MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_004113	GTA	2	6	1130193	1130198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298640
21002	NC_004113	GAATGC	2	12	1130228	1130239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22298640
21003	NC_004113	TAA	2	6	1130255	1130260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298640
21004	NC_004113	GGCT	2	8	1130379	1130386	0 %	25 %	50 %	25 %	22298640
21005	NC_004113	GGC	2	6	1130478	1130483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298640
21006	NC_004113	ATC	2	6	1130499	1130504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298640
21007	NC_004113	AGATA	2	10	1130528	1130537	60 %	20 %	20 %	0 %	22298640
21008	NC_004113	GGA	2	6	1130570	1130575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298640
21009	NC_004113	G	6	6	1130683	1130688	0 %	0 %	100 %	0 %	22298640
21010	NC_004113	GATC	2	8	1130707	1130714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21011	NC_004113	CAG	2	6	1130801	1130806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21012	NC_004113	AAC	2	6	1130822	1130827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21013	NC_004113	T	6	6	1130859	1130864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_004113	CAA	2	6	1130954	1130959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21015	NC_004113	AAC	2	6	1130962	1130967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21016	NC_004113	TGG	2	6	1130979	1130984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21017	NC_004113	TCC	2	6	1131147	1131152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21018	NC_004113	CCTTGT	2	12	1131189	1131200	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22298641
21019	NC_004113	ACA	2	6	1131228	1131233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298641
21020	NC_004113	ATG	2	6	1131256	1131261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298641
21021	NC_004113	GGC	2	6	1131358	1131363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298641
21022	NC_004113	GAT	2	6	1131373	1131378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298641
21023	NC_004113	AC	3	6	1131426	1131431	50 %	0 %	0 %	50 %	22298641
21024	NC_004113	TTA	2	6	1131451	1131456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298641
21025	NC_004113	A	6	6	1131526	1131531	100 %	0 %	0 %	0 %	22298641
21026	NC_004113	G	6	6	1131551	1131556	0 %	0 %	100 %	0 %	22298641
21027	NC_004113	GGT	2	6	1131561	1131566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298641
21028	NC_004113	CTG	2	6	1131586	1131591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298641
21029	NC_004113	GGT	2	6	1131612	1131617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298641
21030	NC_004113	GCA	2	6	1131742	1131747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298641
21031	NC_004113	ACTC	2	8	1131816	1131823	25 %	25 %	0 %	50 %	22298641
21032	NC_004113	GCG	2	6	1131940	1131945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298642
21033	NC_004113	GGT	2	6	1131982	1131987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298642
21034	NC_004113	TGG	2	6	1132006	1132011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298642
21035	NC_004113	GAC	2	6	1132025	1132030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298642
21036	NC_004113	ATCT	2	8	1132253	1132260	25 %	50 %	0 %	25 %	22298642
21037	NC_004113	GCA	2	6	1132392	1132397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298642
21038	NC_004113	C	6	6	1132517	1132522	0 %	0 %	0 %	100 %	22298642
21039	NC_004113	A	6	6	1132602	1132607	100 %	0 %	0 %	0 %	22298642
21040	NC_004113	GAG	2	6	1132625	1132630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298642
21041	NC_004113	GCT	2	6	1132649	1132654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298642
21042	NC_004113	TCA	2	6	1132701	1132706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298642
21043	NC_004113	C	6	6	1132715	1132720	0 %	0 %	0 %	100 %	22298642
21044	NC_004113	CTG	2	6	1132760	1132765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298642
21045	NC_004113	TTC	2	6	1132802	1132807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298642
21046	NC_004113	T	6	6	1132837	1132842	0 %	100 %	0 %	0 %	22298642
21047	NC_004113	GGT	2	6	1132843	1132848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298642
21048	NC_004113	GGTT	2	8	1132915	1132922	0 %	50 %	50 %	0 %	22298642
21049	NC_004113	GCC	2	6	1133091	1133096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298642
21050	NC_004113	AGG	2	6	1133100	1133105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298642
21051	NC_004113	CAC	2	6	1133288	1133293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298643
21052	NC_004113	GGC	2	6	1133297	1133302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298643
21053	NC_004113	ACAA	2	8	1133476	1133483	75 %	0 %	0 %	25 %	22298643
21054	NC_004113	GGT	2	6	1133526	1133531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298643
21055	NC_004113	A	6	6	1133532	1133537	100 %	0 %	0 %	0 %	22298643
21056	NC_004113	AGG	2	6	1133575	1133580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298643
21057	NC_004113	G	6	6	1133590	1133595	0 %	0 %	100 %	0 %	22298643
