MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004113	GCA	2	6	917418	917423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298443
17002	NC_004113	TCAC	2	8	917445	917452	25 %	25 %	0 %	50 %	22298443
17003	NC_004113	AGC	2	6	917459	917464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298443
17004	NC_004113	AGG	2	6	917483	917488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298443
17005	NC_004113	CGT	2	6	917514	917519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298443
17006	NC_004113	TCGC	2	8	917803	917810	0 %	25 %	25 %	50 %	22298443
17007	NC_004113	GCA	2	6	917870	917875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298444
17008	NC_004113	CG	3	6	917878	917883	0 %	0 %	50 %	50 %	22298444
17009	NC_004113	CCA	2	6	917891	917896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298444
17010	NC_004113	GGCAA	2	10	917920	917929	40 %	0 %	40 %	20 %	22298444
17011	NC_004113	TAG	2	6	917946	917951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298444
17012	NC_004113	CCA	2	6	917954	917959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298444
17013	NC_004113	ATGA	2	8	918018	918025	50 %	25 %	25 %	0 %	22298444
17014	NC_004113	GCT	2	6	918042	918047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298444
17015	NC_004113	GCCA	2	8	918091	918098	25 %	0 %	25 %	50 %	22298444
17016	NC_004113	GCC	2	6	918168	918173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298444
17017	NC_004113	A	6	6	918182	918187	100 %	0 %	0 %	0 %	22298444
17018	NC_004113	GA	3	6	918229	918234	50 %	0 %	50 %	0 %	22298444
17019	NC_004113	TCC	2	6	918249	918254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298444
17020	NC_004113	AGG	2	6	918326	918331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298444
17021	NC_004113	AAC	2	6	918339	918344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298444
17022	NC_004113	CGC	2	6	918381	918386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298444
17023	NC_004113	AGG	3	9	918412	918420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_004113	TCA	2	6	918442	918447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17025	NC_004113	CAT	2	6	918542	918547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298445
17026	NC_004113	TTG	2	6	918621	918626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298445
17027	NC_004113	AAT	3	9	918707	918715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298445
17028	NC_004113	CCG	2	6	918778	918783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298445
17029	NC_004113	TTGT	2	8	918812	918819	0 %	75 %	25 %	0 %	22298445
17030	NC_004113	TACTTT	2	12	918858	918869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17031	NC_004113	GT	3	6	919000	919005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_004113	ATT	2	6	919026	919031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_004113	A	6	6	919038	919043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_004113	CA	3	6	919063	919068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17035	NC_004113	CATA	2	8	919092	919099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17036	NC_004113	TAG	2	6	919117	919122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_004113	T	6	6	919123	919128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_004113	CTT	2	6	919180	919185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298446
17039	NC_004113	AAC	2	6	919319	919324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298446
17040	NC_004113	AGGA	2	8	919381	919388	50 %	0 %	50 %	0 %	22298446
17041	NC_004113	GTCA	2	8	919470	919477	25 %	25 %	25 %	25 %	22298446
17042	NC_004113	GCG	3	9	919511	919519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298446
17043	NC_004113	GCT	2	6	919533	919538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17044	NC_004113	CTC	2	6	919566	919571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298446
17045	NC_004113	GCT	3	9	919638	919646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17046	NC_004113	GC	3	6	919692	919697	0 %	0 %	50 %	50 %	22298446
17047	NC_004113	CCCAAG	2	12	919759	919770	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22298446
17048	NC_004113	GCA	2	6	919793	919798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17049	NC_004113	AAGCC	2	10	919799	919808	40 %	0 %	20 %	40 %	22298446
17050	NC_004113	GCT	2	6	919815	919820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17051	NC_004113	TGC	2	6	919880	919885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17052	NC_004113	GGC	2	6	919939	919944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298446
17053	NC_004113	CAG	2	6	919971	919976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17054	NC_004113	CAA	2	6	920013	920018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298446
17055	NC_004113	GTG	2	6	920061	920066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298446
17056	NC_004113	TTG	2	6	920154	920159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298446
17057	NC_004113	CGT	2	6	920169	920174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298446
17058	NC_004113	TCC	2	6	920216	920221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298446
17059	NC_004113	TTC	2	6	920266	920271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298446
17060	NC_004113	GAT	2	6	920322	920327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298446
