MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_004113	CGC	2	6	1242793	1242798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298742
23003	NC_004113	GGC	2	6	1242912	1242917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23004	NC_004113	TAG	2	6	1242941	1242946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298743
23005	NC_004113	TCT	2	6	1243013	1243018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298743
23006	NC_004113	A	6	6	1243073	1243078	100 %	0 %	0 %	0 %	22298743
23007	NC_004113	TGA	2	6	1243080	1243085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298743
23008	NC_004113	CTC	2	6	1243105	1243110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298743
23009	NC_004113	TGT	2	6	1243158	1243163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298743
23010	NC_004113	TGG	2	6	1243185	1243190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298743
23011	NC_004113	GCCG	2	8	1243232	1243239	0 %	0 %	50 %	50 %	22298743
23012	NC_004113	TCA	2	6	1243271	1243276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298743
23013	NC_004113	ATT	2	6	1243330	1243335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298743
23014	NC_004113	A	6	6	1243399	1243404	100 %	0 %	0 %	0 %	22298743
23015	NC_004113	GT	3	6	1243445	1243450	0 %	50 %	50 %	0 %	22298743
23016	NC_004113	CTT	2	6	1243468	1243473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298743
23017	NC_004113	GAT	2	6	1243497	1243502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298743
23018	NC_004113	ACT	2	6	1243558	1243563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298743
23019	NC_004113	GGT	2	6	1243587	1243592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298743
23020	NC_004113	ACGC	2	8	1243669	1243676	25 %	0 %	25 %	50 %	22298743
23021	NC_004113	CAT	2	6	1243833	1243838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298743
23022	NC_004113	AGT	2	6	1243839	1243844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298743
23023	NC_004113	CCG	2	6	1243879	1243884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298743
23024	NC_004113	GCC	2	6	1243898	1243903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298743
23025	NC_004113	CATC	2	8	1243941	1243948	25 %	25 %	0 %	50 %	22298743
23026	NC_004113	CCT	2	6	1243953	1243958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23027	NC_004113	CAT	2	6	1244019	1244024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298744
23028	NC_004113	A	6	6	1244077	1244082	100 %	0 %	0 %	0 %	22298744
23029	NC_004113	CTC	2	6	1244134	1244139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298744
23030	NC_004113	ATA	2	6	1244234	1244239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298744
23031	NC_004113	ACA	2	6	1244243	1244248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298744
23032	NC_004113	CTTG	2	8	1244306	1244313	0 %	50 %	25 %	25 %	22298744
23033	NC_004113	TAA	2	6	1244346	1244351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298744
23034	NC_004113	TCG	2	6	1244389	1244394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298744
23035	NC_004113	GTAA	2	8	1244440	1244447	50 %	25 %	25 %	0 %	22298744
23036	NC_004113	TAG	2	6	1244450	1244455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298744
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23038	NC_004113	CGGA	2	8	1244491	1244498	25 %	0 %	50 %	25 %	22298744
23039	NC_004113	A	6	6	1244504	1244509	100 %	0 %	0 %	0 %	22298744
23040	NC_004113	AGC	2	6	1244632	1244637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298744
23041	NC_004113	TTC	2	6	1244866	1244871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298744
23042	NC_004113	ACA	2	6	1244903	1244908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298744
23043	NC_004113	T	6	6	1245025	1245030	0 %	100 %	0 %	0 %	22298744
23044	NC_004113	TG	3	6	1245100	1245105	0 %	50 %	50 %	0 %	22298744
23045	NC_004113	T	6	6	1245169	1245174	0 %	100 %	0 %	0 %	22298744
23046	NC_004113	TTG	2	6	1245250	1245255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298744
23047	NC_004113	TTC	2	6	1245272	1245277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298745
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23050	NC_004113	AACT	2	8	1245365	1245372	50 %	25 %	0 %	25 %	22298745
23051	NC_004113	TGA	2	6	1245378	1245383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298745
23052	NC_004113	AAG	2	6	1245550	1245555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298745
23053	NC_004113	AAT	2	6	1245617	1245622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298745
23054	NC_004113	CAT	2	6	1245625	1245630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298745
23055	NC_004113	TGC	2	6	1245734	1245739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298745
