MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_004113	C	6	6	1103419	1103424	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
20503	NC_004113	GCCC	2	8	1103446	1103453	0 %	0 %	25 %	75 %	22298610
20504	NC_004113	A	6	6	1103477	1103482	100 %	0 %	0 %	0 %	22298610
20505	NC_004113	A	6	6	1103491	1103496	100 %	0 %	0 %	0 %	22298610
20506	NC_004113	GAA	2	6	1103524	1103529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298610
20507	NC_004113	CT	3	6	1103633	1103638	0 %	50 %	0 %	50 %	22298610
20508	NC_004113	GCC	2	6	1103653	1103658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
20509	NC_004113	TGG	2	6	1103696	1103701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298610
20510	NC_004113	ACC	2	6	1103848	1103853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298610
20511	NC_004113	CTC	2	6	1103854	1103859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298610
20512	NC_004113	GGC	2	6	1103899	1103904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298610
20513	NC_004113	GGT	2	6	1103964	1103969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298610
20514	NC_004113	G	6	6	1104017	1104022	0 %	0 %	100 %	0 %	22298610
20515	NC_004113	TCG	2	6	1104047	1104052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298610
20516	NC_004113	TGC	2	6	1104054	1104059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298610
20517	NC_004113	GAT	2	6	1104061	1104066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298610
20518	NC_004113	ATC	2	6	1104124	1104129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298610
20519	NC_004113	TAA	2	6	1104138	1104143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298610
20520	NC_004113	GCG	2	6	1104221	1104226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298610
20521	NC_004113	CCGCC	2	10	1104333	1104342	0 %	0 %	20 %	80 %	22298610
20522	NC_004113	TGG	2	6	1104437	1104442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298610
20523	NC_004113	TGAT	2	8	1104473	1104480	25 %	50 %	25 %	0 %	22298610
20524	NC_004113	GCA	2	6	1104502	1104507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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20526	NC_004113	CTG	2	6	1104551	1104556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298610
20527	NC_004113	GCC	2	6	1104592	1104597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
20528	NC_004113	GAGC	2	8	1104613	1104620	25 %	0 %	50 %	25 %	22298610
20529	NC_004113	CGC	2	6	1104621	1104626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
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20531	NC_004113	CGC	2	6	1104664	1104669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
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20533	NC_004113	CAAC	2	8	1104780	1104787	50 %	0 %	0 %	50 %	22298610
20534	NC_004113	GGC	2	6	1104822	1104827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298610
20535	NC_004113	GCC	3	9	1104862	1104870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
20536	NC_004113	AGT	2	6	1104871	1104876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298610
20537	NC_004113	TCA	2	6	1104881	1104886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298610
20538	NC_004113	ACC	2	6	1104898	1104903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298610
20539	NC_004113	GCG	2	6	1104925	1104930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298610
20540	NC_004113	AGC	2	6	1104932	1104937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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20542	NC_004113	TGA	2	6	1104981	1104986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298610
20543	NC_004113	TGG	2	6	1105025	1105030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298610
20544	NC_004113	GAA	2	6	1105033	1105038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298610
20545	NC_004113	GC	3	6	1105056	1105061	0 %	0 %	50 %	50 %	22298610
20546	NC_004113	GTG	2	6	1105084	1105089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298610
20547	NC_004113	TGC	2	6	1105142	1105147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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20550	NC_004113	AGGA	2	8	1105268	1105275	50 %	0 %	50 %	0 %	22298610
20551	NC_004113	AAACT	2	10	1105338	1105347	60 %	20 %	0 %	20 %	22298610
20552	NC_004113	GAG	2	6	1105396	1105401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20553	NC_004113	CGT	2	6	1105420	1105425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298611
20554	NC_004113	GCGATC	2	12	1105459	1105470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298611
20555	NC_004113	TGG	2	6	1105605	1105610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298611
20556	NC_004113	T	6	6	1105622	1105627	0 %	100 %	0 %	0 %	22298611
20557	NC_004113	TGA	2	6	1105635	1105640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298611
20558	NC_004113	AGTT	2	8	1105649	1105656	25 %	50 %	25 %	0 %	22298611
20559	NC_004113	CTG	2	6	1105742	1105747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298611
