MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_004113	ACTTC	2	10	1020418	1020427	20 %	40 %	0 %	40 %	22298537
19002	NC_004113	CGATG	2	10	1020428	1020437	20 %	20 %	40 %	20 %	22298537
19003	NC_004113	CAT	2	6	1020574	1020579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298538
19004	NC_004113	GTA	2	6	1020599	1020604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298538
19005	NC_004113	AG	3	6	1020622	1020627	50 %	0 %	50 %	0 %	22298538
19006	NC_004113	AAT	2	6	1020629	1020634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298538
19007	NC_004113	T	6	6	1020672	1020677	0 %	100 %	0 %	0 %	22298538
19008	NC_004113	GAT	2	6	1020695	1020700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298538
19009	NC_004113	TA	5	10	1020751	1020760	50 %	50 %	0 %	0 %	22298538
19010	NC_004113	A	7	7	1020807	1020813	100 %	0 %	0 %	0 %	22298538
19011	NC_004113	TGA	2	6	1020836	1020841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298538
19012	NC_004113	GATT	2	8	1020847	1020854	25 %	50 %	25 %	0 %	22298538
19013	NC_004113	CTT	2	6	1020856	1020861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298538
19014	NC_004113	TTA	2	6	1020865	1020870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298538
19015	NC_004113	ATTGG	2	10	1020894	1020903	20 %	40 %	40 %	0 %	22298538
19016	NC_004113	GCG	2	6	1020941	1020946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298538
19017	NC_004113	AGCC	2	8	1021079	1021086	25 %	0 %	25 %	50 %	22298538
19018	NC_004113	ATC	2	6	1021103	1021108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298538
19019	NC_004113	T	8	8	1021182	1021189	0 %	100 %	0 %	0 %	22298538
19020	NC_004113	TCA	2	6	1021251	1021256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298538
19021	NC_004113	AAT	2	6	1021274	1021279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298538
19022	NC_004113	AAC	2	6	1021308	1021313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298538
19023	NC_004113	CTC	2	6	1021324	1021329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298538
19024	NC_004113	TAA	2	6	1021330	1021335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298538
19025	NC_004113	ATA	2	6	1021461	1021466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_004113	AGA	3	9	1021610	1021618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_004113	TGG	2	6	1021624	1021629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_004113	CAGTT	2	10	1021672	1021681	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19029	NC_004113	GCT	3	9	1021710	1021718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_004113	T	6	6	1021743	1021748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_004113	GTC	2	6	1021948	1021953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298539
19032	NC_004113	GAT	2	6	1021986	1021991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298539
19033	NC_004113	GGC	2	6	1022025	1022030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298539
19034	NC_004113	TCG	2	6	1022034	1022039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298539
19035	NC_004113	TTG	2	6	1022153	1022158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298539
19036	NC_004113	CCA	2	6	1022166	1022171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298539
19037	NC_004113	TGG	2	6	1022438	1022443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298539
19038	NC_004113	TGA	2	6	1022528	1022533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298539
19039	NC_004113	TGC	2	6	1022535	1022540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298539
19040	NC_004113	TGGCGA	2	12	1022613	1022624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	22298539
19041	NC_004113	CCG	2	6	1022645	1022650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298539
19042	NC_004113	CCT	2	6	1022661	1022666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298539
19043	NC_004113	GT	3	6	1022693	1022698	0 %	50 %	50 %	0 %	22298539
19044	NC_004113	GCG	2	6	1022763	1022768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298539
19045	NC_004113	TGG	2	6	1022774	1022779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298539
19046	NC_004113	CCT	2	6	1022795	1022800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298539
19047	NC_004113	CCA	2	6	1022852	1022857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298539
19048	NC_004113	GAG	2	6	1023086	1023091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_004113	CGC	2	6	1023131	1023136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298540
19050	NC_004113	CTG	2	6	1023293	1023298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298540
19051	NC_004113	G	7	7	1023409	1023415	0 %	0 %	100 %	0 %	22298540