23056	NC_004113	TC	3	6	1245763	1245768	0 %	50 %	0 %	50 %	22298745
23057	NC_004113	CTT	2	6	1245893	1245898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298745
23058	NC_004113	TTG	2	6	1245937	1245942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298745
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23060	NC_004113	CA	3	6	1245986	1245991	50 %	0 %	0 %	50 %	22298745
23061	NC_004113	TC	3	6	1245996	1246001	0 %	50 %	0 %	50 %	22298745
23062	NC_004113	TCAT	2	8	1246011	1246018	25 %	50 %	0 %	25 %	22298745
23063	NC_004113	AGAAA	2	10	1246019	1246028	80 %	0 %	20 %	0 %	22298745
23064	NC_004113	T	6	6	1246057	1246062	0 %	100 %	0 %	0 %	22298745
23065	NC_004113	GCA	2	6	1246080	1246085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298745
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23067	NC_004113	GGAT	2	8	1246130	1246137	25 %	25 %	50 %	0 %	22298745
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23072	NC_004113	TTA	2	6	1246359	1246364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298745
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23076	NC_004113	TAGG	2	8	1246584	1246591	25 %	25 %	50 %	0 %	22298746
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23080	NC_004113	TCA	2	6	1246790	1246795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298746
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23088	NC_004113	TAA	2	6	1247042	1247047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298746
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23092	NC_004113	AAATA	2	10	1247191	1247200	80 %	20 %	0 %	0 %	22298746
23093	NC_004113	ACT	2	6	1247224	1247229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298746
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23099	NC_004113	A	6	6	1247427	1247432	100 %	0 %	0 %	0 %	22298746
23100	NC_004113	GCA	2	6	1247498	1247503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298746
23101	NC_004113	CTTAG	2	10	1247540	1247549	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23102	NC_004113	GTA	2	6	1247602	1247607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23103	NC_004113	ATG	2	6	1247626	1247631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23104	NC_004113	TC	3	6	1247648	1247653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23105	NC_004113	GCT	2	6	1247708	1247713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23106	NC_004113	ATG	2	6	1247785	1247790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23107	NC_004113	GTC	2	6	1247804	1247809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23109	NC_004113	CACC	2	8	1247910	1247917	25 %	0 %	0 %	75 %	22298747
23110	NC_004113	ACG	2	6	1247947	1247952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298747
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23114	NC_004113	GCA	2	6	1248097	1248102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298748
23115	NC_004113	CTT	2	6	1248134	1248139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298748
23116	NC_004113	AAATT	2	10	1248163	1248172	60 %	40 %	0 %	0 %	22298748
23117	NC_004113	TTA	2	6	1248181	1248186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298748
23118	NC_004113	ACT	2	6	1248190	1248195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298748
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23120	NC_004113	CTG	2	6	1248325	1248330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298748
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23241	NC_004113	TGCAAC	2	12	1254265	1254276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22298753
23242	NC_004113	CCG	2	6	1254312	1254317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298753
23243	NC_004113	GCCCT	2	10	1254412	1254421	0 %	20 %	20 %	60 %	22298753
23244	NC_004113	GCT	2	6	1254445	1254450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23245	NC_004113	CGA	2	6	1254582	1254587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298754
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23247	NC_004113	GCA	2	6	1254724	1254729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298754
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23273	NC_004113	CAAT	2	8	1255818	1255825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23274	NC_004113	GCC	2	6	1255860	1255865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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23309	NC_004113	CTG	2	6	1257845	1257850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298757
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23357	NC_004113	CCT	2	6	1259835	1259840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298758
23358	NC_004113	TCCC	2	8	1259919	1259926	0 %	25 %	0 %	75 %	22298758
23359	NC_004113	CGA	2	6	1259963	1259968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
