MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33003	NC_004113	CTG	2	6	1777719	1777724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299238
33004	NC_004113	CCA	2	6	1777735	1777740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299238
33005	NC_004113	CAG	2	6	1777752	1777757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299238
33006	NC_004113	TTCG	2	8	1777785	1777792	0 %	50 %	25 %	25 %	22299238
33007	NC_004113	CAG	2	6	1777845	1777850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299238
33008	NC_004113	ATC	2	6	1777909	1777914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299238
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33010	NC_004113	GAG	2	6	1778029	1778034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299238
33011	NC_004113	CTT	2	6	1778090	1778095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299238
33012	NC_004113	CCA	2	6	1778248	1778253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299238
33013	NC_004113	TG	3	6	1778259	1778264	0 %	50 %	50 %	0 %	22299238
33014	NC_004113	GGC	2	6	1778275	1778280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299238
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33017	NC_004113	TGA	2	6	1778428	1778433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299238
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33019	NC_004113	T	6	6	1778594	1778599	0 %	100 %	0 %	0 %	22299238
33020	NC_004113	ACC	2	6	1778668	1778673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299239
33021	NC_004113	T	7	7	1778687	1778693	0 %	100 %	0 %	0 %	22299239
33022	NC_004113	T	6	6	1778786	1778791	0 %	100 %	0 %	0 %	22299239
33023	NC_004113	AC	3	6	1778800	1778805	50 %	0 %	0 %	50 %	22299239
33024	NC_004113	GGCAC	2	10	1778902	1778911	20 %	0 %	40 %	40 %	22299239
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33029	NC_004113	C	6	6	1779125	1779130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33030	NC_004113	AAG	2	6	1779135	1779140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33031	NC_004113	ACCTTA	2	12	1779184	1779195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33032	NC_004113	CTG	2	6	1779288	1779293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33033	NC_004113	AAG	2	6	1779338	1779343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299240
33034	NC_004113	T	6	6	1779370	1779375	0 %	100 %	0 %	0 %	22299240
33035	NC_004113	TTG	2	6	1779527	1779532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299240
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33042	NC_004113	TTA	2	6	1779857	1779862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299240
33043	NC_004113	TCAA	2	8	1780042	1780049	50 %	25 %	0 %	25 %	22299241
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33049	NC_004113	GCTC	2	8	1780330	1780337	0 %	25 %	25 %	50 %	22299241
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33052	NC_004113	TTCC	2	8	1780618	1780625	0 %	50 %	0 %	50 %	22299242
33053	NC_004113	ATG	2	6	1780644	1780649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299242
33054	NC_004113	CG	3	6	1780716	1780721	0 %	0 %	50 %	50 %	22299242
33055	NC_004113	CATAT	2	10	1780745	1780754	40 %	40 %	0 %	20 %	22299242
33056	NC_004113	ATC	2	6	1780781	1780786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299242
33057	NC_004113	TGA	2	6	1780848	1780853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299242
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33060	NC_004113	T	7	7	1780959	1780965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33061	NC_004113	TTCC	2	8	1780986	1780993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33062	NC_004113	CGC	2	6	1781003	1781008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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33090	NC_004113	TGT	2	6	1782335	1782340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299245
33091	NC_004113	CAAT	2	8	1782371	1782378	50 %	25 %	0 %	25 %	22299245
33092	NC_004113	GCC	2	6	1782407	1782412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299245
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33101	NC_004113	GC	3	6	1783151	1783156	0 %	0 %	50 %	50 %	22299245
33102	NC_004113	CCCAG	2	10	1783211	1783220	20 %	0 %	20 %	60 %	22299245
33103	NC_004113	TG	3	6	1783279	1783284	0 %	50 %	50 %	0 %	22299245
33104	NC_004113	CG	3	6	1783360	1783365	0 %	0 %	50 %	50 %	22299245
33105	NC_004113	GCC	2	6	1783536	1783541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299245
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33108	NC_004113	GCA	2	6	1783626	1783631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299245
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33232	NC_004113	TC	3	6	1789586	1789591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33234	NC_004113	C	6	6	1789702	1789707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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33474	NC_004113	ATAGT	2	10	1803978	1803987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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33478	NC_004113	GTC	2	6	1804154	1804159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299265
33479	NC_004113	AAC	2	6	1804166	1804171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299265
33480	NC_004113	CAA	2	6	1804434	1804439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299265
33481	NC_004113	GAT	2	6	1804443	1804448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299265
33482	NC_004113	GCCAT	2	10	1804457	1804466	20 %	20 %	20 %	40 %	22299265
33483	NC_004113	T	6	6	1804503	1804508	0 %	100 %	0 %	0 %	22299265
33484	NC_004113	TATC	2	8	1804537	1804544	25 %	50 %	0 %	25 %	22299265
33485	NC_004113	CAT	3	9	1804569	1804577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299265
33486	NC_004113	CTT	2	6	1804740	1804745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299265
33487	NC_004113	CTG	2	6	1804747	1804752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299265
33488	NC_004113	GCG	2	6	1804867	1804872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299265
33489	NC_004113	CAA	2	6	1804947	1804952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299265
33490	NC_004113	TCA	2	6	1804974	1804979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299265
33491	NC_004113	CCA	2	6	1805013	1805018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299265
33492	NC_004113	C	6	6	1805059	1805064	0 %	0 %	0 %	100 %	22299265
33493	NC_004113	CTC	2	6	1805109	1805114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299266
33494	NC_004113	AAT	2	6	1805143	1805148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299266
33495	NC_004113	TTGG	2	8	1805151	1805158	0 %	50 %	50 %	0 %	22299266
33496	NC_004113	CCT	2	6	1805219	1805224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299266
33497	NC_004113	CCTT	2	8	1805415	1805422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33498	NC_004113	G	6	6	1805480	1805485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33499	NC_004113	GAT	2	6	1805487	1805492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33500	NC_004113	CAG	2	6	1805503	1805508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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