MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_004113	AGC	2	6	2103989	2103994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39002	NC_004113	ATT	2	6	2104128	2104133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299562
39003	NC_004113	GGC	2	6	2104262	2104267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299562
39004	NC_004113	TCC	2	6	2104304	2104309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299562
39005	NC_004113	CCG	2	6	2104314	2104319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299562
39006	NC_004113	GGGT	2	8	2104320	2104327	0 %	25 %	75 %	0 %	22299562
39007	NC_004113	G	7	7	2104504	2104510	0 %	0 %	100 %	0 %	22299562
39008	NC_004113	TGG	2	6	2104515	2104520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299562
39009	NC_004113	GGCAA	2	10	2104577	2104586	40 %	0 %	40 %	20 %	22299562
39010	NC_004113	GCG	2	6	2104625	2104630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299562
39011	NC_004113	G	6	6	2104650	2104655	0 %	0 %	100 %	0 %	22299562
39012	NC_004113	TCC	2	6	2104671	2104676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299562
39013	NC_004113	TGA	2	6	2104682	2104687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299562
39014	NC_004113	AGC	2	6	2104709	2104714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299562
39015	NC_004113	GAC	2	6	2104928	2104933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299562
39016	NC_004113	CTC	2	6	2105105	2105110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299562
39017	NC_004113	TTG	2	6	2105169	2105174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299563
39018	NC_004113	CTG	2	6	2105220	2105225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299563
39019	NC_004113	GGC	2	6	2105416	2105421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299563
39020	NC_004113	TCC	2	6	2105518	2105523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299563
39021	NC_004113	AGA	2	6	2105536	2105541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299563
39022	NC_004113	CTG	2	6	2105612	2105617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299563
39023	NC_004113	GTG	2	6	2105622	2105627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299563
39024	NC_004113	AGCCTC	2	12	2105717	2105728	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22299563
39025	NC_004113	G	6	6	2105899	2105904	0 %	0 %	100 %	0 %	22299563
39026	NC_004113	CTT	2	6	2106022	2106027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299563
39027	NC_004113	CAC	2	6	2106030	2106035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299563
39028	NC_004113	TGA	2	6	2106085	2106090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299563
39029	NC_004113	C	6	6	2106114	2106119	0 %	0 %	0 %	100 %	22299563
39030	NC_004113	CGC	3	9	2106125	2106133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299563
39031	NC_004113	GAT	2	6	2106260	2106265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299563
39032	NC_004113	TGG	2	6	2106277	2106282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299563
39033	NC_004113	GCA	2	6	2106297	2106302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299563
39034	NC_004113	AGGG	2	8	2106357	2106364	25 %	0 %	75 %	0 %	22299563
39035	NC_004113	CAC	2	6	2106368	2106373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299563
39036	NC_004113	CCT	2	6	2106400	2106405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299563
39037	NC_004113	T	6	6	2106417	2106422	0 %	100 %	0 %	0 %	22299563
39038	NC_004113	GGC	2	6	2106577	2106582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299564
39039	NC_004113	ACT	2	6	2106614	2106619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299564
39040	NC_004113	TCC	2	6	2106623	2106628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299564
39041	NC_004113	CCA	2	6	2106653	2106658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299564
39042	NC_004113	CCA	3	9	2106702	2106710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299564
39043	NC_004113	CGAC	2	8	2106947	2106954	25 %	0 %	25 %	50 %	22299564
39044	NC_004113	GAT	2	6	2106961	2106966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299564
39045	NC_004113	CTC	2	6	2106988	2106993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299564
39046	NC_004113	GCGATC	2	12	2107030	2107041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299564
39047	NC_004113	AGC	2	6	2107088	2107093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299564
39048	NC_004113	CTG	2	6	2107105	2107110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299564
39049	NC_004113	AACCA	2	10	2107173	2107182	60 %	0 %	0 %	40 %	22299564
39050	NC_004113	AAT	2	6	2107258	2107263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299564
39051	NC_004113	GAC	2	6	2107323	2107328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299564
39052	NC_004113	GCT	2	6	2107329	2107334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299564
39053	NC_004113	GGC	2	6	2107335	2107340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299564
39054	NC_004113	GCG	2	6	2107345	2107350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299564
39055	NC_004113	AGTG	2	8	2107475	2107482	25 %	25 %	50 %	0 %	22299564
39056	NC_004113	CAA	2	6	2107501	2107506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299564
39057	NC_004113	GCC	2	6	2107523	2107528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299564
39058	NC_004113	TGGC	2	8	2107592	2107599	0 %	25 %	50 %	25 %	22299564
39059	NC_004113	ATG	2	6	2107805	2107810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299565
39060	NC_004113	CG	3	6	2107823	2107828	0 %	0 %	50 %	50 %	22299565
39061	NC_004113	TCTT	2	8	2107857	2107864	0 %	75 %	0 %	25 %	22299565
39062	NC_004113	GGA	2	6	2107904	2107909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299565