23360	NC_004113	CAT	3	9	1260016	1260024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298758
23361	NC_004113	GGC	2	6	1260031	1260036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298758
23362	NC_004113	AGA	2	6	1260037	1260042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298758
23363	NC_004113	C	6	6	1260091	1260096	0 %	0 %	0 %	100 %	22298758
23364	NC_004113	TAT	2	6	1260125	1260130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298758
23365	NC_004113	CCA	2	6	1260145	1260150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298758
23366	NC_004113	GCG	2	6	1260301	1260306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23367	NC_004113	TTA	2	6	1260405	1260410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23368	NC_004113	ACTCC	2	10	1260454	1260463	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23369	NC_004113	GCCG	2	8	1260868	1260875	0 %	0 %	50 %	50 %	22298759
23370	NC_004113	TGG	2	6	1260877	1260882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298759
23371	NC_004113	G	6	6	1260881	1260886	0 %	0 %	100 %	0 %	22298759
23372	NC_004113	TTG	2	6	1261025	1261030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298759
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23379	NC_004113	CCG	2	6	1261386	1261391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298760
23380	NC_004113	GCG	2	6	1261519	1261524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298760
23381	NC_004113	GGTG	2	8	1261576	1261583	0 %	25 %	75 %	0 %	22298760
23382	NC_004113	TTG	2	6	1261649	1261654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298760
23383	NC_004113	GGT	2	6	1261669	1261674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298760
23384	NC_004113	TCTGGC	2	12	1261715	1261726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298760
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23386	NC_004113	CT	3	6	1261755	1261760	0 %	50 %	0 %	50 %	22298760
23387	NC_004113	C	6	6	1262039	1262044	0 %	0 %	0 %	100 %	22298761
23388	NC_004113	GGT	2	6	1262068	1262073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298761
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23391	NC_004113	AGTG	2	8	1262293	1262300	25 %	25 %	50 %	0 %	22298761
23392	NC_004113	C	6	6	1262331	1262336	0 %	0 %	0 %	100 %	22298761
23393	NC_004113	ATC	2	6	1262357	1262362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298761
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23410	NC_004113	GAC	2	6	1263192	1263197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298762
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23412	NC_004113	T	6	6	1263375	1263380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23413	NC_004113	CTG	2	6	1263424	1263429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298763
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23444	NC_004113	T	6	6	1265263	1265268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23447	NC_004113	TGG	2	6	1265364	1265369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23449	NC_004113	TTGC	2	8	1265532	1265539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23450	NC_004113	GTAGAT	2	12	1265768	1265779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298764
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23459	NC_004113	AATC	2	8	1266004	1266011	50 %	25 %	0 %	25 %	22298764
23460	NC_004113	CGCC	2	8	1266046	1266053	0 %	0 %	25 %	75 %	22298764
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23465	NC_004113	GC	3	6	1266311	1266316	0 %	0 %	50 %	50 %	22298764
23466	NC_004113	TAGA	2	8	1266317	1266324	50 %	25 %	25 %	0 %	22298764
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23470	NC_004113	G	7	7	1266559	1266565	0 %	0 %	100 %	0 %	22298764
23471	NC_004113	TGC	2	6	1266612	1266617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298764
23472	NC_004113	TGC	2	6	1266674	1266679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298764
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23474	NC_004113	GAG	2	6	1266779	1266784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23475	NC_004113	CAC	2	6	1266822	1266827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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23477	NC_004113	GCC	2	6	1267012	1267017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298765
23478	NC_004113	ACT	2	6	1267079	1267084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298765
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23481	NC_004113	GCCAAC	2	12	1267163	1267174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22298765
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23500	NC_004113	GGAA	2	8	1267898	1267905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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