MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_004113	CCAC	2	8	1617753	1617760	25 %	0 %	0 %	75 %	22299093
30003	NC_004113	CA	3	6	1617793	1617798	50 %	0 %	0 %	50 %	22299093
30004	NC_004113	CAG	2	6	1617820	1617825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299093
30005	NC_004113	C	6	6	1617845	1617850	0 %	0 %	0 %	100 %	22299093
30006	NC_004113	AAG	2	6	1617851	1617856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299093
30007	NC_004113	TGC	2	6	1617888	1617893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299093
30008	NC_004113	AGG	2	6	1617911	1617916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299093
30009	NC_004113	TGGC	2	8	1617930	1617937	0 %	25 %	50 %	25 %	22299093
30010	NC_004113	GCG	2	6	1617961	1617966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299093
30011	NC_004113	CAC	2	6	1618012	1618017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299093
30012	NC_004113	A	6	6	1618155	1618160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30013	NC_004113	AAT	2	6	1618195	1618200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299094
30014	NC_004113	GCC	2	6	1618217	1618222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299094
30015	NC_004113	AGG	2	6	1618254	1618259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299094
30016	NC_004113	AAT	2	6	1618336	1618341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299094
30017	NC_004113	GC	3	6	1618430	1618435	0 %	0 %	50 %	50 %	22299094
30018	NC_004113	C	6	6	1618457	1618462	0 %	0 %	0 %	100 %	22299094
30019	NC_004113	GTT	2	6	1618494	1618499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299094
30020	NC_004113	CAA	2	6	1618512	1618517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299094
30021	NC_004113	GTG	2	6	1618607	1618612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299094
30022	NC_004113	AAG	2	6	1618639	1618644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299094
30023	NC_004113	AAT	2	6	1618729	1618734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30024	NC_004113	AGT	2	6	1618786	1618791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30025	NC_004113	TGAT	2	8	1618876	1618883	25 %	50 %	25 %	0 %	22299095
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30027	NC_004113	GCG	3	9	1618928	1618936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299095
30028	NC_004113	CGG	2	6	1618937	1618942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299095
30029	NC_004113	GCA	2	6	1618979	1618984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299095
30030	NC_004113	AAC	2	6	1618996	1619001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299095
30031	NC_004113	TCG	2	6	1619044	1619049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299095
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30033	NC_004113	CTG	3	9	1619184	1619192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299095
30034	NC_004113	C	7	7	1619204	1619210	0 %	0 %	0 %	100 %	22299095
30035	NC_004113	ACC	2	6	1619217	1619222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299095
30036	NC_004113	TGA	2	6	1619234	1619239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299095
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30039	NC_004113	C	6	6	1619469	1619474	0 %	0 %	0 %	100 %	22299095
30040	NC_004113	GAG	2	6	1619529	1619534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299095
30041	NC_004113	CGC	2	6	1619667	1619672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299095
30042	NC_004113	GCAG	2	8	1619676	1619683	25 %	0 %	50 %	25 %	22299095
30043	NC_004113	CTG	3	9	1619767	1619775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299095
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30045	NC_004113	TGC	2	6	1619870	1619875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299095
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30052	NC_004113	ACG	2	6	1620209	1620214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299096
30053	NC_004113	CGC	2	6	1620262	1620267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299096
30054	NC_004113	TGTT	2	8	1620276	1620283	0 %	75 %	25 %	0 %	22299096
30055	NC_004113	G	6	6	1620291	1620296	0 %	0 %	100 %	0 %	22299096
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30102	NC_004113	CAG	2	6	1623193	1623198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299098
30103	NC_004113	CTT	2	6	1623210	1623215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299098
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30106	NC_004113	CGG	2	6	1623313	1623318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299099
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30109	NC_004113	GGCA	2	8	1623529	1623536	25 %	0 %	50 %	25 %	22299099
30110	NC_004113	AAT	2	6	1623555	1623560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299099
30111	NC_004113	GAGG	2	8	1623568	1623575	25 %	0 %	75 %	0 %	22299099
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30119	NC_004113	A	6	6	1624022	1624027	100 %	0 %	0 %	0 %	22299099
30120	NC_004113	TCA	2	6	1624051	1624056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299099
30121	NC_004113	GCT	2	6	1624080	1624085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299099
30122	NC_004113	AAG	2	6	1624088	1624093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299099
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30124	NC_004113	TCTCA	2	10	1624284	1624293	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30125	NC_004113	CTTGC	2	10	1624317	1624326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30126	NC_004113	TCC	2	6	1624440	1624445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299100
