MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_004113	CCACC	2	10	1048503	1048512	20 %	0 %	0 %	80 %	22298565
19502	NC_004113	GAC	2	6	1048515	1048520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19503	NC_004113	TCCCC	2	10	1048622	1048631	0 %	20 %	0 %	80 %	22298565
19504	NC_004113	GCA	2	6	1048824	1048829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19505	NC_004113	TCA	2	6	1048862	1048867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298565
19506	NC_004113	GCT	2	6	1048893	1048898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19507	NC_004113	CAC	2	6	1048975	1048980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298565
19508	NC_004113	G	6	6	1049017	1049022	0 %	0 %	100 %	0 %	22298565
19509	NC_004113	CCA	3	9	1049115	1049123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298565
19510	NC_004113	GCA	2	6	1049172	1049177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19511	NC_004113	TGG	2	6	1049223	1049228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298565
19512	NC_004113	GCA	2	6	1049334	1049339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19513	NC_004113	GGT	2	6	1049371	1049376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298565
19514	NC_004113	GTG	2	6	1049393	1049398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298565
19515	NC_004113	CAC	2	6	1049437	1049442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298565
19516	NC_004113	CCCAC	2	10	1049450	1049459	20 %	0 %	0 %	80 %	22298565
19517	NC_004113	GA	3	6	1049465	1049470	50 %	0 %	50 %	0 %	22298565
19518	NC_004113	TCAC	2	8	1049471	1049478	25 %	25 %	0 %	50 %	22298565
19519	NC_004113	CAT	2	6	1049616	1049621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298565
19520	NC_004113	TGC	2	6	1049699	1049704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19521	NC_004113	TGC	2	6	1049774	1049779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19522	NC_004113	C	6	6	1049807	1049812	0 %	0 %	0 %	100 %	22298565
19523	NC_004113	TGG	2	6	1049837	1049842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298565
19524	NC_004113	TTGG	2	8	1050104	1050111	0 %	50 %	50 %	0 %	22298565
19525	NC_004113	G	6	6	1050129	1050134	0 %	0 %	100 %	0 %	22298565
19526	NC_004113	GCT	2	6	1050195	1050200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19527	NC_004113	CTG	2	6	1050226	1050231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19528	NC_004113	GGTT	2	8	1050361	1050368	0 %	50 %	50 %	0 %	22298565
19529	NC_004113	CTGC	2	8	1050393	1050400	0 %	25 %	25 %	50 %	22298565
19530	NC_004113	GAC	2	6	1050408	1050413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19531	NC_004113	GCT	2	6	1050458	1050463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19532	NC_004113	TGC	2	6	1050488	1050493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19533	NC_004113	CTC	2	6	1050604	1050609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298565
19534	NC_004113	G	6	6	1050640	1050645	0 %	0 %	100 %	0 %	22298565
19535	NC_004113	G	6	6	1050655	1050660	0 %	0 %	100 %	0 %	22298565
19536	NC_004113	AGGA	2	8	1050663	1050670	50 %	0 %	50 %	0 %	22298565
19537	NC_004113	GCA	2	6	1050701	1050706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298565
19538	NC_004113	G	6	6	1050721	1050726	0 %	0 %	100 %	0 %	22298565
19539	NC_004113	GGC	3	9	1050754	1050762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298565
19540	NC_004113	AGA	2	6	1050797	1050802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298565
19541	NC_004113	TGA	2	6	1050803	1050808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298565
19542	NC_004113	CCTT	2	8	1050833	1050840	0 %	50 %	0 %	50 %	22298565
19543	NC_004113	GCC	2	6	1050929	1050934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298565
19544	NC_004113	ACC	2	6	1050986	1050991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298565
19545	NC_004113	GAG	2	6	1051009	1051014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298565
19546	NC_004113	CGG	2	6	1051083	1051088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298565
19547	NC_004113	CATGG	2	10	1051181	1051190	20 %	20 %	40 %	20 %	22298566
19548	NC_004113	CAG	3	9	1051195	1051203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298566
19549	NC_004113	GTT	3	9	1051212	1051220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298566
19550	NC_004113	AATC	2	8	1051315	1051322	50 %	25 %	0 %	25 %	22298566
19551	NC_004113	GTTG	2	8	1051324	1051331	0 %	50 %	50 %	0 %	22298566
19552	NC_004113	CTG	2	6	1051439	1051444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298566
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19554	NC_004113	GGTT	2	8	1051588	1051595	0 %	50 %	50 %	0 %	22298566
19555	NC_004113	TGA	2	6	1051621	1051626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298566
19556	NC_004113	GGA	2	6	1051643	1051648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298566
19557	NC_004113	GGT	2	6	1051718	1051723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298566
19558	NC_004113	TGG	2	6	1051729	1051734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298566
19559	NC_004113	TGC	2	6	1051748	1051753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298566
19560	NC_004113	GCT	3	9	1051776	1051784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298566
19561	NC_004113	GGC	2	6	1051817	1051822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298566
