MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_004113	CGT	2	6	1915526	1915531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299375
35502	NC_004113	GCA	2	6	1915555	1915560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299375
35503	NC_004113	CCA	2	6	1915564	1915569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299375
35504	NC_004113	GCG	2	6	1915631	1915636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299375
35505	NC_004113	TTG	2	6	1915731	1915736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299375
35506	NC_004113	CAC	2	6	1915898	1915903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35507	NC_004113	CGC	2	6	1915925	1915930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35508	NC_004113	GGC	2	6	1915995	1916000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299376
35509	NC_004113	AGC	2	6	1916060	1916065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299376
35510	NC_004113	GTG	3	9	1916079	1916087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299376
35511	NC_004113	TGC	2	6	1916173	1916178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299376
35512	NC_004113	AGT	2	6	1916357	1916362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299376
35513	NC_004113	CTG	2	6	1916389	1916394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299376
35514	NC_004113	CAC	2	6	1916411	1916416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299376
35515	NC_004113	GGC	2	6	1916456	1916461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299376
35516	NC_004113	CG	3	6	1916616	1916621	0 %	0 %	50 %	50 %	22299376
35517	NC_004113	TGG	2	6	1916653	1916658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299376
35518	NC_004113	GAT	2	6	1916676	1916681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299376
35519	NC_004113	GCC	2	6	1916711	1916716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299376
35520	NC_004113	ATCCA	2	10	1916877	1916886	40 %	20 %	0 %	40 %	22299376
35521	NC_004113	GGC	2	6	1917098	1917103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299376
35522	NC_004113	TC	3	6	1917194	1917199	0 %	50 %	0 %	50 %	22299376
35523	NC_004113	GCC	2	6	1917219	1917224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299376
35524	NC_004113	C	6	6	1917242	1917247	0 %	0 %	0 %	100 %	22299376
35525	NC_004113	TGC	2	6	1917248	1917253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299376
35526	NC_004113	GGC	2	6	1917332	1917337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299376
35527	NC_004113	TGA	2	6	1917421	1917426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299376
35528	NC_004113	TCG	2	6	1917523	1917528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299376
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35531	NC_004113	GCGG	2	8	1917701	1917708	0 %	0 %	75 %	25 %	22299376
35532	NC_004113	GCC	2	6	1917771	1917776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299377
35533	NC_004113	TGGGCG	2	12	1917800	1917811	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22299377
35534	NC_004113	CGG	2	6	1917827	1917832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299377
35535	NC_004113	CTG	2	6	1917835	1917840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299377
35536	NC_004113	GCC	2	6	1917931	1917936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299377
35537	NC_004113	TGGCCA	2	12	1917964	1917975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299377
35538	NC_004113	TTCAC	2	10	1918048	1918057	20 %	40 %	0 %	40 %	22299377
35539	NC_004113	GGC	2	6	1918189	1918194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299377
35540	NC_004113	CGA	2	6	1918220	1918225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299377
35541	NC_004113	CAGT	2	8	1918283	1918290	25 %	25 %	25 %	25 %	22299377
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35543	NC_004113	TTG	2	6	1918352	1918357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299377
35544	NC_004113	CTG	3	9	1918367	1918375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299377
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35546	NC_004113	CTG	2	6	1918399	1918404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299377
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35549	NC_004113	TGC	2	6	1918577	1918582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299377
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35551	NC_004113	TGG	2	6	1918634	1918639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299377
35552	NC_004113	G	6	6	1918671	1918676	0 %	0 %	100 %	0 %	22299377
35553	NC_004113	CGC	3	9	1918687	1918695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299378
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35555	NC_004113	GCT	2	6	1918790	1918795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299378
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35572	NC_004113	ATTGA	2	10	1919844	1919853	40 %	40 %	20 %	0 %	22299379
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35589	NC_004113	TG	3	6	1921118	1921123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35590	NC_004113	CCG	2	6	1921161	1921166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35600	NC_004113	CGC	2	6	1921890	1921895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299382
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35605	NC_004113	GTG	2	6	1922284	1922289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299382
35606	NC_004113	TTGA	2	8	1922311	1922318	25 %	50 %	25 %	0 %	22299382
35607	NC_004113	GCA	2	6	1922404	1922409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299382
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35609	NC_004113	GGCG	2	8	1922533	1922540	0 %	0 %	75 %	25 %	22299382
35610	NC_004113	CTA	2	6	1922631	1922636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299382
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35612	NC_004113	ATC	2	6	1922667	1922672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299382
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35615	NC_004113	TGGT	2	8	1922878	1922885	0 %	50 %	50 %	0 %	22299383
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35737	NC_004113	CTG	2	6	1929733	1929738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299389
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35854	NC_004113	TCA	2	6	1936222	1936227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
35855	NC_004113	TCG	2	6	1936230	1936235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299394
35856	NC_004113	CTTG	2	8	1936246	1936253	0 %	50 %	25 %	25 %	22299394
35857	NC_004113	GTA	3	9	1936262	1936270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299394
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35868	NC_004113	CTGC	2	8	1936663	1936670	0 %	25 %	25 %	50 %	22299394
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35872	NC_004113	CAT	2	6	1936850	1936855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
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35972	NC_004113	CCA	2	6	1941123	1941128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299397
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35974	NC_004113	TGC	2	6	1941150	1941155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299397
35975	NC_004113	CCGC	2	8	1941160	1941167	0 %	0 %	25 %	75 %	22299397
35976	NC_004113	TGG	2	6	1941210	1941215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299397
35977	NC_004113	GTG	2	6	1941314	1941319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299397
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35981	NC_004113	CTG	2	6	1941529	1941534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299398
35982	NC_004113	A	6	6	1941623	1941628	100 %	0 %	0 %	0 %	22299398
35983	NC_004113	AG	3	6	1941633	1941638	50 %	0 %	50 %	0 %	22299398
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35995	NC_004113	ACG	2	6	1942168	1942173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299398
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35997	NC_004113	GCGG	2	8	1942201	1942208	0 %	0 %	75 %	25 %	22299398
35998	NC_004113	TAC	2	6	1942213	1942218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299398
35999	NC_004113	TTG	2	6	1942235	1942240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299398
36000	NC_004113	CAGTG	2	10	1942243	1942252	20 %	20 %	40 %	20 %	22299398

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