MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_004113	CCA	2	6	1750841	1750846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299211
32503	NC_004113	TCGCT	2	10	1750854	1750863	0 %	40 %	20 %	40 %	22299211
32504	NC_004113	AGC	2	6	1750878	1750883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299211
32505	NC_004113	CAA	2	6	1750896	1750901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299211
32506	NC_004113	CAA	2	6	1751006	1751011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299211
32507	NC_004113	GCG	2	6	1751034	1751039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299211
32508	NC_004113	GTAAC	2	10	1751040	1751049	40 %	20 %	20 %	20 %	22299211
32509	NC_004113	GTG	2	6	1751202	1751207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299211
32510	NC_004113	GTTT	2	8	1751401	1751408	0 %	75 %	25 %	0 %	22299211
32511	NC_004113	TTG	2	6	1751409	1751414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299211
32512	NC_004113	AGC	2	6	1751463	1751468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299211
32513	NC_004113	CCAGC	2	10	1751531	1751540	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32514	NC_004113	CT	3	6	1751576	1751581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32515	NC_004113	AAC	2	6	1751591	1751596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32516	NC_004113	GCGG	2	8	1751598	1751605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32517	NC_004113	GTAT	2	8	1751695	1751702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32518	NC_004113	TTA	2	6	1751716	1751721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32519	NC_004113	TTA	2	6	1751726	1751731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32520	NC_004113	CTGTG	2	10	1751760	1751769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32521	NC_004113	TAC	2	6	1751774	1751779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32522	NC_004113	A	9	9	1751808	1751816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32523	NC_004113	ATAA	2	8	1751853	1751860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32524	NC_004113	AT	3	6	1751861	1751866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32525	NC_004113	A	6	6	1751882	1751887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32526	NC_004113	GTA	2	6	1751897	1751902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32527	NC_004113	CAG	2	6	1751933	1751938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32528	NC_004113	T	6	6	1752094	1752099	0 %	100 %	0 %	0 %	22299212
32529	NC_004113	AGA	2	6	1752102	1752107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299212
32530	NC_004113	TTA	2	6	1752172	1752177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299212
32531	NC_004113	AGCT	2	8	1752219	1752226	25 %	25 %	25 %	25 %	22299212
32532	NC_004113	CTT	2	6	1752282	1752287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299212
32533	NC_004113	AAAG	2	8	1752316	1752323	75 %	0 %	25 %	0 %	22299212
32534	NC_004113	CGA	2	6	1752361	1752366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299212
32535	NC_004113	TTGACC	2	12	1752476	1752487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22299212
32536	NC_004113	AAC	2	6	1752517	1752522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32537	NC_004113	A	6	6	1752544	1752549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32538	NC_004113	GA	3	6	1752598	1752603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_004113	ATC	2	6	1752735	1752740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299213
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32541	NC_004113	TGG	2	6	1752777	1752782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299213
32542	NC_004113	TTGA	2	8	1752809	1752816	25 %	50 %	25 %	0 %	22299213
32543	NC_004113	GCA	3	9	1752855	1752863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299213
32544	NC_004113	CGT	2	6	1752869	1752874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299213
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32547	NC_004113	GGA	2	6	1753026	1753031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299213
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32549	NC_004113	GGT	2	6	1753101	1753106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32550	NC_004113	GCT	2	6	1753159	1753164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32551	NC_004113	ATTT	2	8	1753203	1753210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32552	NC_004113	TAT	2	6	1753235	1753240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32553	NC_004113	G	6	6	1753291	1753296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32554	NC_004113	GCGATC	2	12	1753352	1753363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299214
32555	NC_004113	CAG	3	9	1753514	1753522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299214
32556	NC_004113	CTC	2	6	1753538	1753543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299214
32557	NC_004113	GCG	2	6	1753547	1753552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299214
32558	NC_004113	CGA	2	6	1753593	1753598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299214
32559	NC_004113	TCCACC	2	12	1753641	1753652	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	22299214
32560	NC_004113	CTTGG	2	10	1753688	1753697	0 %	40 %	40 %	20 %	22299214
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32562	NC_004113	GCA	2	6	1753780	1753785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299214
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32565	NC_004113	GCT	2	6	1753853	1753858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299214
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32567	NC_004113	TCCA	2	8	1753892	1753899	25 %	25 %	0 %	50 %	22299214
32568	NC_004113	AGG	2	6	1753901	1753906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299214
32569	NC_004113	GT	3	6	1753973	1753978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32570	NC_004113	GA	3	6	1753983	1753988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32571	NC_004113	GTT	2	6	1753992	1753997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32572	NC_004113	TGT	2	6	1754112	1754117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299215
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32587	NC_004113	GC	4	8	1754917	1754924	0 %	0 %	50 %	50 %	22299215
32588	NC_004113	GAC	2	6	1754978	1754983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299215
32589	NC_004113	TCGC	2	8	1755058	1755065	0 %	25 %	25 %	50 %	22299215
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32592	NC_004113	C	6	6	1755277	1755282	0 %	0 %	0 %	100 %	22299215
32593	NC_004113	TGGTT	2	10	1755389	1755398	0 %	60 %	40 %	0 %	22299215
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32597	NC_004113	CCAC	2	8	1755548	1755555	25 %	0 %	0 %	75 %	22299215
32598	NC_004113	TG	3	6	1755631	1755636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32599	NC_004113	G	6	6	1755749	1755754	0 %	0 %	100 %	0 %	22299216
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32604	NC_004113	T	6	6	1755962	1755967	0 %	100 %	0 %	0 %	22299216
32605	NC_004113	CCA	2	6	1755971	1755976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299216
32606	NC_004113	CAG	2	6	1756106	1756111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299216
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32609	NC_004113	AGG	2	6	1756318	1756323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299216
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32612	NC_004113	CAG	2	6	1756492	1756497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299216
32613	NC_004113	CTT	2	6	1756503	1756508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299216
32614	NC_004113	GT	3	6	1756609	1756614	0 %	50 %	50 %	0 %	22299217
32615	NC_004113	TCTTAA	2	12	1756681	1756692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	22299217
32616	NC_004113	CGG	2	6	1756753	1756758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299217
32617	NC_004113	GT	3	6	1756767	1756772	0 %	50 %	50 %	0 %	22299217
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32619	NC_004113	CCTG	2	8	1756815	1756822	0 %	25 %	25 %	50 %	22299217
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32621	NC_004113	ACTA	2	8	1756924	1756931	50 %	25 %	0 %	25 %	22299217
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32977	NC_004113	TTG	2	6	1776195	1776200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299236
32978	NC_004113	TGC	2	6	1776205	1776210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299236
32979	NC_004113	G	6	6	1776242	1776247	0 %	0 %	100 %	0 %	22299236
32980	NC_004113	TCG	2	6	1776286	1776291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299236
32981	NC_004113	ATT	2	6	1776363	1776368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299236
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32983	NC_004113	GCT	2	6	1776464	1776469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32984	NC_004113	GTA	2	6	1776561	1776566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299237
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32987	NC_004113	TGA	2	6	1776593	1776598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299237
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33000	NC_004113	TGC	2	6	1777532	1777537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299237

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