113	GCT	2	6	2162921	2162926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299624
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40031	NC_004113	G	6	6	2163106	2163111	0 %	0 %	100 %	0 %	22299625
40032	NC_004113	CTGGGG	2	12	2163212	2163223	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22299625
40033	NC_004113	GTG	2	6	2163378	2163383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299625
40034	NC_004113	TGAG	2	8	2163393	2163400	25 %	25 %	50 %	0 %	22299625
40035	NC_004113	CTG	2	6	2163432	2163437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299625
40036	NC_004113	G	7	7	2163443	2163449	0 %	0 %	100 %	0 %	22299625
40037	NC_004113	AGC	2	6	2163485	2163490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299625
40038	NC_004113	TGGCG	2	10	2163579	2163588	0 %	20 %	60 %	20 %	22299625
40039	NC_004113	GCG	3	9	2163691	2163699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299625
40040	NC_004113	GAT	2	6	2163755	2163760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299625
40041	NC_004113	CTG	2	6	2163851	2163856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299625
40042	NC_004113	TGA	2	6	2163870	2163875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299625
40043	NC_004113	GCG	2	6	2163949	2163954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299625
40044	NC_004113	G	7	7	2164016	2164022	0 %	0 %	100 %	0 %	22299625
40045	NC_004113	CTCA	2	8	2164043	2164050	25 %	25 %	0 %	50 %	22299625
40046	NC_004113	GAA	2	6	2164076	2164081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299625
40047	NC_004113	CGT	2	6	2164127	2164132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299625
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40049	NC_004113	TGAT	2	8	2164158	2164165	25 %	50 %	25 %	0 %	22299625
40050	NC_004113	CTC	2	6	2164184	2164189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299625
40051	NC_004113	GC	3	6	2164199	2164204	0 %	0 %	50 %	50 %	22299625
40052	NC_004113	GCT	2	6	2164345	2164350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299625
40053	NC_004113	GCA	2	6	2164351	2164356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299625
40054	NC_004113	AGTG	2	8	2164423	2164430	25 %	25 %	50 %	0 %	22299625
40055	NC_004113	TGG	2	6	2164437	2164442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299625
40056	NC_004113	CTG	3	9	2164451	2164459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299625
40057	NC_004113	GTT	2	6	2164482	2164487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299626
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40059	NC_004113	GCT	2	6	2164977	2164982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299627
40060	NC_004113	AAGG	2	8	2164989	2164996	50 %	0 %	50 %	0 %	22299627
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40064	NC_004113	GCA	2	6	2165070	2165075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299627
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40066	NC_004113	AAT	2	6	2165143	2165148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299627
40067	NC_004113	GTTT	2	8	2165170	2165177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40068	NC_004113	ATT	2	6	2165207	2165212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40069	NC_004113	ATT	3	9	2165262	2165270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40070	NC_004113	AAC	2	6	2165379	2165384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40071	NC_004113	TAT	2	6	2165396	2165401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40072	NC_004113	AAC	2	6	2165403	2165408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40073	NC_004113	GGA	2	6	2165422	2165427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40074	NC_004113	CTGTAA	2	12	2165525	2165536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40075	NC_004113	CAT	2	6	2165553	2165558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40079	NC_004113	CAAAT	2	10	2165834	2165843	60 %	20 %	0 %	20 %	22299628
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40086	NC_004113	ACC	2	6	2166250	2166255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299628
40087	NC_004113	CCT	2	6	2166285	2166290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299628
40088	NC_004113	TGG	2	6	2166320	2166325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299628
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40090	NC_004113	TGGT	2	8	2166695	2166702	0 %	50 %	50 %	0 %	22299628
40091	NC_004113	CCA	2	6	2166746	2166751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299628
40092	NC_004113	TTCC	2	8	2166762	2166769	0 %	50 %	0 %	50 %	22299628
40093	NC_004113	GCC	2	6	2166872	2166877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299628
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40096	NC_004113	CAGC	2	8	2166980	2166987	25 %	0 %	25 %	50 %	22299628
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40099	NC_004113	AACC	2	8	2167158	2167165	50 %	0 %	0 %	50 %	22299628
40100	NC_004113	GAA	2	6	2167200	2167205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299628
40101	NC_004113	C	6	6	2167214	2167219	0 %	0 %	0 %	100 %	22299628
40102	NC_004113	GCTGA	2	10	2167243	2167252	20 %	20 %	40 %	20 %	22299628
40103	NC_004113	GGC	2	6	2167266	2167271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299628
40104	NC_004113	GGC	2	6	2167329	2167334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299628
40105	NC_004113	CTC	2	6	2167352	2167357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299628
40106	NC_004113	TGG	2	6	2167436	2167441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299628
40107	NC_004113	TGC	2	6	2167505	2167510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299628
40108	NC_004113	C	6	6	2167540	2167545	0 %	0 %	0 %	100 %	22299628
40109	NC_004113	TGG	3	9	2167547	2167555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299628
40110	NC_004113	G	6	6	2167607	2167612	0 %	0 %	100 %	0 %	22299628
40111	NC_004113	CAAA	2	8	2167749	2167756	75 %	0 %	0 %	25 %	22299628
40112	NC_004113	CTGGC	2	10	2167895	2167904	0 %	20 %	40 %	40 %	22299628
40113	NC_004113	TCAA	2	8	2167916	2167923	50 %	25 %	0 %	25 %	22299628
40114	NC_004113	GAT	2	6	2167939	2167944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299628
40115	NC_004113	GTG	2	6	2167999	2168004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299628
40116	NC_004113	GCG	2	6	2168064	2168069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299628
40117	NC_004113	CGC	2	6	2168169	2168174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299628
40118	NC_004113	GCAGTT	2	12	2168208	2168219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22299628
40119	NC_004113	ATGA	2	8	2168221	2168228	50 %	25 %	25 %	0 %	22299628
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40160	NC_004113	TACA	2	8	2170299	2170306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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40232	NC_004113	ACTGC	2	10	2174206	2174215	20 %	20 %	20 %	40 %	22299634
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