21058	NC_004113	AAAT	2	8	1133604	1133611	75 %	25 %	0 %	0 %	22298643
21059	NC_004113	GGC	2	6	1133664	1133669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298643
21060	NC_004113	TCC	2	6	1133704	1133709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298643
21061	NC_004113	ACA	2	6	1133804	1133809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298644
21062	NC_004113	CTG	2	6	1133945	1133950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298644
21063	NC_004113	T	6	6	1133975	1133980	0 %	100 %	0 %	0 %	22298644
21064	NC_004113	TA	3	6	1134025	1134030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_004113	T	7	7	1134038	1134044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21066	NC_004113	CAC	2	6	1134156	1134161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298645
21067	NC_004113	TGG	2	6	1134245	1134250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298645
21068	NC_004113	AGA	2	6	1134273	1134278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298645
21069	NC_004113	GCC	2	6	1134280	1134285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298645
21070	NC_004113	TGA	2	6	1134360	1134365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298645
21071	NC_004113	A	6	6	1134411	1134416	100 %	0 %	0 %	0 %	22298645
21072	NC_004113	GGCT	2	8	1134453	1134460	0 %	25 %	50 %	25 %	22298646
21073	NC_004113	TAG	2	6	1134478	1134483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298646
21074	NC_004113	TGGT	2	8	1134489	1134496	0 %	50 %	50 %	0 %	22298646
21075	NC_004113	GGT	2	6	1134572	1134577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298646
21076	NC_004113	TTG	2	6	1134610	1134615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298646
21077	NC_004113	GGT	2	6	1134792	1134797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298646
21078	NC_004113	GCG	2	6	1134800	1134805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298646
21079	NC_004113	ATT	2	6	1134810	1134815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298646
21080	NC_004113	G	6	6	1134841	1134846	0 %	0 %	100 %	0 %	22298646
21081	NC_004113	C	6	6	1134861	1134866	0 %	0 %	0 %	100 %	22298646
21082	NC_004113	GTG	2	6	1134957	1134962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298647
21083	NC_004113	TGA	2	6	1135018	1135023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298647
21084	NC_004113	GA	3	6	1135113	1135118	50 %	0 %	50 %	0 %	22298647
21085	NC_004113	GAG	2	6	1135179	1135184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298647
21086	NC_004113	TTG	2	6	1135188	1135193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
21087	NC_004113	CT	3	6	1135198	1135203	0 %	50 %	0 %	50 %	22298647
21088	NC_004113	TGG	2	6	1135209	1135214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298647
21089	NC_004113	CAG	2	6	1135277	1135282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298647
21090	NC_004113	CCCTT	2	10	1135360	1135369	0 %	40 %	0 %	60 %	22298647
21091	NC_004113	ATT	2	6	1135439	1135444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298647
21092	NC_004113	GGGA	2	8	1135509	1135516	25 %	0 %	75 %	0 %	22298647
21093	NC_004113	TTTA	2	8	1135558	1135565	25 %	75 %	0 %	0 %	22298647
21094	NC_004113	TTG	2	6	1135566	1135571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
21095	NC_004113	AGG	2	6	1135584	1135589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298647
21096	NC_004113	CGTG	2	8	1135675	1135682	0 %	25 %	50 %	25 %	22298647
21097	NC_004113	AAG	2	6	1135710	1135715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298647
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21099	NC_004113	TTG	2	6	1135815	1135820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
21100	NC_004113	CCA	2	6	1135872	1135877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298647
21101	NC_004113	CTC	2	6	1135887	1135892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298647
21102	NC_004113	CCT	2	6	1135995	1136000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298647
21103	NC_004113	G	7	7	1136002	1136008	0 %	0 %	100 %	0 %	22298647
21104	NC_004113	TGT	2	6	1136053	1136058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
21105	NC_004113	TC	3	6	1136139	1136144	0 %	50 %	0 %	50 %	22298647
21106	NC_004113	ATT	2	6	1136195	1136200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298647
21107	NC_004113	AAGCC	2	10	1136206	1136215	40 %	0 %	20 %	40 %	22298647
21108	NC_004113	TGG	2	6	1136367	1136372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298648
21109	NC_004113	TCA	2	6	1136413	1136418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298648
21110	NC_004113	TTGC	2	8	1136569	1136576	0 %	50 %	25 %	25 %	22298648
21111	NC_004113	GC	3	6	1136635	1136640	0 %	0 %	50 %	50 %	22298648
21112	NC_004113	GGC	2	6	1136649	1136654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298648
21113	NC_004113	GCC	2	6	1136670	1136675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298648
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21115	NC_004113	GTT	2	6	1136797	1136802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298648
21116	NC_004113	ATG	2	6	1136880	1136885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298648