19052	NC_004113	GAT	2	6	1023481	1023486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_004113	GTT	2	6	1023521	1023526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_004113	CCGAA	2	10	1023599	1023608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19055	NC_004113	GAG	2	6	1023628	1023633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_004113	TCG	2	6	1023789	1023794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_004113	CAC	2	6	1023828	1023833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19058	NC_004113	AGGC	2	8	1023895	1023902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19059	NC_004113	AAT	2	6	1023992	1023997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_004113	CCCG	2	8	1024008	1024015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19061	NC_004113	CTG	2	6	1024032	1024037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19062	NC_004113	GACAA	2	10	1024079	1024088	60 %	0 %	20 %	20 %	22298541
19063	NC_004113	ACCA	2	8	1024119	1024126	50 %	0 %	0 %	50 %	22298541
19064	NC_004113	GAAG	2	8	1024211	1024218	50 %	0 %	50 %	0 %	22298541
19065	NC_004113	CA	3	6	1024349	1024354	50 %	0 %	0 %	50 %	22298541
19066	NC_004113	AACCCC	2	12	1024402	1024413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298541
19067	NC_004113	GCCCTA	2	12	1024503	1024514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298541
19068	NC_004113	GT	3	6	1024549	1024554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_004113	G	7	7	1024668	1024674	0 %	0 %	100 %	0 %	22298542
19070	NC_004113	TCA	2	6	1024698	1024703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298542
19071	NC_004113	GAA	2	6	1024771	1024776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298542
19072	NC_004113	CGA	2	6	1024843	1024848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298542
19073	NC_004113	ATC	2	6	1024868	1024873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298542
19074	NC_004113	GGC	2	6	1024919	1024924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298542
19075	NC_004113	CAG	2	6	1025015	1025020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298542
19076	NC_004113	T	6	6	1025232	1025237	0 %	100 %	0 %	0 %	22298543
19077	NC_004113	CTT	2	6	1025288	1025293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298543
19078	NC_004113	TGC	2	6	1025298	1025303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298543
19079	NC_004113	GAC	2	6	1025345	1025350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298543
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19081	NC_004113	ACA	2	6	1025510	1025515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19082	NC_004113	CTA	2	6	1025530	1025535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19083	NC_004113	AGC	2	6	1025597	1025602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19084	NC_004113	CCAT	2	8	1025612	1025619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19085	NC_004113	AGGG	2	8	1025633	1025640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19086	NC_004113	GGATG	2	10	1025673	1025682	20 %	20 %	60 %	0 %	22298544
19087	NC_004113	GCA	3	9	1025785	1025793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298544
19088	NC_004113	GAA	2	6	1025863	1025868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298544
19089	NC_004113	ATG	2	6	1025903	1025908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298544
19090	NC_004113	TCA	2	6	1025918	1025923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298544
19091	NC_004113	GAA	3	9	1025931	1025939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298544
19092	NC_004113	AC	3	6	1026014	1026019	50 %	0 %	0 %	50 %	22298544
19093	NC_004113	ATC	2	6	1026028	1026033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298544
19094	NC_004113	ACTA	2	8	1026043	1026050	50 %	25 %	0 %	25 %	22298544
19095	NC_004113	TCG	2	6	1026080	1026085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298544
19096	NC_004113	ACC	2	6	1026092	1026097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298544
19097	NC_004113	AGTA	2	8	1026166	1026173	50 %	25 %	25 %	0 %	22298544
19098	NC_004113	AGC	2	6	1026344	1026349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298544
19099	NC_004113	GAA	2	6	1026405	1026410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298544
19100	NC_004113	GGC	2	6	1026415	1026420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298544
19101	NC_004113	CCA	2	6	1026471	1026476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298544
19102	NC_004113	GGT	2	6	1026496	1026501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298544
19103	NC_004113	GAC	2	6	1026505	1026510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298544
19104	NC_004113	AGG	2	6	1026650	1026655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_004113	C	6	6	1026672	1026677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19106	NC_004113	GGC	2	6	1026723	1026728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298545
19107	NC_004113	TTG	2	6	1026797	1026802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298545
19108	NC_004113	ATG	2	6	1026806	1026811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298545
19109	NC_004113	CAG	2	6	1026813	1026818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298545
