MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_004113	CTG	2	6	2050137	2050142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299512
38003	NC_004113	GGC	2	6	2050149	2050154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299512
38004	NC_004113	GCG	2	6	2050261	2050266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299512
38005	NC_004113	ACC	2	6	2050424	2050429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299512
38006	NC_004113	GCAT	2	8	2050616	2050623	25 %	25 %	25 %	25 %	22299512
38007	NC_004113	AAG	2	6	2050630	2050635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299513
38008	NC_004113	GGTC	2	8	2050769	2050776	0 %	25 %	50 %	25 %	22299513
38009	NC_004113	CCA	2	6	2050795	2050800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299513
38010	NC_004113	AGC	2	6	2050854	2050859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299513
38011	NC_004113	CAA	2	6	2050885	2050890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299513
38012	NC_004113	GAG	2	6	2050919	2050924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299513
38013	NC_004113	CGG	2	6	2050982	2050987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299513
38014	NC_004113	CTGA	2	8	2050990	2050997	25 %	25 %	25 %	25 %	22299513
38015	NC_004113	GGT	2	6	2051060	2051065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299513
38016	NC_004113	ATTC	2	8	2051089	2051096	25 %	50 %	0 %	25 %	22299513
38017	NC_004113	TAA	2	6	2051166	2051171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38018	NC_004113	CTCC	2	8	2051256	2051263	0 %	25 %	0 %	75 %	22299514
38019	NC_004113	CAC	2	6	2051279	2051284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299514
38020	NC_004113	TTGC	2	8	2051339	2051346	0 %	50 %	25 %	25 %	22299514
38021	NC_004113	CAA	2	6	2051383	2051388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299514
38022	NC_004113	GGGT	2	8	2051404	2051411	0 %	25 %	75 %	0 %	22299514
38023	NC_004113	CG	3	6	2051413	2051418	0 %	0 %	50 %	50 %	22299514
38024	NC_004113	ACAGGG	2	12	2051419	2051430	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22299514
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38026	NC_004113	CAC	2	6	2051552	2051557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299514
38027	NC_004113	AGGT	2	8	2051610	2051617	25 %	25 %	50 %	0 %	22299514
38028	NC_004113	CTC	2	6	2051639	2051644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299514
38029	NC_004113	AGC	2	6	2051775	2051780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299514
38030	NC_004113	CCG	2	6	2051797	2051802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299514
38031	NC_004113	TCA	3	9	2051814	2051822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299514
38032	NC_004113	GCG	2	6	2051825	2051830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299514
38033	NC_004113	TGC	2	6	2051931	2051936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299514
38034	NC_004113	ACC	2	6	2051988	2051993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299514
38035	NC_004113	AAG	2	6	2052092	2052097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299514
38036	NC_004113	TCA	2	6	2052112	2052117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299514
38037	NC_004113	ATCGCG	2	12	2052191	2052202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299514
38038	NC_004113	C	7	7	2052236	2052242	0 %	0 %	0 %	100 %	22299514
38039	NC_004113	TCAA	2	8	2052288	2052295	50 %	25 %	0 %	25 %	22299514
38040	NC_004113	AAT	2	6	2052320	2052325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299514
38041	NC_004113	T	6	6	2052325	2052330	0 %	100 %	0 %	0 %	22299514
38042	NC_004113	GCT	2	6	2052376	2052381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299514
38043	NC_004113	CAG	2	6	2052466	2052471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299514
38044	NC_004113	T	6	6	2052523	2052528	0 %	100 %	0 %	0 %	22299514
38045	NC_004113	AGG	2	6	2052573	2052578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299514
38046	NC_004113	TCG	2	6	2052621	2052626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299514
38047	NC_004113	C	7	7	2052816	2052822	0 %	0 %	0 %	100 %	22299515
38048	NC_004113	AC	3	6	2052867	2052872	50 %	0 %	0 %	50 %	22299515
38049	NC_004113	AG	3	6	2052949	2052954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38050	NC_004113	A	6	6	2052974	2052979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38051	NC_004113	TGC	2	6	2053085	2053090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38052	NC_004113	GATA	2	8	2053131	2053138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38053	NC_004113	AAG	2	6	2053266	2053271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299516
38054	NC_004113	GCGCC	2	10	2053285	2053294	0 %	0 %	40 %	60 %	22299516
38055	NC_004113	CGTC	2	8	2053345	2053352	0 %	25 %	25 %	50 %	22299516
38056	NC_004113	TGG	2	6	2053428	2053433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299516
38057	NC_004113	ACC	2	6	2053474	2053479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299516
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38059	NC_004113	TGG	2	6	2053581	2053586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299516
38060	NC_004113	CGC	2	6	2053606	2053611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299516
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38062	NC_004113	CAAA	2	8	2053636	2053643	75 %	0 %	0 %	25 %	22299516
