MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_004113	CTG	2	6	1996265	1996270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299452
37002	NC_004113	ATT	2	6	1996335	1996340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299452
37003	NC_004113	TAA	2	6	1996447	1996452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299452
37004	NC_004113	CT	3	6	1996458	1996463	0 %	50 %	0 %	50 %	22299452
37005	NC_004113	T	6	6	1996556	1996561	0 %	100 %	0 %	0 %	22299452
37006	NC_004113	CTT	2	6	1996574	1996579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299452
37007	NC_004113	A	6	6	1996609	1996614	100 %	0 %	0 %	0 %	22299452
37008	NC_004113	CAA	2	6	1996675	1996680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299452
37009	NC_004113	GAA	2	6	1996701	1996706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299452
37010	NC_004113	TCAA	2	8	1996822	1996829	50 %	25 %	0 %	25 %	22299453
37011	NC_004113	CTT	2	6	1996870	1996875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299453
37012	NC_004113	ATC	2	6	1997166	1997171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299453
37013	NC_004113	GCT	2	6	1997202	1997207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299453
37014	NC_004113	TCAGAA	2	12	1997222	1997233	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22299453
37015	NC_004113	AGG	2	6	1997314	1997319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299453
37016	NC_004113	AGTCC	2	10	1997342	1997351	20 %	20 %	20 %	40 %	22299453
37017	NC_004113	CAT	2	6	1997360	1997365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299453
37018	NC_004113	CAA	2	6	1997375	1997380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299453
37019	NC_004113	CTG	2	6	1997385	1997390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299453
37020	NC_004113	ATC	2	6	1997430	1997435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299453
37021	NC_004113	G	6	6	1997490	1997495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37022	NC_004113	GATG	2	8	1997497	1997504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37023	NC_004113	GA	3	6	1997551	1997556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37024	NC_004113	GTG	2	6	1997564	1997569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299454
37025	NC_004113	CAC	2	6	1997659	1997664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299454
37026	NC_004113	GCA	2	6	1997735	1997740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299454
37027	NC_004113	CAT	2	6	1997773	1997778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299454
37028	NC_004113	C	6	6	1997786	1997791	0 %	0 %	0 %	100 %	22299454
37029	NC_004113	GCC	2	6	1997840	1997845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299454
37030	NC_004113	GCA	2	6	1997846	1997851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299454
37031	NC_004113	CCGT	2	8	1997872	1997879	0 %	25 %	25 %	50 %	22299454
37032	NC_004113	ATC	2	6	1997941	1997946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299454
37033	NC_004113	TTC	2	6	1998043	1998048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299454
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37035	NC_004113	TTGA	2	8	1998157	1998164	25 %	50 %	25 %	0 %	22299454
37036	NC_004113	GC	3	6	1998179	1998184	0 %	0 %	50 %	50 %	22299454
37037	NC_004113	G	6	6	1998207	1998212	0 %	0 %	100 %	0 %	22299454
37038	NC_004113	TAA	2	6	1998231	1998236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299454
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37040	NC_004113	TGT	2	6	1998355	1998360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299454
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37043	NC_004113	T	6	6	1998435	1998440	0 %	100 %	0 %	0 %	22299454
37044	NC_004113	CCA	2	6	1998477	1998482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299454
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37047	NC_004113	CA	3	6	1998654	1998659	50 %	0 %	0 %	50 %	22299454
37048	NC_004113	TCG	2	6	1998666	1998671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299454
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37050	NC_004113	CAAT	2	8	1998708	1998715	50 %	25 %	0 %	25 %	22299454
37051	NC_004113	CAC	2	6	1998789	1998794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299454
37052	NC_004113	TTG	2	6	1998802	1998807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299454
37053	NC_004113	GTC	2	6	1998823	1998828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37054	NC_004113	GAC	2	6	1998912	1998917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37055	NC_004113	CGTTGT	2	12	1998996	1999007	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37056	NC_004113	TGT	3	9	1999012	1999020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37057	NC_004113	CCA	2	6	1999059	1999064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37058	NC_004113	G	6	6	1999082	1999087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37059	NC_004113	AGC	2	6	1999107	1999112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37060	NC_004113	CAA	2	6	1999140	1999145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37061	NC_004113	CAG	3	9	1999239	1999247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37063	NC_004113	GCA	2	6	1999368	1999373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37065	NC_004113	GCT	2	6	1999455	1999460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299455
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37072	NC_004113	TAG	2	6	1999857	1999862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299455
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37076	NC_004113	GCT	2	6	2000104	2000109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299455
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37090	NC_004113	TGA	2	6	2000743	2000748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299455
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37102	NC_004113	G	7	7	2001532	2001538	0 %	0 %	100 %	0 %	22299455
37103	NC_004113	CCT	2	6	2001613	2001618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299455
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37356	NC_004113	AGC	2	6	2015377	2015382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299468
37357	NC_004113	CAA	2	6	2015400	2015405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299468
37358	NC_004113	ACAGC	2	10	2015412	2015421	40 %	0 %	20 %	40 %	22299468
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37373	NC_004113	GCA	2	6	2016218	2016223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299468
37374	NC_004113	AGCA	2	8	2016235	2016242	50 %	0 %	25 %	25 %	22299468
37375	NC_004113	CAG	3	9	2016255	2016263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299468
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37381	NC_004113	CAG	2	6	2016585	2016590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299468
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37413	NC_004113	AT	3	6	2018745	2018750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37470	NC_004113	T	6	6	2022014	2022019	0 %	100 %	0 %	0 %	22299473
37471	NC_004113	GT	3	6	2022132	2022137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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