MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004113	GCGG	2	8	862960	862967	0 %	0 %	75 %	25 %	22298383
16002	NC_004113	TCA	2	6	862991	862996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298383
16003	NC_004113	CA	3	6	862995	863000	50 %	0 %	0 %	50 %	22298383
16004	NC_004113	G	7	7	863010	863016	0 %	0 %	100 %	0 %	22298383
16005	NC_004113	CTG	2	6	863020	863025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298383
16006	NC_004113	CTG	2	6	863032	863037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298383
16007	NC_004113	G	9	9	863212	863220	0 %	0 %	100 %	0 %	22298383
16008	NC_004113	CTT	2	6	863223	863228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298383
16009	NC_004113	ATG	2	6	863248	863253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_004113	ATT	2	6	863376	863381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_004113	CAG	2	6	863430	863435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298384
16012	NC_004113	GT	4	8	863505	863512	0 %	50 %	50 %	0 %	22298384
16013	NC_004113	CGG	2	6	863516	863521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298384
16014	NC_004113	TTG	2	6	863543	863548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298384
16015	NC_004113	TGC	2	6	863598	863603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298384
16016	NC_004113	CTGCAA	2	12	863609	863620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22298384
16017	NC_004113	TGA	2	6	863622	863627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298384
16018	NC_004113	CCG	2	6	863727	863732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298384
16019	NC_004113	GCG	2	6	863749	863754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298384
16020	NC_004113	CCG	2	6	863860	863865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298384
16021	NC_004113	TCTGC	2	10	863965	863974	0 %	40 %	20 %	40 %	22298384
16022	NC_004113	GTTTA	2	10	864004	864013	20 %	60 %	20 %	0 %	22298384
16023	NC_004113	TGC	3	9	864035	864043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298385
16024	NC_004113	TTG	2	6	864146	864151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298385
16025	NC_004113	G	6	6	864171	864176	0 %	0 %	100 %	0 %	22298385
16026	NC_004113	TTG	2	6	864188	864193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298385
16027	NC_004113	GTG	2	6	864236	864241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298385
16028	NC_004113	GCG	2	6	864249	864254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298385
16029	NC_004113	TGC	2	6	864326	864331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298385
16030	NC_004113	CCG	2	6	864338	864343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298385
16031	NC_004113	TGG	2	6	864410	864415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298385
16032	NC_004113	CATTC	2	10	864470	864479	20 %	40 %	0 %	40 %	22298385
16033	NC_004113	CCTC	2	8	864480	864487	0 %	25 %	0 %	75 %	22298385
16034	NC_004113	GGCG	2	8	864488	864495	0 %	0 %	75 %	25 %	22298385
16035	NC_004113	CTG	2	6	864503	864508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298385
16036	NC_004113	GCAA	2	8	864518	864525	50 %	0 %	25 %	25 %	22298385
16037	NC_004113	GAG	2	6	864616	864621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298385
16038	NC_004113	CTCC	2	8	864625	864632	0 %	25 %	0 %	75 %	22298385
16039	NC_004113	CAG	2	6	864674	864679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298385
16040	NC_004113	AGGTTG	2	12	864692	864703	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22298385
16041	NC_004113	GTT	2	6	864710	864715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_004113	CGC	2	6	864793	864798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298386
16043	NC_004113	TTG	2	6	864822	864827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298386
16044	NC_004113	TCC	2	6	864936	864941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298386
16045	NC_004113	CG	3	6	864995	865000	0 %	0 %	50 %	50 %	22298386
16046	NC_004113	TCAT	2	8	865002	865009	25 %	50 %	0 %	25 %	22298386
16047	NC_004113	ATTGGC	2	12	865037	865048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22298386
16048	NC_004113	GGT	2	6	865051	865056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298386
16049	NC_004113	GTC	2	6	865106	865111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298386
16050	NC_004113	TCC	2	6	865123	865128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298386
16051	NC_004113	AGTG	2	8	865171	865178	25 %	25 %	50 %	0 %	22298386
16052	NC_004113	AAC	2	6	865221	865226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298386
16053	NC_004113	GCT	2	6	865281	865286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_004113	AGG	2	6	865319	865324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_004113	T	6	6	865336	865341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_004113	GCC	2	6	865387	865392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16057	NC_004113	CCAT	2	8	865405	865412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16058	NC_004113	G	6	6	865503	865508	0 %	0 %	100 %	0 %	161485765
16059	NC_004113	TTG	2	6	865529	865534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
16060	NC_004113	GAA	2	6	865555	865560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485765
16061	NC_004113	TGA	2	6	865614	865619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485765
16062	NC_004113	TTG	2	6	865646	865651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
16063	NC_004113	ATG	2	6	865658	865663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485765
16064	NC_004113	TTG	2	6	865664	865669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
16065	NC_004113	GAA	2	6	865678	865683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485765
16066	NC_004113	GGC	3	9	865797	865805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485765
16067	NC_004113	ACCC	2	8	865863	865870	25 %	0 %	0 %	75 %	161485765
16068	NC_004113	TCC	2	6	865871	865876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485765
16069	NC_004113	GCC	2	6	865922	865927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485765
