MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_004113	G	6	6	994243	994248	0 %	0 %	100 %	0 %	22298514
18502	NC_004113	GAT	2	6	994269	994274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_004113	CTC	2	6	994294	994299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298515
18504	NC_004113	CTT	2	6	994314	994319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298515
18505	NC_004113	CGT	3	9	994320	994328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298515
18506	NC_004113	ATC	2	6	994372	994377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298515
18507	NC_004113	GCA	2	6	994478	994483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298515
18508	NC_004113	TTC	2	6	994507	994512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298515
18509	NC_004113	CAGG	2	8	994643	994650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18510	NC_004113	CAAG	2	8	994719	994726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18511	NC_004113	GAG	2	6	994797	994802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_004113	TGA	2	6	994900	994905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18513	NC_004113	ATCCT	2	10	994943	994952	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18514	NC_004113	AGC	2	6	994958	994963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18515	NC_004113	CGC	2	6	994976	994981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18516	NC_004113	ACC	2	6	994988	994993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18517	NC_004113	CAA	2	6	995127	995132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298516
18518	NC_004113	CAG	2	6	995134	995139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298516
18519	NC_004113	CTC	2	6	995149	995154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298516
18520	NC_004113	CAA	2	6	995170	995175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298516
18521	NC_004113	CGC	2	6	995181	995186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298516
18522	NC_004113	CGCCA	2	10	995254	995263	20 %	0 %	20 %	60 %	22298516
18523	NC_004113	TGC	2	6	995279	995284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298516
18524	NC_004113	GCCG	2	8	995329	995336	0 %	0 %	50 %	50 %	22298516
18525	NC_004113	C	6	6	995353	995358	0 %	0 %	0 %	100 %	22298516
18526	NC_004113	TCG	3	9	995471	995479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298516
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18529	NC_004113	GGT	2	6	995538	995543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298516
18530	NC_004113	CGT	2	6	995565	995570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298516
18531	NC_004113	GTG	2	6	995623	995628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298516
18532	NC_004113	TGG	2	6	995663	995668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298516
18533	NC_004113	CAC	2	6	995733	995738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298516
18534	NC_004113	CA	3	6	995757	995762	50 %	0 %	0 %	50 %	22298516
18535	NC_004113	ACC	2	6	995824	995829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298516
18536	NC_004113	GGGT	2	8	995851	995858	0 %	25 %	75 %	0 %	22298516
18537	NC_004113	AGGGG	2	10	995871	995880	20 %	0 %	80 %	0 %	22298516
18538	NC_004113	GTG	2	6	996014	996019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298516
18539	NC_004113	CAAC	2	8	996118	996125	50 %	0 %	0 %	50 %	22298516
18540	NC_004113	AAC	2	6	996151	996156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298516
18541	NC_004113	TCGC	2	8	996194	996201	0 %	25 %	25 %	50 %	22298516
18542	NC_004113	AGC	2	6	996224	996229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298516
18543	NC_004113	CAAC	2	8	996256	996263	50 %	0 %	0 %	50 %	22298516
18544	NC_004113	GGCAG	2	10	996316	996325	20 %	0 %	60 %	20 %	22298516
18545	NC_004113	CAAC	2	8	996394	996401	50 %	0 %	0 %	50 %	22298516
18546	NC_004113	TCGC	2	8	996470	996477	0 %	25 %	25 %	50 %	22298516
18547	NC_004113	TCGC	2	8	996608	996615	0 %	25 %	25 %	50 %	22298516
18548	NC_004113	TTG	2	6	996647	996652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298516
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18550	NC_004113	TCGC	2	8	996743	996750	0 %	25 %	25 %	50 %	22298516
18551	NC_004113	CGCC	2	8	996882	996889	0 %	0 %	25 %	75 %	22298516
18552	NC_004113	CAG	2	6	997072	997077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298516
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18554	NC_004113	GGCAG	2	10	997141	997150	20 %	0 %	60 %	20 %	22298516
18555	NC_004113	CAAC	2	8	997219	997226	50 %	0 %	0 %	50 %	22298516
18556	NC_004113	AACA	2	8	997252	997259	75 %	0 %	0 %	25 %	22298516
18557	NC_004113	TCGC	2	8	997295	997302	0 %	25 %	25 %	50 %	22298516
18558	NC_004113	GGA	2	6	997368	997373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298516
