MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_004113	T	6	6	1158532	1158537	0 %	100 %	0 %	0 %	22298669
21502	NC_004113	GCA	2	6	1158585	1158590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298669
21503	NC_004113	TGC	2	6	1158685	1158690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298669
21504	NC_004113	CAC	2	6	1158751	1158756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298669
21505	NC_004113	CCA	2	6	1158770	1158775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298669
21506	NC_004113	GCA	2	6	1158778	1158783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298669
21507	NC_004113	CCA	2	6	1158837	1158842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298669
21508	NC_004113	CCG	2	6	1158849	1158854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298669
21509	NC_004113	ATCCCC	2	12	1158944	1158955	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	22298669
21510	NC_004113	ATC	2	6	1158965	1158970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298669
21511	NC_004113	GA	3	6	1158980	1158985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21512	NC_004113	AGGG	2	8	1158997	1159004	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21513	NC_004113	AAT	2	6	1159058	1159063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21514	NC_004113	CAA	2	6	1159125	1159130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21515	NC_004113	GAG	2	6	1159253	1159258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21516	NC_004113	GGT	2	6	1159280	1159285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21517	NC_004113	AAGTG	2	10	1159317	1159326	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21518	NC_004113	AGA	2	6	1159332	1159337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21519	NC_004113	CAC	2	6	1159452	1159457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21520	NC_004113	AGGC	2	8	1159519	1159526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21521	NC_004113	TGA	2	6	1159543	1159548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21522	NC_004113	AGG	2	6	1159561	1159566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21523	NC_004113	CAT	2	6	1159634	1159639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21524	NC_004113	AC	3	6	1159761	1159766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21525	NC_004113	AG	3	6	1159772	1159777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21526	NC_004113	TACA	2	8	1159804	1159811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21527	NC_004113	TCC	2	6	1159818	1159823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21528	NC_004113	G	6	6	1159839	1159844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21529	NC_004113	C	7	7	1159906	1159912	0 %	0 %	0 %	100 %	22298670
21530	NC_004113	GGTT	2	8	1159997	1160004	0 %	50 %	50 %	0 %	22298670
21531	NC_004113	AG	3	6	1160052	1160057	50 %	0 %	50 %	0 %	22298670
21532	NC_004113	GAA	2	6	1160097	1160102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298670
21533	NC_004113	GCA	2	6	1160148	1160153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298670
21534	NC_004113	T	6	6	1160188	1160193	0 %	100 %	0 %	0 %	22298670
21535	NC_004113	CTG	2	6	1160384	1160389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298670
21536	NC_004113	TGA	2	6	1160415	1160420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298670
21537	NC_004113	AG	3	6	1160425	1160430	50 %	0 %	50 %	0 %	22298670
21538	NC_004113	GGTT	2	8	1160457	1160464	0 %	50 %	50 %	0 %	22298670
21539	NC_004113	CTA	2	6	1160538	1160543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298670
21540	NC_004113	CAAA	2	8	1160580	1160587	75 %	0 %	0 %	25 %	22298670
21541	NC_004113	GAC	2	6	1160679	1160684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298670
21542	NC_004113	GAA	2	6	1160733	1160738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298670
21543	NC_004113	TTG	2	6	1160897	1160902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298670
21544	NC_004113	AC	3	6	1161000	1161005	50 %	0 %	0 %	50 %	22298670
21545	NC_004113	GAA	2	6	1161065	1161070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298670
21546	NC_004113	G	6	6	1161115	1161120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21547	NC_004113	CAC	2	6	1161202	1161207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21548	NC_004113	AAC	2	6	1161277	1161282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298671
21549	NC_004113	CT	3	6	1161356	1161361	0 %	50 %	0 %	50 %	22298671
21550	NC_004113	CGC	2	6	1161527	1161532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298671
21551	NC_004113	AGTG	2	8	1161548	1161555	25 %	25 %	50 %	0 %	22298671
21552	NC_004113	G	7	7	1161664	1161670	0 %	0 %	100 %	0 %	22298671
21553	NC_004113	T	7	7	1161859	1161865	0 %	100 %	0 %	0 %	22298671
21554	NC_004113	TCAT	2	8	1161900	1161907	25 %	50 %	0 %	25 %	22298671
21555	NC_004113	GAT	2	6	1161973	1161978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298671
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21557	NC_004113	ACC	2	6	1162018	1162023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298671
21558	NC_004113	TTG	2	6	1162083	1162088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298671
21559	NC_004113	GAT	2	6	1162168	1162173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298671
21560	NC_004113	T	6	6	1162225	1162230	0 %	100 %	0 %	0 %	22298671
21561	NC_004113	ATC	2	6	1162242	1162247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298671