39063	NC_004113	GGT	2	6	2108059	2108064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299565
39064	NC_004113	CTC	2	6	2108082	2108087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299565
39065	NC_004113	CGA	2	6	2108117	2108122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299566
39066	NC_004113	A	6	6	2108209	2108214	100 %	0 %	0 %	0 %	22299566
39067	NC_004113	AC	3	6	2108240	2108245	50 %	0 %	0 %	50 %	22299566
39068	NC_004113	CCA	2	6	2108316	2108321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299566
39069	NC_004113	GAT	2	6	2108380	2108385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299566
39070	NC_004113	AGC	2	6	2108441	2108446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299566
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39072	NC_004113	CAAG	2	8	2108529	2108536	50 %	0 %	25 %	25 %	22299566
39073	NC_004113	TCA	2	6	2108637	2108642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299567
39074	NC_004113	GCC	2	6	2108716	2108721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299567
39075	NC_004113	AGA	2	6	2108854	2108859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299567
39076	NC_004113	CAG	2	6	2108997	2109002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39077	NC_004113	TTG	2	6	2109200	2109205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299568
39078	NC_004113	CGG	2	6	2109230	2109235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299568
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39082	NC_004113	ATTG	2	8	2109471	2109478	25 %	50 %	25 %	0 %	22299569
39083	NC_004113	CAC	2	6	2109591	2109596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299569
39084	NC_004113	GAA	2	6	2109604	2109609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299569
39085	NC_004113	CAG	2	6	2109721	2109726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299569
39086	NC_004113	TGG	2	6	2109872	2109877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299569
39087	NC_004113	TGG	3	9	2109896	2109904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299569
39088	NC_004113	ATC	2	6	2109955	2109960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299569
39089	NC_004113	CAGT	2	8	2110053	2110060	25 %	25 %	25 %	25 %	22299569
39090	NC_004113	TGC	2	6	2110061	2110066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299569
39091	NC_004113	CAGTGT	2	12	2110068	2110079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22299569
39092	NC_004113	GTC	2	6	2110118	2110123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299569
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39094	NC_004113	AATG	2	8	2110167	2110174	50 %	25 %	25 %	0 %	22299569
39095	NC_004113	TGC	2	6	2110179	2110184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299569
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39097	NC_004113	CCAC	2	8	2110271	2110278	25 %	0 %	0 %	75 %	22299569
39098	NC_004113	GCC	2	6	2110302	2110307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299569
39099	NC_004113	TC	3	6	2110353	2110358	0 %	50 %	0 %	50 %	22299569
39100	NC_004113	CGG	2	6	2110379	2110384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299569
39101	NC_004113	GT	3	6	2110443	2110448	0 %	50 %	50 %	0 %	22299569
39102	NC_004113	ATG	2	6	2110456	2110461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299569
39103	NC_004113	GTT	2	6	2110578	2110583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299570
39104	NC_004113	G	7	7	2110623	2110629	0 %	0 %	100 %	0 %	22299570
39105	NC_004113	ATGCC	2	10	2110789	2110798	20 %	20 %	20 %	40 %	22299570
39106	NC_004113	CCA	2	6	2110840	2110845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299570
39107	NC_004113	AGT	2	6	2110858	2110863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299570
39108	NC_004113	C	6	6	2110940	2110945	0 %	0 %	0 %	100 %	22299570
39109	NC_004113	GGC	2	6	2110961	2110966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299570
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39111	NC_004113	GC	3	6	2111171	2111176	0 %	0 %	50 %	50 %	22299570
39112	NC_004113	CAG	2	6	2111208	2111213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299570
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39118	NC_004113	CGC	2	6	2111468	2111473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299570
39119	NC_004113	CTC	2	6	2111505	2111510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299570
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39138	NC_004113	GTA	2	6	2112589	2112594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39235	NC_004113	A	7	7	2117514	2117520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39236	NC_004113	CAC	2	6	2117538	2117543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299577
39237	NC_004113	GGC	2	6	2117640	2117645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299577
39238	NC_004113	CAATGC	2	12	2117655	2117666	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22299577
39239	NC_004113	AGC	2	6	2117708	2117713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299577
39240	NC_004113	CGG	2	6	2117730	2117735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299577
39241	NC_004113	CGC	2	6	2117752	2117757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299577
39242	NC_004113	ACT	2	6	2117783	2117788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299577
39243	NC_004113	GGATGT	2	12	2117823	2117834	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22299577
39244	NC_004113	GCT	2	6	2117953	2117958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299577
39245	NC_004113	AGC	2	6	2117984	2117989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299577
39246	NC_004113	GCC	2	6	2118005	2118010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299577
39247	NC_004113	AGTGA	2	10	2118016	2118025	40 %	20 %	40 %	0 %	22299577
