MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_004113	TGA	2	6	1860356	1860361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34502	NC_004113	GTT	2	6	1860376	1860381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34503	NC_004113	TACTGG	2	12	1860412	1860423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22299319
34504	NC_004113	CTG	2	6	1860486	1860491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299319
34505	NC_004113	TGA	2	6	1860544	1860549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299319
34506	NC_004113	TGC	2	6	1860599	1860604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299319
34507	NC_004113	TCA	2	6	1860607	1860612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299319
34508	NC_004113	TGC	2	6	1860744	1860749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34509	NC_004113	AGC	2	6	1860776	1860781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34510	NC_004113	AATTA	2	10	1860794	1860803	60 %	40 %	0 %	0 %	22299320
34511	NC_004113	AGG	2	6	1860855	1860860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299320
34512	NC_004113	AGC	2	6	1860903	1860908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34513	NC_004113	CAC	2	6	1860953	1860958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299320
34514	NC_004113	CGG	2	6	1861101	1861106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299320
34515	NC_004113	AG	3	6	1861134	1861139	50 %	0 %	50 %	0 %	22299320
34516	NC_004113	CAG	2	6	1861160	1861165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34517	NC_004113	GCT	2	6	1861230	1861235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34518	NC_004113	ACCCC	2	10	1861315	1861324	20 %	0 %	0 %	80 %	22299320
34519	NC_004113	CAG	2	6	1861451	1861456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34520	NC_004113	CGT	2	6	1861508	1861513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34521	NC_004113	CAAGGG	2	12	1861516	1861527	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22299320
34522	NC_004113	CCG	2	6	1861543	1861548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299320
34523	NC_004113	CAC	2	6	1861610	1861615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299320
34524	NC_004113	CAC	2	6	1861619	1861624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299320
34525	NC_004113	A	6	6	1861634	1861639	100 %	0 %	0 %	0 %	22299320
34526	NC_004113	ATC	2	6	1861668	1861673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299320
34527	NC_004113	C	7	7	1861807	1861813	0 %	0 %	0 %	100 %	22299320
34528	NC_004113	GCA	2	6	1861855	1861860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34529	NC_004113	GCA	2	6	1861867	1861872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299320
34530	NC_004113	CAT	2	6	1861945	1861950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299321
34531	NC_004113	CAG	2	6	1861964	1861969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299321
34532	NC_004113	ATC	2	6	1862040	1862045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299321
34533	NC_004113	GTT	2	6	1862069	1862074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34534	NC_004113	AGG	2	6	1862306	1862311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_004113	AGA	2	6	1862327	1862332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34536	NC_004113	CGGAAG	2	12	1862333	1862344	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34537	NC_004113	CGG	2	6	1862348	1862353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34538	NC_004113	GCG	2	6	1862429	1862434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299322
34539	NC_004113	CACCC	2	10	1862461	1862470	20 %	0 %	0 %	80 %	22299322
34540	NC_004113	CAC	2	6	1862500	1862505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299322
34541	NC_004113	GAA	2	6	1862555	1862560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299322
34542	NC_004113	AGA	2	6	1862596	1862601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299322
34543	NC_004113	CCA	2	6	1862613	1862618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299322
34544	NC_004113	T	8	8	1862631	1862638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34545	NC_004113	TGG	2	6	1862691	1862696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34546	NC_004113	AC	3	6	1862779	1862784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34547	NC_004113	CTC	2	6	1862796	1862801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34548	NC_004113	ACACC	2	10	1862802	1862811	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34549	NC_004113	GGC	2	6	1862835	1862840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34550	NC_004113	TAT	2	6	1862993	1862998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299323
34551	NC_004113	CTTC	2	8	1863125	1863132	0 %	50 %	0 %	50 %	22299323
34552	NC_004113	TTG	2	6	1863144	1863149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299323
34553	NC_004113	A	6	6	1863209	1863214	100 %	0 %	0 %	0 %	22299323
34554	NC_004113	AGT	2	6	1863246	1863251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299323
34555	NC_004113	TCCG	2	8	1863306	1863313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34556	NC_004113	T	7	7	1863334	1863340	0 %	100 %	0 %	0 %	22299324
34557	NC_004113	AAT	2	6	1863381	1863386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299324
34558	NC_004113	GAG	2	6	1863500	1863505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299324
34559	NC_004113	ATCT	2	8	1863579	1863586	25 %	50 %	0 %	25 %	22299324
34560	NC_004113	ATT	2	6	1863661	1863666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299324
34561	NC_004113	GCCA	2	8	1863687	1863694	25 %	0 %	25 %	50 %	22299324
34562	NC_004113	AGC	2	6	1863696	1863701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34563	NC_004113	CCT	2	6	1863730	1863735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299324
34564	NC_004113	CCA	2	6	1863754	1863759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299324
34565	NC_004113	TGC	3	9	1863786	1863794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34566	NC_004113	GAC	2	6	1863870	1863875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34567	NC_004113	TGC	2	6	1863876	1863881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34568	NC_004113	TCC	2	6	1863885	1863890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299324
34569	NC_004113	CGA	2	6	1863896	1863901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34570	NC_004113	AGC	2	6	1863945	1863950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34571	NC_004113	ACC	2	6	1863951	1863956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299324
34572	NC_004113	TCA	2	6	1864093	1864098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299324
34573	NC_004113	GCT	2	6	1864166	1864171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34574	NC_004113	CTT	2	6	1864175	1864180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299324
34575	NC_004113	TCT	2	6	1864187	1864192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299324
34576	NC_004113	CTT	2	6	1864196	1864201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299324