18559	NC_004113	G	8	8	997394	997401	0 %	0 %	100 %	0 %	22298516
18560	NC_004113	CTT	2	6	997420	997425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298516
18561	NC_004113	TGA	2	6	997448	997453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298516
18562	NC_004113	GCG	2	6	997494	997499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18563	NC_004113	CTG	3	9	997652	997660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298517
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18567	NC_004113	ATCG	2	8	997907	997914	25 %	25 %	25 %	25 %	22298517
18568	NC_004113	CGG	2	6	997962	997967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298517
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18570	NC_004113	CGA	2	6	998017	998022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298517
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18572	NC_004113	CT	3	6	998190	998195	0 %	50 %	0 %	50 %	22298517
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18576	NC_004113	TGA	2	6	998377	998382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298518
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18579	NC_004113	TGC	2	6	998456	998461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298518
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18587	NC_004113	CTG	2	6	998885	998890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298518
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18619	NC_004113	GACT	2	8	1000927	1000934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18620	NC_004113	CT	3	6	1000933	1000938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18621	NC_004113	GGC	2	6	1000959	1000964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18623	NC_004113	TGG	2	6	1001015	1001020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_004113	CT	3	6	1001052	1001057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18625	NC_004113	A	7	7	1001128	1001134	100 %	0 %	0 %	0 %	22298520
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18631	NC_004113	CCTG	2	8	1001415	1001422	0 %	25 %	25 %	50 %	22298520
18632	NC_004113	G	6	6	1001446	1001451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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18648	NC_004113	ACGG	2	8	1002237	1002244	25 %	0 %	50 %	25 %	22298521
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18743	NC_004113	GGC	2	6	1007266	1007271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298527
18744	NC_004113	TGC	3	9	1007323	1007331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298527
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18752	NC_004113	TGC	2	6	1007659	1007664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298527
18753	NC_004113	CTG	2	6	1007691	1007696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298527
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18858	NC_004113	TCT	2	6	1012788	1012793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298530
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18981	NC_004113	TGA	2	6	1019615	1019620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298536
18982	NC_004113	CACAA	2	10	1019629	1019638	60 %	0 %	0 %	40 %	22298536
18983	NC_004113	TCCA	2	8	1019639	1019646	25 %	25 %	0 %	50 %	22298536
18984	NC_004113	GT	3	6	1019663	1019668	0 %	50 %	50 %	0 %	22298537
18985	NC_004113	GAC	2	6	1019706	1019711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298537
18986	NC_004113	C	6	6	1019738	1019743	0 %	0 %	0 %	100 %	22298537
18987	NC_004113	ATGAT	2	10	1019767	1019776	40 %	40 %	20 %	0 %	22298537
18988	NC_004113	CAC	2	6	1019819	1019824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298537
18989	NC_004113	TCG	2	6	1019887	1019892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298537
18990	NC_004113	T	6	6	1019921	1019926	0 %	100 %	0 %	0 %	22298537
18991	NC_004113	ATC	2	6	1019929	1019934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298537
18992	NC_004113	TTG	2	6	1019998	1020003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298537
18993	NC_004113	CGG	2	6	1020016	1020021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298537
18994	NC_004113	GCA	2	6	1020067	1020072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298537
18995	NC_004113	ATG	2	6	1020115	1020120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298537
18996	NC_004113	TCGC	2	8	1020141	1020148	0 %	25 %	25 %	50 %	22298537
18997	NC_004113	A	6	6	1020253	1020258	100 %	0 %	0 %	0 %	22298537
18998	NC_004113	CAA	2	6	1020267	1020272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298537
18999	NC_004113	CA	3	6	1020291	1020296	50 %	0 %	0 %	50 %	22298537
19000	NC_004113	CGC	2	6	1020358	1020363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298537

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