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19564	NC_004113	TTGGAC	2	12	1051946	1051957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22298566
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19567	NC_004113	CTG	4	12	1052174	1052185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298566
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19571	NC_004113	GGGGCA	2	12	1052394	1052405	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	22298566
19572	NC_004113	CGG	2	6	1052494	1052499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298566
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19576	NC_004113	TCCA	2	8	1052743	1052750	25 %	25 %	0 %	50 %	22298567
19577	NC_004113	CTG	2	6	1052773	1052778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298567
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19586	NC_004113	CAT	2	6	1053163	1053168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298567
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19588	NC_004113	C	7	7	1053246	1053252	0 %	0 %	0 %	100 %	22298568
19589	NC_004113	GAG	2	6	1053321	1053326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298568
19590	NC_004113	ATGA	2	8	1053541	1053548	50 %	25 %	25 %	0 %	22298568
19591	NC_004113	TGC	2	6	1053557	1053562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298569
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19595	NC_004113	GTTG	2	8	1053822	1053829	0 %	50 %	50 %	0 %	22298569
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19599	NC_004113	CTCG	2	8	1054126	1054133	0 %	25 %	25 %	50 %	22298569
19600	NC_004113	GCG	2	6	1054159	1054164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298569
19601	NC_004113	CA	3	6	1054238	1054243	50 %	0 %	0 %	50 %	22298569
19602	NC_004113	CTT	2	6	1054321	1054326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298569
19603	NC_004113	AAAGAG	2	12	1054331	1054342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298569
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19605	NC_004113	GATACT	2	12	1054396	1054407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22298569
19606	NC_004113	GTG	2	6	1054428	1054433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298569
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19608	NC_004113	TGCT	2	8	1054672	1054679	0 %	50 %	25 %	25 %	22298569
19609	NC_004113	GATA	2	8	1054708	1054715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_004113	CCG	2	6	1054736	1054741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19611	NC_004113	AACAAA	2	12	1054861	1054872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19612	NC_004113	A	7	7	1054930	1054936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19613	NC_004113	A	6	6	1055030	1055035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_004113	T	6	6	1055052	1055057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19615	NC_004113	CTA	2	6	1055169	1055174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298570
19616	NC_004113	AGT	2	6	1055199	1055204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298570
19617	NC_004113	TGA	2	6	1055224	1055229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298570
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19619	NC_004113	CTCAAA	2	12	1055419	1055430	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19978	NC_004113	GGTTGA	2	12	1076674	1076685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22298586
19979	NC_004113	GCT	2	6	1076724	1076729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298586
19980	NC_004113	CGT	2	6	1076760	1076765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298586
19981	NC_004113	AAT	2	6	1076771	1076776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298586
19982	NC_004113	ATC	2	6	1076811	1076816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298586
19983	NC_004113	AAT	2	6	1076911	1076916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298586
19984	NC_004113	GTC	2	6	1076950	1076955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298586
19985	NC_004113	AAT	2	6	1076999	1077004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298586
19986	NC_004113	CTG	2	6	1077011	1077016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298586
19987	NC_004113	TGA	2	6	1077036	1077041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298586
19988	NC_004113	GGC	2	6	1077091	1077096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298586
19989	NC_004113	CCG	3	9	1077151	1077159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298586
19990	NC_004113	GCGT	2	8	1077196	1077203	0 %	25 %	50 %	25 %	22298586
19991	NC_004113	GCG	2	6	1077214	1077219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298586
19992	NC_004113	GGCG	2	8	1077231	1077238	0 %	0 %	75 %	25 %	22298586
19993	NC_004113	T	8	8	1077240	1077247	0 %	100 %	0 %	0 %	22298586
19994	NC_004113	CAT	2	6	1077336	1077341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19995	NC_004113	AG	3	6	1077364	1077369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19996	NC_004113	AGCC	2	8	1077376	1077383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19997	NC_004113	TC	3	6	1077424	1077429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19998	NC_004113	AGTA	2	8	1077494	1077501	50 %	25 %	25 %	0 %	22298587
19999	NC_004113	ACC	2	6	1077611	1077616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298587
20000	NC_004113	ATCA	2	8	1077775	1077782	50 %	25 %	0 %	25 %	22298587

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