MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_004113	TTC	2	6	1942320	1942325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299398
36003	NC_004113	CTG	2	6	1942462	1942467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299398
36004	NC_004113	GACC	2	8	1942470	1942477	25 %	0 %	25 %	50 %	22299398
36005	NC_004113	CT	3	6	1942532	1942537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36006	NC_004113	GAT	2	6	1942569	1942574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299399
36007	NC_004113	GCA	2	6	1942761	1942766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299399
36008	NC_004113	CAC	2	6	1942773	1942778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299399
36009	NC_004113	CAAC	2	8	1942782	1942789	50 %	0 %	0 %	50 %	22299399
36010	NC_004113	GCA	2	6	1942857	1942862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299399
36011	NC_004113	TGG	2	6	1942874	1942879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299399
36012	NC_004113	CCT	2	6	1942970	1942975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299399
36013	NC_004113	ATT	2	6	1943062	1943067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299399
36014	NC_004113	GC	3	6	1943091	1943096	0 %	0 %	50 %	50 %	22299399
36015	NC_004113	CTT	2	6	1943160	1943165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299399
36016	NC_004113	TGGC	2	8	1943217	1943224	0 %	25 %	50 %	25 %	22299399
36017	NC_004113	GCT	2	6	1943256	1943261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299399
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36048	NC_004113	GCA	2	6	1945117	1945122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36050	NC_004113	TGG	2	6	1945338	1945343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36052	NC_004113	AGT	2	6	1945559	1945564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299402
36053	NC_004113	ATA	2	6	1945580	1945585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299402
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36055	NC_004113	TGA	2	6	1945729	1945734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299402
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36062	NC_004113	AATC	2	8	1946102	1946109	50 %	25 %	0 %	25 %	22299402
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36064	NC_004113	CAGG	2	8	1946140	1946147	25 %	0 %	50 %	25 %	22299402
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36091	NC_004113	TCT	2	6	1947763	1947768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36092	NC_004113	G	6	6	1947801	1947806	0 %	0 %	100 %	0 %	22299403
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36102	NC_004113	TAAT	2	8	1948401	1948408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36103	NC_004113	T	7	7	1948408	1948414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36104	NC_004113	TCAT	2	8	1948458	1948465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36105	NC_004113	AATC	2	8	1948471	1948478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36106	NC_004113	ATT	2	6	1948511	1948516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36107	NC_004113	AGA	2	6	1948579	1948584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36108	NC_004113	TATAA	2	10	1948608	1948617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36114	NC_004113	AAT	2	6	1948712	1948717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36116	NC_004113	TATC	2	8	1948844	1948851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36117	NC_004113	T	7	7	1948865	1948871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36118	NC_004113	A	6	6	1948889	1948894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36120	NC_004113	T	8	8	1948985	1948992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36122	NC_004113	CCA	2	6	1949148	1949153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299404
36123	NC_004113	G	6	6	1949191	1949196	0 %	0 %	100 %	0 %	22299404
36124	NC_004113	CGG	3	9	1949206	1949214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299404
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36310	NC_004113	TCAT	2	8	1959081	1959088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36311	NC_004113	CAA	2	6	1959221	1959226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36357	NC_004113	GGT	2	6	1961651	1961656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299417
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36477	NC_004113	CCA	2	6	1969300	1969305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299424
36478	NC_004113	AGC	2	6	1969326	1969331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299424
36479	NC_004113	GGCT	2	8	1969471	1969478	0 %	25 %	50 %	25 %	22299424
36480	NC_004113	GCG	3	9	1969489	1969497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299424
36481	NC_004113	GCA	2	6	1969564	1969569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299424
36482	NC_004113	GGC	2	6	1969589	1969594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299424
36483	NC_004113	ATC	2	6	1969601	1969606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299424
36484	NC_004113	TAG	2	6	1969700	1969705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299424
36485	NC_004113	AGTTCC	2	12	1969764	1969775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22299424
36486	NC_004113	G	6	6	1969798	1969803	0 %	0 %	100 %	0 %	22299424
36487	NC_004113	CTT	2	6	1969843	1969848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299424
36488	NC_004113	TGG	2	6	1969864	1969869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299424
36489	NC_004113	CA	3	6	1969919	1969924	50 %	0 %	0 %	50 %	22299424
36490	NC_004113	GCGG	2	8	1969928	1969935	0 %	0 %	75 %	25 %	22299424
36491	NC_004113	CCT	2	6	1970059	1970064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299424
36492	NC_004113	GGT	2	6	1970078	1970083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299424
36493	NC_004113	G	6	6	1970087	1970092	0 %	0 %	100 %	0 %	22299424
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36498	NC_004113	CCCGC	2	10	1970404	1970413	0 %	0 %	20 %	80 %	22299424
36499	NC_004113	G	6	6	1970422	1970427	0 %	0 %	100 %	0 %	22299424
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