MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_004113	TTA	2	6	1267969	1267974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23502	NC_004113	GCA	2	6	1268047	1268052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23503	NC_004113	ATC	2	6	1268087	1268092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23504	NC_004113	CCGCTC	2	12	1268173	1268184	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23505	NC_004113	GC	3	6	1268315	1268320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23506	NC_004113	AAAG	2	8	1268359	1268366	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23507	NC_004113	ATC	2	6	1268371	1268376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23508	NC_004113	CCA	2	6	1268384	1268389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298767
23509	NC_004113	CCT	2	6	1268393	1268398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298767
23510	NC_004113	CCT	2	6	1268405	1268410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298767
23511	NC_004113	TTG	2	6	1268546	1268551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298767
23512	NC_004113	GCC	3	9	1268558	1268566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298767
23513	NC_004113	TGC	2	6	1268615	1268620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23514	NC_004113	TGG	3	9	1268621	1268629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298767
23515	NC_004113	TGG	3	9	1268711	1268719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298767
23516	NC_004113	AAG	2	6	1268750	1268755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298767
23517	NC_004113	AGC	2	6	1268775	1268780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23518	NC_004113	GGC	2	6	1268793	1268798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298767
23519	NC_004113	TGC	2	6	1268985	1268990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23520	NC_004113	CGT	2	6	1269078	1269083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23521	NC_004113	TGC	3	9	1269120	1269128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23522	NC_004113	CAC	2	6	1269155	1269160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298767
23523	NC_004113	TTG	2	6	1269224	1269229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298767
23524	NC_004113	G	7	7	1269237	1269243	0 %	0 %	100 %	0 %	22298767
23525	NC_004113	CTG	2	6	1269259	1269264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23526	NC_004113	TGGCAG	2	12	1269293	1269304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	22298767
23527	NC_004113	CTG	2	6	1269323	1269328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23528	NC_004113	CCTTG	2	10	1269342	1269351	0 %	40 %	20 %	40 %	22298767
23529	NC_004113	TCG	2	6	1269387	1269392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23530	NC_004113	CAAAA	2	10	1269460	1269469	80 %	0 %	0 %	20 %	22298767
23531	NC_004113	ACG	2	6	1269548	1269553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23532	NC_004113	CTG	2	6	1269595	1269600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
23533	NC_004113	ATG	2	6	1269620	1269625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298767
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23536	NC_004113	AGCGG	2	10	1269738	1269747	20 %	0 %	60 %	20 %	22298767
23537	NC_004113	GAT	2	6	1269843	1269848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298767
23538	NC_004113	GGC	2	6	1269890	1269895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298767
23539	NC_004113	GGACA	2	10	1269901	1269910	40 %	0 %	40 %	20 %	22298767
23540	NC_004113	CCG	2	6	1270021	1270026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298767
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23542	NC_004113	TTGG	2	8	1270062	1270069	0 %	50 %	50 %	0 %	22298767
23543	NC_004113	TGG	2	6	1270073	1270078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298767
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23548	NC_004113	ATG	2	6	1270391	1270396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298767
23549	NC_004113	GAT	2	6	1270486	1270491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298767
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23552	NC_004113	TTA	2	6	1270556	1270561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298767
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23554	NC_004113	AGG	2	6	1270626	1270631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298767
23555	NC_004113	GCCT	2	8	1270682	1270689	0 %	25 %	25 %	50 %	22298767
23556	NC_004113	GCCCTT	2	12	1270690	1270701	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22298767
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23558	NC_004113	ACC	2	6	1270912	1270917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298767
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23563	NC_004113	ACCT	2	8	1271083	1271090	25 %	25 %	0 %	50 %	22298767
23564	NC_004113	AGCT	2	8	1271105	1271112	25 %	25 %	25 %	25 %	22298767
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23573	NC_004113	GCAA	2	8	1271729	1271736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23574	NC_004113	TGCGA	2	10	1271753	1271762	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23575	NC_004113	GAT	2	6	1271839	1271844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23590	NC_004113	CAG	2	6	1272839	1272844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298770
23591	NC_004113	TGGC	2	8	1272894	1272901	0 %	25 %	50 %	25 %	22298770
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23601	NC_004113	GCC	2	6	1273808	1273813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23602	NC_004113	GCA	2	6	1273927	1273932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298771
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23605	NC_004113	GAA	2	6	1274135	1274140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298771
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23608	NC_004113	TGA	2	6	1274242	1274247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298771
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23610	NC_004113	TTA	2	6	1274292	1274297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298771
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23614	NC_004113	CAA	2	6	1274469	1274474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23615	NC_004113	GCAA	2	8	1274506	1274513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23616	NC_004113	TGC	2	6	1274555	1274560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298772
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23975	NC_004113	TAT	2	6	1294844	1294849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298793
23976	NC_004113	GCG	2	6	1294874	1294879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
23977	NC_004113	TG	4	8	1294924	1294931	0 %	50 %	50 %	0 %	22298793
23978	NC_004113	GCTG	2	8	1295089	1295096	0 %	25 %	50 %	25 %	22298793
23979	NC_004113	GTC	2	6	1295120	1295125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
23980	NC_004113	CTG	2	6	1295156	1295161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
23981	NC_004113	GCT	2	6	1295184	1295189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
23982	NC_004113	CAAC	2	8	1295212	1295219	50 %	0 %	0 %	50 %	22298793
23983	NC_004113	GCG	2	6	1295240	1295245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
23984	NC_004113	ACC	2	6	1295249	1295254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298793
23985	NC_004113	G	6	6	1295266	1295271	0 %	0 %	100 %	0 %	22298793
23986	NC_004113	GCT	2	6	1295275	1295280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
23987	NC_004113	GCACCT	2	12	1295286	1295297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298793
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23989	NC_004113	GGC	2	6	1295380	1295385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
23990	NC_004113	AGC	2	6	1295401	1295406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298793
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23994	NC_004113	ACCG	2	8	1295604	1295611	25 %	0 %	25 %	50 %	22298794
23995	NC_004113	ACT	2	6	1295620	1295625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298794
23996	NC_004113	CGC	2	6	1295632	1295637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298794
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23999	NC_004113	CTG	2	6	1295719	1295724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298794
24000	NC_004113	CTG	2	6	1295758	1295763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298794

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