21562	NC_004113	ATC	2	6	1162260	1162265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298671
21563	NC_004113	GAAG	2	8	1162324	1162331	50 %	0 %	50 %	0 %	22298671
21564	NC_004113	CTG	2	6	1162377	1162382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298671
21565	NC_004113	AGGC	2	8	1162403	1162410	25 %	0 %	50 %	25 %	22298671
21566	NC_004113	GTC	2	6	1162432	1162437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298671
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21568	NC_004113	TGC	3	9	1162512	1162520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298672
21569	NC_004113	TGGC	2	8	1162541	1162548	0 %	25 %	50 %	25 %	22298672
21570	NC_004113	CTG	2	6	1162602	1162607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298672
21571	NC_004113	CTG	2	6	1162619	1162624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298672
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21574	NC_004113	CTA	2	6	1162876	1162881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298672
21575	NC_004113	TGGCAT	2	12	1162900	1162911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22298672
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21577	NC_004113	CAG	2	6	1162941	1162946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298672
21578	NC_004113	GCA	2	6	1162982	1162987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298672
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21581	NC_004113	CTG	2	6	1163225	1163230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298673
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21586	NC_004113	TGAT	2	8	1163523	1163530	25 %	50 %	25 %	0 %	22298673
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21588	NC_004113	G	6	6	1163614	1163619	0 %	0 %	100 %	0 %	22298673
21589	NC_004113	TGC	3	9	1163659	1163667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298673
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21591	NC_004113	TAGGC	2	10	1163746	1163755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21592	NC_004113	GGTT	2	8	1163758	1163765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21593	NC_004113	A	6	6	1163828	1163833	100 %	0 %	0 %	0 %	22298674
21594	NC_004113	ACA	2	6	1163898	1163903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298674
21595	NC_004113	TGC	3	9	1163919	1163927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298674
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21598	NC_004113	TTGA	2	8	1163978	1163985	25 %	50 %	25 %	0 %	22298674
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21600	NC_004113	A	6	6	1164044	1164049	100 %	0 %	0 %	0 %	22298674
21601	NC_004113	AT	3	6	1164070	1164075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21602	NC_004113	GGC	2	6	1164091	1164096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21603	NC_004113	CCA	2	6	1164266	1164271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
21604	NC_004113	GAG	2	6	1164387	1164392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298675
21605	NC_004113	CAGC	2	8	1164482	1164489	25 %	0 %	25 %	50 %	22298675
21606	NC_004113	CAGTG	2	10	1164542	1164551	20 %	20 %	40 %	20 %	22298675
21607	NC_004113	GT	3	6	1164593	1164598	0 %	50 %	50 %	0 %	22298675
21608	NC_004113	CTC	2	6	1164613	1164618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298675
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21615	NC_004113	ACT	2	6	1165005	1165010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298675
21616	NC_004113	CGG	2	6	1165096	1165101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298675
21617	NC_004113	GGA	2	6	1165167	1165172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298675
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21621	NC_004113	GCC	2	6	1165375	1165380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298675
21622	NC_004113	ACC	2	6	1165424	1165429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
21623	NC_004113	GCT	2	6	1165447	1165452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298675
21624	NC_004113	GCA	2	6	1165530	1165535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298675
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21651	NC_004113	GCC	2	6	1166849	1166854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298677
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21733	NC_004113	CTG	2	6	1171677	1171682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298682
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21978	NC_004113	CCG	2	6	1185286	1185291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298696
21979	NC_004113	GAT	2	6	1185320	1185325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298696
21980	NC_004113	GCC	2	6	1185352	1185357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298696
21981	NC_004113	T	7	7	1185389	1185395	0 %	100 %	0 %	0 %	22298696
21982	NC_004113	CAGG	2	8	1185507	1185514	25 %	0 %	50 %	25 %	22298696
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21986	NC_004113	ACT	2	6	1185643	1185648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298696
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21989	NC_004113	G	6	6	1185671	1185676	0 %	0 %	100 %	0 %	22298696
21990	NC_004113	TGGG	2	8	1185696	1185703	0 %	25 %	75 %	0 %	22298696
21991	NC_004113	GGC	2	6	1185755	1185760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298696
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