39248	NC_004113	AGA	2	6	2118055	2118060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39249	NC_004113	GCA	2	6	2118115	2118120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39250	NC_004113	TGA	2	6	2118122	2118127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299578
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39253	NC_004113	TGC	2	6	2118353	2118358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299578
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39264	NC_004113	CGC	2	6	2119282	2119287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299579
39265	NC_004113	C	7	7	2119309	2119315	0 %	0 %	0 %	100 %	22299579
39266	NC_004113	ATC	2	6	2119354	2119359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299579
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39268	NC_004113	CTG	2	6	2119655	2119660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299580
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39274	NC_004113	GTG	2	6	2119958	2119963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299580
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39276	NC_004113	GT	3	6	2120097	2120102	0 %	50 %	50 %	0 %	22299580
39277	NC_004113	TGG	2	6	2120158	2120163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299580
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39321	NC_004113	AGCG	2	8	2122893	2122900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39322	NC_004113	CAAAA	2	10	2122910	2122919	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39323	NC_004113	TGTC	2	8	2122958	2122965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39324	NC_004113	CTC	2	6	2122998	2123003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39325	NC_004113	TGG	2	6	2123027	2123032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39326	NC_004113	TAA	2	6	2123066	2123071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39330	NC_004113	GTT	2	6	2123484	2123489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299584
39331	NC_004113	CGA	2	6	2123522	2123527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299584
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39341	NC_004113	CTGGC	2	10	2123971	2123980	0 %	20 %	40 %	40 %	22299585
39342	NC_004113	TGC	2	6	2124002	2124007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299585
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39345	NC_004113	CAC	2	6	2124312	2124317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299585
39346	NC_004113	CAA	2	6	2124463	2124468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299585
39347	NC_004113	GCT	2	6	2124783	2124788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299586
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39350	NC_004113	CG	3	6	2125009	2125014	0 %	0 %	50 %	50 %	22299586
39351	NC_004113	GGT	2	6	2125037	2125042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299586
39352	NC_004113	G	6	6	2125043	2125048	0 %	0 %	100 %	0 %	22299586
39353	NC_004113	CTG	2	6	2125148	2125153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299586
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39472	NC_004113	CGC	2	6	2132199	2132204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299593
39473	NC_004113	CA	3	6	2132220	2132225	50 %	0 %	0 %	50 %	22299593
39474	NC_004113	A	6	6	2132284	2132289	100 %	0 %	0 %	0 %	22299593
39475	NC_004113	AAT	2	6	2132330	2132335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299593
39476	NC_004113	AACCC	2	10	2132355	2132364	40 %	0 %	0 %	60 %	22299593
39477	NC_004113	TGG	2	6	2132446	2132451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299593
39478	NC_004113	CTT	2	6	2132533	2132538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299593
39479	NC_004113	A	7	7	2132540	2132546	100 %	0 %	0 %	0 %	22299593
39480	NC_004113	G	6	6	2132551	2132556	0 %	0 %	100 %	0 %	22299593
39481	NC_004113	CGC	2	6	2132561	2132566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299593
39482	NC_004113	CTTGG	2	10	2132600	2132609	0 %	40 %	40 %	20 %	22299593
39483	NC_004113	GGCAAG	2	12	2132768	2132779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22299593
39484	NC_004113	GCG	2	6	2132849	2132854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299593
39485	NC_004113	G	6	6	2132903	2132908	0 %	0 %	100 %	0 %	22299593
39486	NC_004113	GCA	2	6	2132937	2132942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299593
39487	NC_004113	CTG	2	6	2133017	2133022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299593
39488	NC_004113	TCA	2	6	2133042	2133047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299593
39489	NC_004113	GGC	2	6	2133066	2133071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299593
39490	NC_004113	CGGC	2	8	2133088	2133095	0 %	0 %	50 %	50 %	22299593
39491	NC_004113	AGC	2	6	2133248	2133253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299594
39492	NC_004113	GCT	2	6	2133486	2133491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299594
39493	NC_004113	C	8	8	2133508	2133515	0 %	0 %	0 %	100 %	22299594
39494	NC_004113	GAT	2	6	2133524	2133529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299594
39495	NC_004113	CTG	2	6	2133605	2133610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299594
39496	NC_004113	CAG	2	6	2133646	2133651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299594
39497	NC_004113	ACT	2	6	2133680	2133685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299594
39498	NC_004113	CAA	2	6	2133773	2133778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299594
39499	NC_004113	CAG	2	6	2133779	2133784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299594
39500	NC_004113	CAT	2	6	2133808	2133813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299594

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