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30128	NC_004113	CTG	2	6	1624649	1624654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299101
30129	NC_004113	CTG	2	6	1624657	1624662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299101
30130	NC_004113	ATCGGC	2	12	1624870	1624881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299101
30131	NC_004113	GGC	2	6	1624934	1624939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299101
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30143	NC_004113	GTT	2	6	1625621	1625626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299102
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30147	NC_004113	T	6	6	1625780	1625785	0 %	100 %	0 %	0 %	22299102
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30156	NC_004113	ATGG	2	8	1626027	1626034	25 %	25 %	50 %	0 %	22299102
30157	NC_004113	GAT	2	6	1626059	1626064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299102
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30292	NC_004113	A	7	7	1633847	1633853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30331	NC_004113	TCA	2	6	1635339	1635344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30341	NC_004113	GCAC	2	8	1635629	1635636	25 %	0 %	25 %	50 %	22299113
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30344	NC_004113	GA	3	6	1635825	1635830	50 %	0 %	50 %	0 %	22299113
30345	NC_004113	ATA	2	6	1635955	1635960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299113
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30349	NC_004113	T	7	7	1636057	1636063	0 %	100 %	0 %	0 %	22299113
30350	NC_004113	TTCA	2	8	1636093	1636100	25 %	50 %	0 %	25 %	22299113
30351	NC_004113	ACC	2	6	1636136	1636141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299113
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30353	NC_004113	CAG	2	6	1636237	1636242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299113
30354	NC_004113	AGACCA	2	12	1636257	1636268	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22299113
30355	NC_004113	GGCA	2	8	1636273	1636280	25 %	0 %	50 %	25 %	22299113
30356	NC_004113	CAAT	2	8	1636290	1636297	50 %	25 %	0 %	25 %	22299113
30357	NC_004113	GCA	2	6	1636299	1636304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299113
30358	NC_004113	GGT	2	6	1636378	1636383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299113
30359	NC_004113	GCA	2	6	1636413	1636418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299113
30360	NC_004113	GA	3	6	1636424	1636429	50 %	0 %	50 %	0 %	22299113
30361	NC_004113	GTA	2	6	1636515	1636520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299114
30362	NC_004113	AAT	2	6	1636605	1636610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299114
30363	NC_004113	ATC	2	6	1636678	1636683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299114
30364	NC_004113	A	6	6	1636741	1636746	100 %	0 %	0 %	0 %	22299114
30365	NC_004113	CTG	2	6	1636763	1636768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299114
30366	NC_004113	GCC	2	6	1636793	1636798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299114
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30368	NC_004113	GCC	2	6	1636889	1636894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299114
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30370	NC_004113	TCA	2	6	1637029	1637034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299114
30371	NC_004113	GTC	2	6	1637089	1637094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299114
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30373	NC_004113	CAC	2	6	1637127	1637132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299114
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30375	NC_004113	CCA	2	6	1637165	1637170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299114
30376	NC_004113	TTG	2	6	1637263	1637268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299114
30377	NC_004113	GGC	2	6	1637307	1637312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299115
30378	NC_004113	GGCA	2	8	1637317	1637324	25 %	0 %	50 %	25 %	22299115
30379	NC_004113	TGTGCC	2	12	1637444	1637455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299115
30380	NC_004113	TAA	2	6	1637511	1637516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299115
30381	NC_004113	TGCT	2	8	1637533	1637540	0 %	50 %	25 %	25 %	22299115
30382	NC_004113	ATG	2	6	1637552	1637557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299115
30383	NC_004113	CGGC	2	8	1637589	1637596	0 %	0 %	50 %	50 %	22299115
30384	NC_004113	TTC	2	6	1637694	1637699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30385	NC_004113	CAT	2	6	1637741	1637746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299116
30386	NC_004113	G	6	6	1637764	1637769	0 %	0 %	100 %	0 %	22299116
30387	NC_004113	GGA	2	6	1637864	1637869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299116
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30389	NC_004113	CGC	2	6	1637908	1637913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299116
30390	NC_004113	TGGG	2	8	1637917	1637924	0 %	25 %	75 %	0 %	22299116
30391	NC_004113	TGA	2	6	1637944	1637949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299116
30392	NC_004113	CTC	2	6	1638036	1638041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299116
30393	NC_004113	GTA	2	6	1638067	1638072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299116
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30400	NC_004113	CTG	2	6	1638366	1638371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299116