38063	NC_004113	ATT	2	6	2053742	2053747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299516
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38067	NC_004113	TGG	3	9	2053836	2053844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299516
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38069	NC_004113	CT	3	6	2053956	2053961	0 %	50 %	0 %	50 %	22299516
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38071	NC_004113	TGA	2	6	2054170	2054175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299516
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38091	NC_004113	CGG	2	6	2055158	2055163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299517
38092	NC_004113	GGT	2	6	2055175	2055180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299517
38093	NC_004113	CCCAA	2	10	2055382	2055391	40 %	0 %	0 %	60 %	22299517
38094	NC_004113	CTG	2	6	2055452	2055457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299517
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38102	NC_004113	CGAA	2	8	2056143	2056150	50 %	0 %	25 %	25 %	22299517
38103	NC_004113	TTC	2	6	2056309	2056314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38104	NC_004113	GCC	2	6	2056363	2056368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299518
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38109	NC_004113	AATT	2	8	2056694	2056701	50 %	50 %	0 %	0 %	22299518
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38118	NC_004113	GGC	2	6	2056920	2056925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299518
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38120	NC_004113	TAA	2	6	2056996	2057001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299518
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38241	NC_004113	C	6	6	2064029	2064034	0 %	0 %	0 %	100 %	22299522
38242	NC_004113	GTG	2	6	2064146	2064151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299522
38243	NC_004113	CAA	2	6	2064185	2064190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299522
38244	NC_004113	TTGAGC	2	12	2064217	2064228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22299522
38245	NC_004113	TTC	2	6	2064475	2064480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299522
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38247	NC_004113	AGG	2	6	2064605	2064610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299522
38248	NC_004113	GGC	2	6	2064670	2064675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299522
38249	NC_004113	GCA	2	6	2064861	2064866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299522
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38252	NC_004113	TACC	2	8	2065148	2065155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38253	NC_004113	CAA	2	6	2065167	2065172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38254	NC_004113	CTG	2	6	2065266	2065271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299523
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38271	NC_004113	CAGT	2	8	2066072	2066079	25 %	25 %	25 %	25 %	22299523
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38280	NC_004113	TCC	2	6	2066443	2066448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38283	NC_004113	CTC	2	6	2066549	2066554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38341	NC_004113	GGCG	2	8	2069184	2069191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38342	NC_004113	CCATG	2	10	2069223	2069232	20 %	20 %	20 %	40 %	22299528
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38344	NC_004113	GTTT	2	8	2069288	2069295	0 %	75 %	25 %	0 %	22299528
38345	NC_004113	GCCA	2	8	2069300	2069307	25 %	0 %	25 %	50 %	22299528
38346	NC_004113	CAGTA	2	10	2069323	2069332	40 %	20 %	20 %	20 %	22299528
38347	NC_004113	GAT	2	6	2069356	2069361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299528
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38349	NC_004113	TCA	2	6	2069483	2069488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299528
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38355	NC_004113	CTG	2	6	2069586	2069591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299528
38356	NC_004113	TTG	2	6	2069670	2069675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299528
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38478	NC_004113	CAG	2	6	2076453	2076458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299535
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38480	NC_004113	TAC	2	6	2076702	2076707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299536
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38482	NC_004113	CAA	2	6	2076789	2076794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299536
38483	NC_004113	GAG	2	6	2076810	2076815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299536
38484	NC_004113	CAG	3	9	2076819	2076827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299536
38485	NC_004113	TGA	2	6	2076862	2076867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299536
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38489	NC_004113	CTG	2	6	2077178	2077183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299537
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38491	NC_004113	GTT	2	6	2077225	2077230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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