16070	NC_004113	CTT	2	6	866094	866099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485765
16071	NC_004113	TGT	2	6	866142	866147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
16072	NC_004113	TTG	2	6	866162	866167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
16073	NC_004113	GCT	2	6	866268	866273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485765
16074	NC_004113	AGC	2	6	866297	866302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485765
16075	NC_004113	CCT	2	6	866331	866336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485765
16076	NC_004113	ATC	2	6	866429	866434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485765
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16078	NC_004113	C	6	6	866539	866544	0 %	0 %	0 %	100 %	22298388
16079	NC_004113	ATC	2	6	866730	866735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298388
16080	NC_004113	GAT	2	6	866754	866759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298388
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16083	NC_004113	CGC	2	6	866952	866957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298388
16084	NC_004113	GGCGCC	2	12	866979	866990	0 %	0 %	50 %	50 %	22298388
16085	NC_004113	CTGG	2	8	867245	867252	0 %	25 %	50 %	25 %	22298388
16086	NC_004113	CCG	2	6	867355	867360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298388
16087	NC_004113	CTGA	2	8	867567	867574	25 %	25 %	25 %	25 %	22298389
16088	NC_004113	CCTTA	2	10	867863	867872	20 %	40 %	0 %	40 %	22298389
16089	NC_004113	CGG	4	12	867882	867893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298389
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16092	NC_004113	GT	3	6	868086	868091	0 %	50 %	50 %	0 %	22298390
16093	NC_004113	ATG	2	6	868382	868387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298390
16094	NC_004113	CGG	2	6	868388	868393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298390
16095	NC_004113	ATG	2	6	868484	868489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298390
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16098	NC_004113	GTT	2	6	868565	868570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298390
16099	NC_004113	GAG	2	6	868600	868605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298390
16100	NC_004113	TAA	2	6	868670	868675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298390
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16102	NC_004113	ATC	2	6	868697	868702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298390
16103	NC_004113	AGG	2	6	868874	868879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_004113	TGCC	2	8	868923	868930	0 %	25 %	25 %	50 %	22298391
16105	NC_004113	AAG	2	6	868973	868978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298391
16106	NC_004113	GCGA	2	8	869011	869018	25 %	0 %	50 %	25 %	22298391
16107	NC_004113	CCT	2	6	869028	869033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298391
16108	NC_004113	CCAAG	2	10	869053	869062	40 %	0 %	20 %	40 %	22298391
16109	NC_004113	CAG	2	6	869068	869073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298391
16110	NC_004113	CAAAA	2	10	869082	869091	80 %	0 %	0 %	20 %	22298391
16111	NC_004113	A	6	6	869126	869131	100 %	0 %	0 %	0 %	22298391
16112	NC_004113	GGC	2	6	869153	869158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_004113	GCTA	2	8	869185	869192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16114	NC_004113	TAT	2	6	869195	869200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_004113	TTG	2	6	869339	869344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298392
16116	NC_004113	AGCA	2	8	869345	869352	50 %	0 %	25 %	25 %	22298392
16117	NC_004113	GCAA	2	8	869498	869505	50 %	0 %	25 %	25 %	22298392
16118	NC_004113	TCA	2	6	869507	869512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298392
16119	NC_004113	GAA	2	6	869521	869526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298392
16120	NC_004113	GCC	2	6	869557	869562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298392
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16122	NC_004113	GCC	2	6	869628	869633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298392
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16159	NC_004113	CCT	2	6	871487	871492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16160	NC_004113	CTG	2	6	871614	871619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298394
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16239	NC_004113	T	6	6	875732	875737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16240	NC_004113	CGT	2	6	875801	875806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298400
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16361	NC_004113	GC	3	6	883470	883475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16362	NC_004113	TCC	2	6	883540	883545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16363	NC_004113	T	6	6	883586	883591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16490	NC_004113	AAT	2	6	890269	890274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298417
16491	NC_004113	TTG	2	6	890276	890281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298417
16492	NC_004113	CAGGGC	2	12	890413	890424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22298418
16493	NC_004113	GCT	2	6	890458	890463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298418
16494	NC_004113	TGC	3	9	890477	890485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298418
16495	NC_004113	GGC	2	6	890506	890511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298418
16496	NC_004113	C	6	6	890543	890548	0 %	0 %	0 %	100 %	22298418
16497	NC_004113	GGT	2	6	890599	890604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298418
16498	NC_004113	GTT	2	6	890607	890612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298418
16499	NC_004113	ATTT	2	8	890634	890641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16500	NC_004113	GTT	2	6	890699	890704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298419

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