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20563	NC_004113	TTG	2	6	1106039	1106044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298611
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20573	NC_004113	TTTCC	2	10	1106442	1106451	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20574	NC_004113	TGC	2	6	1106508	1106513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298612
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20577	NC_004113	T	6	6	1106939	1106944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20587	NC_004113	TAC	2	6	1107369	1107374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298614
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20591	NC_004113	CGC	2	6	1107513	1107518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298614
20592	NC_004113	GTA	2	6	1107535	1107540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298614
20593	NC_004113	TC	3	6	1107551	1107556	0 %	50 %	0 %	50 %	22298614
20594	NC_004113	AAGG	2	8	1107603	1107610	50 %	0 %	50 %	0 %	22298614
20595	NC_004113	ACT	2	6	1107613	1107618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298614
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20601	NC_004113	CTG	3	9	1107943	1107951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298614
20602	NC_004113	CTTTGC	2	12	1107999	1108010	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22298614
20603	NC_004113	GCG	2	6	1108059	1108064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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20606	NC_004113	CCAA	2	8	1108221	1108228	50 %	0 %	0 %	50 %	22298615
20607	NC_004113	CAT	2	6	1108276	1108281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298615
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20615	NC_004113	CGG	2	6	1108538	1108543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298615
20616	NC_004113	A	6	6	1108587	1108592	100 %	0 %	0 %	0 %	22298615
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20618	NC_004113	GAG	2	6	1108631	1108636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298615
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20854	NC_004113	CTG	2	6	1121639	1121644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298632
20855	NC_004113	CTA	2	6	1121662	1121667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298632
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20972	NC_004113	GCC	2	6	1128538	1128543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298638
20973	NC_004113	CAA	2	6	1128575	1128580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298638
20974	NC_004113	AGC	2	6	1128601	1128606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298638
20975	NC_004113	CAT	2	6	1128654	1128659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298638
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20978	NC_004113	TCAA	2	8	1128754	1128761	50 %	25 %	0 %	25 %	22298639
20979	NC_004113	CAA	2	6	1128807	1128812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298639
20980	NC_004113	CAC	2	6	1128849	1128854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298639
20981	NC_004113	GC	3	6	1129026	1129031	0 %	0 %	50 %	50 %	22298639
20982	NC_004113	CGT	2	6	1129242	1129247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298639
20983	NC_004113	ATG	2	6	1129324	1129329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298639
20984	NC_004113	TCA	2	6	1129366	1129371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298639
20985	NC_004113	AAAC	2	8	1129388	1129395	75 %	0 %	0 %	25 %	22298639
20986	NC_004113	GGC	2	6	1129494	1129499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298639
20987	NC_004113	CGG	2	6	1129510	1129515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298639
20988	NC_004113	GAT	2	6	1129518	1129523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298639
20989	NC_004113	CAA	2	6	1129552	1129557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20990	NC_004113	T	6	6	1129609	1129614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20991	NC_004113	ACCCC	2	10	1129753	1129762	20 %	0 %	0 %	80 %	22298640
20992	NC_004113	C	6	6	1129759	1129764	0 %	0 %	0 %	100 %	22298640
20993	NC_004113	GCA	2	6	1129769	1129774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640
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20995	NC_004113	GAATCG	2	12	1129844	1129855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22298640
20996	NC_004113	CAAT	2	8	1129916	1129923	50 %	25 %	0 %	25 %	22298640
20997	NC_004113	TGA	2	6	1129975	1129980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298640
20998	NC_004113	GGA	2	6	1129991	1129996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298640
20999	NC_004113	AGC	2	6	1130091	1130096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640
21000	NC_004113	AGC	2	6	1130107	1130112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640

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