34577	NC_004113	GCT	2	6	1864261	1864266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299324
34578	NC_004113	ATG	2	6	1864282	1864287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299324
34579	NC_004113	GAT	2	6	1864299	1864304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34580	NC_004113	ATGAG	2	10	1864308	1864317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34581	NC_004113	TCA	2	6	1864423	1864428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299325
34582	NC_004113	ACC	2	6	1864430	1864435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299325
34583	NC_004113	TTGCCC	2	12	1864455	1864466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22299325
34584	NC_004113	C	6	6	1864464	1864469	0 %	0 %	0 %	100 %	22299325
34585	NC_004113	CCA	2	6	1864501	1864506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299325
34586	NC_004113	TGG	2	6	1864598	1864603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299325
34587	NC_004113	ACT	2	6	1864616	1864621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299325
34588	NC_004113	CTAT	2	8	1864750	1864757	25 %	50 %	0 %	25 %	22299325
34589	NC_004113	C	6	6	1864904	1864909	0 %	0 %	0 %	100 %	22299325
34590	NC_004113	AAAC	2	8	1864925	1864932	75 %	0 %	0 %	25 %	22299325
34591	NC_004113	GGC	2	6	1864990	1864995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299325
34592	NC_004113	CCCA	2	8	1865102	1865109	25 %	0 %	0 %	75 %	22299325
34593	NC_004113	TGC	2	6	1865167	1865172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299325
34594	NC_004113	CCA	2	6	1865211	1865216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299325
34595	NC_004113	GAA	2	6	1865257	1865262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299326
34596	NC_004113	AAT	2	6	1865362	1865367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299326
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34598	NC_004113	CCA	2	6	1865448	1865453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299326
34599	NC_004113	CCA	2	6	1865460	1865465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299326
34600	NC_004113	ACAG	2	8	1865492	1865499	50 %	0 %	25 %	25 %	22299326
34601	NC_004113	CAG	2	6	1865529	1865534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299326
34602	NC_004113	CCA	2	6	1865556	1865561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299326
34603	NC_004113	CCT	2	6	1865616	1865621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299326
34604	NC_004113	CAA	2	6	1865631	1865636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299326
34605	NC_004113	TGG	2	6	1865664	1865669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299326
34606	NC_004113	ATG	2	6	1865672	1865677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299326
34607	NC_004113	GTG	2	6	1865713	1865718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299326
34608	NC_004113	GCCTC	2	10	1865723	1865732	0 %	20 %	20 %	60 %	22299326
34609	NC_004113	ATG	2	6	1865816	1865821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299326
34610	NC_004113	GGC	2	6	1865855	1865860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299326
34611	NC_004113	GGC	2	6	1865902	1865907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299326
34612	NC_004113	CCA	2	6	1865943	1865948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299326
34613	NC_004113	C	6	6	1865981	1865986	0 %	0 %	0 %	100 %	22299326
34614	NC_004113	AGC	2	6	1865987	1865992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299326
34615	NC_004113	AAT	2	6	1866091	1866096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299326
34616	NC_004113	TCG	2	6	1866141	1866146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299326
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34618	NC_004113	GTT	2	6	1866252	1866257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299326
34619	NC_004113	GCA	2	6	1866260	1866265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299326
34620	NC_004113	A	7	7	1866287	1866293	100 %	0 %	0 %	0 %	22299326
34621	NC_004113	AGCA	2	8	1866392	1866399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34622	NC_004113	GGA	2	6	1866423	1866428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299327
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34732	NC_004113	TG	3	6	1873526	1873531	0 %	50 %	50 %	0 %	22299333
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34736	NC_004113	TCA	2	6	1873667	1873672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299333
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34973	NC_004113	GAG	2	6	1886364	1886369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299347
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34975	NC_004113	ATG	2	6	1886434	1886439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299347
34976	NC_004113	ATTTTC	2	12	1886503	1886514	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22299347
34977	NC_004113	GCA	2	6	1886533	1886538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299347
34978	NC_004113	CCG	2	6	1886566	1886571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299347
34979	NC_004113	AGC	2	6	1886590	1886595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299347
34980	NC_004113	TTC	2	6	1886610	1886615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299347
34981	NC_004113	GAC	2	6	1886693	1886698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299347
34982	NC_004113	CAA	2	6	1886730	1886735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34983	NC_004113	AGG	2	6	1886804	1886809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299348
34984	NC_004113	TGC	2	6	1886835	1886840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299348
34985	NC_004113	GCGGCT	2	12	1886878	1886889	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22299348
34986	NC_004113	GA	3	6	1886956	1886961	50 %	0 %	50 %	0 %	22299348
34987	NC_004113	GCC	2	6	1887071	1887076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299348
34988	NC_004113	CTG	2	6	1887078	1887083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299348
34989	NC_004113	AG	3	6	1887143	1887148	50 %	0 %	50 %	0 %	22299348
34990	NC_004113	GAT	2	6	1887221	1887226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299348
34991	NC_004113	GT	3	6	1887251	1887256	0 %	50 %	50 %	0 %	22299348
34992	NC_004113	GTAG	2	8	1887312	1887319	25 %	25 %	50 %	0 %	22299348
34993	NC_004113	ACG	2	6	1887345	1887350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299348
34994	NC_004113	CGT	2	6	1887381	1887386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299348
34995	NC_004113	TCAC	2	8	1887625	1887632	25 %	25 %	0 %	50 %	22299348
34996	NC_004113	TTG	2	6	1887660	1887665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299348
34997	NC_004113	GCT	2	6	1887706	1887711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299348
34998	NC_004113	G	6	6	1887737	1887742	0 %	0 %	100 %	0 %	22299348
34999	NC_004113	GGC	2	6	1887804	1887809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299348
35000	NC_004113	GCA	2	6	1887874	1887879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299348

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