17061	NC_004113	TATC	2	8	920473	920480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17062	NC_004113	T	7	7	920770	920776	0 %	100 %	0 %	0 %	22298447
17063	NC_004113	TGCA	2	8	920783	920790	25 %	25 %	25 %	25 %	22298447
17064	NC_004113	CCAA	2	8	920813	920820	50 %	0 %	0 %	50 %	22298447
17065	NC_004113	CCA	2	6	920821	920826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298447
17066	NC_004113	GAC	2	6	920898	920903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298447
17067	NC_004113	CTT	2	6	920991	920996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298447
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17070	NC_004113	TC	3	6	921049	921054	0 %	50 %	0 %	50 %	22298447
17071	NC_004113	AACC	2	8	921121	921128	50 %	0 %	0 %	50 %	22298447
17072	NC_004113	TGG	2	6	921131	921136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298447
17073	NC_004113	CTGG	2	8	921217	921224	0 %	25 %	50 %	25 %	22298447
17074	NC_004113	ACG	2	6	921236	921241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298447
17075	NC_004113	GGC	2	6	921246	921251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298447
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17078	NC_004113	TTG	2	6	921487	921492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298447
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17080	NC_004113	ATTGCC	2	12	921529	921540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22298447
17081	NC_004113	GGGT	2	8	921589	921596	0 %	25 %	75 %	0 %	22298447
17082	NC_004113	ATG	2	6	921676	921681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298447
17083	NC_004113	GCA	2	6	921689	921694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298447
17084	NC_004113	TGGG	2	8	921731	921738	0 %	25 %	75 %	0 %	22298447
17085	NC_004113	GCT	2	6	921792	921797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298447
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17087	NC_004113	G	7	7	921874	921880	0 %	0 %	100 %	0 %	22298447
17088	NC_004113	TGA	2	6	921890	921895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298447
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17090	NC_004113	TGC	2	6	922028	922033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298447
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17092	NC_004113	CCTT	2	8	922081	922088	0 %	50 %	0 %	50 %	22298447
17093	NC_004113	G	6	6	922130	922135	0 %	0 %	100 %	0 %	22298447
17094	NC_004113	CTG	2	6	922207	922212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298447
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17099	NC_004113	CTG	2	6	922453	922458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298447
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17101	NC_004113	GCT	2	6	922541	922546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298448
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17103	NC_004113	CTT	2	6	922745	922750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298448
17104	NC_004113	T	6	6	922795	922800	0 %	100 %	0 %	0 %	22298448
17105	NC_004113	CTG	3	9	922857	922865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298448
17106	NC_004113	T	6	6	922866	922871	0 %	100 %	0 %	0 %	22298448
17107	NC_004113	G	8	8	922921	922928	0 %	0 %	100 %	0 %	22298448
17108	NC_004113	CGT	2	6	922932	922937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298448
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17110	NC_004113	CGC	2	6	922994	922999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298448
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17113	NC_004113	GTTG	2	8	923149	923156	0 %	50 %	50 %	0 %	22298448
17114	NC_004113	GGC	2	6	923303	923308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298448
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17123	NC_004113	CTA	2	6	923792	923797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298448
17124	NC_004113	TGCC	2	8	923824	923831	0 %	25 %	25 %	50 %	22298448
17125	NC_004113	CTGG	2	8	923876	923883	0 %	25 %	50 %	25 %	22298448
17126	NC_004113	ACC	2	6	923898	923903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298448
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17128	NC_004113	TTG	2	6	923944	923949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298448
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17159	NC_004113	TCT	2	6	925333	925338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17241	NC_004113	TTAT	2	8	930392	930399	25 %	75 %	0 %	0 %	22298454
17242	NC_004113	A	6	6	930453	930458	100 %	0 %	0 %	0 %	22298454
17243	NC_004113	GAG	2	6	930499	930504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298454
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17489	NC_004113	AATA	2	8	943869	943876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17490	NC_004113	ATAA	2	8	943967	943974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17491	NC_004113	ATC	2	6	943986	943991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17492	NC_004113	GA	3	6	944003	944008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17493	NC_004113	GATT	2	8	944165	944172	25 %	50 %	25 %	0 %	22298467
17494	NC_004113	CTG	2	6	944228	944233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298467
17495	NC_004113	TGC	2	6	944243	944248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298467
17496	NC_004113	ACT	2	6	944255	944260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298467
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