19110	NC_004113	GATG	2	8	1026852	1026859	25 %	25 %	50 %	0 %	22298545
19111	NC_004113	GCT	2	6	1026897	1026902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298546
19112	NC_004113	GGT	2	6	1026916	1026921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298546
19113	NC_004113	CATAGG	2	12	1026927	1026938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22298546
19114	NC_004113	CAAT	2	8	1026975	1026982	50 %	25 %	0 %	25 %	22298546
19115	NC_004113	TCA	2	6	1027065	1027070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298546
19116	NC_004113	GATA	2	8	1027076	1027083	50 %	25 %	25 %	0 %	22298546
19117	NC_004113	GTG	2	6	1027127	1027132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298546
19118	NC_004113	TCT	2	6	1027184	1027189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298546
19119	NC_004113	GTAG	2	8	1027218	1027225	25 %	25 %	50 %	0 %	22298546
19120	NC_004113	GTA	2	6	1027234	1027239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298546
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19132	NC_004113	GCA	2	6	1027841	1027846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298546
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19234	NC_004113	ATC	2	6	1033999	1034004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298551
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19238	NC_004113	TTGG	2	8	1034127	1034134	0 %	50 %	50 %	0 %	22298552
19239	NC_004113	TCA	2	6	1034200	1034205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298552
19240	NC_004113	AAG	2	6	1034209	1034214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298552
19241	NC_004113	AGCA	2	8	1034267	1034274	50 %	0 %	25 %	25 %	22298552
19242	NC_004113	TTG	2	6	1034354	1034359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298552
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19257	NC_004113	CAA	2	6	1035359	1035364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298553
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19323	NC_004113	T	6	6	1038663	1038668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19358	NC_004113	ATTC	2	8	1040538	1040545	25 %	50 %	0 %	25 %	22298558
19359	NC_004113	GAT	2	6	1040569	1040574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298558
19360	NC_004113	CAA	2	6	1040588	1040593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298558
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19362	NC_004113	AAGTG	2	10	1040780	1040789	40 %	20 %	40 %	0 %	22298558
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19365	NC_004113	CAT	2	6	1041103	1041108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298558
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19371	NC_004113	CTG	3	9	1041483	1041491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298558
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19373	NC_004113	AAAT	2	8	1041604	1041611	75 %	25 %	0 %	0 %	22298558
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19392	NC_004113	AGC	2	6	1042322	1042327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298559
19393	NC_004113	TTGT	2	8	1042331	1042338	0 %	75 %	25 %	0 %	22298559
19394	NC_004113	ATC	2	6	1042367	1042372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298559
19395	NC_004113	CTCA	2	8	1042451	1042458	25 %	25 %	0 %	50 %	22298559
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19397	NC_004113	ATCA	2	8	1042523	1042530	50 %	25 %	0 %	25 %	22298559
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19401	NC_004113	GTT	2	6	1042959	1042964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19467	NC_004113	TGCT	2	8	1046693	1046700	0 %	50 %	25 %	25 %	22298564
19468	NC_004113	GCA	2	6	1046848	1046853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298564
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19471	NC_004113	CTG	2	6	1046933	1046938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298564
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19478	NC_004113	ATTC	2	8	1047301	1047308	25 %	50 %	0 %	25 %	22298564
19479	NC_004113	CCA	2	6	1047311	1047316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298564
19480	NC_004113	AGG	2	6	1047349	1047354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298564
19481	NC_004113	GCC	2	6	1047450	1047455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298564
19482	NC_004113	AGGT	2	8	1047585	1047592	25 %	25 %	50 %	0 %	22298564
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19490	NC_004113	CTA	2	6	1047888	1047893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298564
19491	NC_004113	TTG	2	6	1047894	1047899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298564
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19498	NC_004113	TTC	2	6	1048358	1048363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298564
19499	NC_004113	CT	3	6	1048384	1048389	0 %	50 %	0 %	50 %	22298564
19500	NC_004113	CAATC	2	10	1048469	1048478	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

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