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30414	NC_004113	ATGG	2	8	1639447	1639454	25 %	25 %	50 %	0 %	22299118
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30416	NC_004113	AACG	2	8	1639502	1639509	50 %	0 %	25 %	25 %	22299118
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30423	NC_004113	CTG	2	6	1639796	1639801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30424	NC_004113	TCCCAT	2	12	1639846	1639857	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	22299119
30425	NC_004113	CCCATC	2	12	1639877	1639888	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	22299119
30426	NC_004113	GAA	2	6	1639897	1639902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299119
30427	NC_004113	GTC	2	6	1639979	1639984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299119
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30431	NC_004113	T	6	6	1640145	1640150	0 %	100 %	0 %	0 %	22299119
30432	NC_004113	ATA	2	6	1640154	1640159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299119
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30434	NC_004113	CTG	2	6	1640189	1640194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299120
30435	NC_004113	TTG	2	6	1640195	1640200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299120
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30443	NC_004113	TGT	2	6	1640450	1640455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299120
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30450	NC_004113	ATCT	2	8	1640850	1640857	25 %	50 %	0 %	25 %	22299121
30451	NC_004113	CGG	2	6	1641037	1641042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299121
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30454	NC_004113	GCAGA	2	10	1641129	1641138	40 %	0 %	40 %	20 %	22299121
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30460	NC_004113	CTTCTG	2	12	1641512	1641523	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22299122
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30462	NC_004113	GCAGGG	2	12	1641617	1641628	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	22299122
30463	NC_004113	CAC	2	6	1641684	1641689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299122
30464	NC_004113	GTT	2	6	1641755	1641760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299122
30465	NC_004113	GCA	2	6	1641787	1641792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299122
30466	NC_004113	AGCT	2	8	1641813	1641820	25 %	25 %	25 %	25 %	22299122
30467	NC_004113	TTC	2	6	1641903	1641908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
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30469	NC_004113	TCC	2	6	1641946	1641951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299122
30470	NC_004113	CTC	2	6	1641957	1641962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299122
30471	NC_004113	TTC	2	6	1641999	1642004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
30472	NC_004113	TTGGGC	2	12	1642014	1642025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22299122
30473	NC_004113	TTGGGC	2	12	1642056	1642067	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22299122
30474	NC_004113	ACA	2	6	1642156	1642161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299122
30475	NC_004113	TCA	2	6	1642162	1642167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299122
30476	NC_004113	CCA	2	6	1642187	1642192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299122
30477	NC_004113	TTC	2	6	1642233	1642238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
30478	NC_004113	CAT	2	6	1642335	1642340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30479	NC_004113	CAA	2	6	1642490	1642495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299123
30480	NC_004113	GC	3	6	1642573	1642578	0 %	0 %	50 %	50 %	22299123
30481	NC_004113	CCCG	2	8	1642599	1642606	0 %	0 %	25 %	75 %	22299123
30482	NC_004113	ACG	2	6	1642619	1642624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299123
30483	NC_004113	TGC	2	6	1642674	1642679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299123
30484	NC_004113	TGA	2	6	1642684	1642689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299123
30485	NC_004113	CTGC	2	8	1642750	1642757	0 %	25 %	25 %	50 %	22299123
30486	NC_004113	CAC	2	6	1642828	1642833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299123
30487	NC_004113	GAG	2	6	1642904	1642909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299123
30488	NC_004113	GAG	2	6	1642973	1642978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299123
30489	NC_004113	GTG	2	6	1643036	1643041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299123
30490	NC_004113	CTGA	2	8	1643051	1643058	25 %	25 %	25 %	25 %	22299123
30491	NC_004113	ACCG	2	8	1643075	1643082	25 %	0 %	25 %	50 %	22299123
30492	NC_004113	TCC	2	6	1643087	1643092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299123
30493	NC_004113	TGG	2	6	1643199	1643204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299123
30494	NC_004113	GC	3	6	1643236	1643241	0 %	0 %	50 %	50 %	22299123
30495	NC_004113	TGG	2	6	1643360	1643365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299123
30496	NC_004113	ATG	2	6	1643428	1643433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299123
30497	NC_004113	CAG	2	6	1643469	1643474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299124
30498	NC_004113	AAG	2	6	1643482	1643487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299124
30499	NC_004113	TGG	2	6	1643498	1643503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299124
30500	NC_004113	TTGA	2	8	1643586	1643593	25 %	50 %	25 %	0 %	22299124

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