21117	NC_004113	GA	3	6	1136950	1136955	50 %	0 %	50 %	0 %	22298649
21118	NC_004113	CCA	2	6	1137000	1137005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298649
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21120	NC_004113	GGC	2	6	1137067	1137072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298649
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21132	NC_004113	G	8	8	1137579	1137586	0 %	0 %	100 %	0 %	22298649
21133	NC_004113	CCCA	2	8	1137694	1137701	25 %	0 %	0 %	75 %	22298649
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21203	NC_004113	ATC	2	6	1141814	1141819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298654
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21206	NC_004113	GCC	2	6	1142004	1142009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298654
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21222	NC_004113	GAC	2	6	1143139	1143144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298656
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21227	NC_004113	CTC	2	6	1143488	1143493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21228	NC_004113	TTC	2	6	1143531	1143536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21229	NC_004113	CCTT	2	8	1143590	1143597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21230	NC_004113	CAA	2	6	1143707	1143712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298657
21231	NC_004113	GTT	2	6	1143730	1143735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298657
21232	NC_004113	GT	3	6	1143739	1143744	0 %	50 %	50 %	0 %	22298657
21233	NC_004113	ACG	2	6	1143759	1143764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298657
21234	NC_004113	GAA	2	6	1143838	1143843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298657
21235	NC_004113	CAG	2	6	1143890	1143895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298657
21236	NC_004113	CTT	2	6	1143928	1143933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298657
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21238	NC_004113	CCT	2	6	1143974	1143979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298657
21239	NC_004113	AGA	2	6	1143990	1143995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298657
21240	NC_004113	TAC	2	6	1144018	1144023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298657
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21243	NC_004113	GATC	2	8	1144174	1144181	25 %	25 %	25 %	25 %	22298657
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21267	NC_004113	CCCG	2	8	1145569	1145576	0 %	0 %	25 %	75 %	22298659
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21329	NC_004113	TGCT	2	8	1149089	1149096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21347	NC_004113	AGGG	2	8	1150307	1150314	25 %	0 %	75 %	0 %	22298662
21348	NC_004113	GGATG	2	10	1150347	1150356	20 %	20 %	60 %	0 %	22298662
21349	NC_004113	TGAA	2	8	1150367	1150374	50 %	25 %	25 %	0 %	22298662
21350	NC_004113	GAC	2	6	1150415	1150420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21352	NC_004113	ATA	2	6	1150469	1150474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21353	NC_004113	GAA	2	6	1150538	1150543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21354	NC_004113	CTC	2	6	1150589	1150594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21355	NC_004113	AC	3	6	1150644	1150649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21356	NC_004113	ACA	2	6	1150661	1150666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21357	NC_004113	ACC	2	6	1150767	1150772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21358	NC_004113	CAAA	2	8	1150815	1150822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21359	NC_004113	CAT	2	6	1150849	1150854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21361	NC_004113	CCG	2	6	1151064	1151069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21362	NC_004113	GA	3	6	1151114	1151119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21363	NC_004113	CCA	2	6	1151145	1151150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21366	NC_004113	CCT	2	6	1151446	1151451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21392	NC_004113	T	6	6	1152926	1152931	0 %	100 %	0 %	0 %	22298664
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21479	NC_004113	ATC	2	6	1157397	1157402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298668
21480	NC_004113	CCT	2	6	1157479	1157484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298668
21481	NC_004113	CAC	2	6	1157552	1157557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298668
21482	NC_004113	AGG	2	6	1157614	1157619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298668
21483	NC_004113	GGC	3	9	1157627	1157635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298668
21484	NC_004113	TCT	2	6	1157649	1157654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298668
21485	NC_004113	ACT	2	6	1157687	1157692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298668
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21488	NC_004113	GTG	2	6	1157784	1157789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298668
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