MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004113	GTAGCC	2	12	836146	836157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298350
15502	NC_004113	G	6	6	836230	836235	0 %	0 %	100 %	0 %	22298350
15503	NC_004113	TCA	2	6	836447	836452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298350
15504	NC_004113	TGAGT	2	10	836454	836463	20 %	40 %	40 %	0 %	22298350
15505	NC_004113	CGGCAG	2	12	836493	836504	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22298350
15506	NC_004113	A	6	6	836601	836606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_004113	CAGC	2	8	836640	836647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15508	NC_004113	GAT	2	6	836697	836702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_004113	GCAA	2	8	836705	836712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15510	NC_004113	TGCC	2	8	836764	836771	0 %	25 %	25 %	50 %	22298351
15511	NC_004113	GGC	2	6	836808	836813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298351
15512	NC_004113	CAG	2	6	836859	836864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298351
15513	NC_004113	GCC	2	6	836869	836874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298351
15514	NC_004113	TGAT	2	8	836902	836909	25 %	50 %	25 %	0 %	22298351
15515	NC_004113	GCC	2	6	836990	836995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298351
15516	NC_004113	C	6	6	836994	836999	0 %	0 %	0 %	100 %	22298351
15517	NC_004113	GATG	2	8	837032	837039	25 %	25 %	50 %	0 %	22298351
15518	NC_004113	GCA	2	6	837086	837091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298351
15519	NC_004113	AGG	2	6	837154	837159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298351
15520	NC_004113	GAA	2	6	837180	837185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298351
15521	NC_004113	GTT	2	6	837207	837212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298351
15522	NC_004113	AAG	2	6	837232	837237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298351
15523	NC_004113	CCG	2	6	837290	837295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298351
15524	NC_004113	CAC	2	6	837326	837331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298351
15525	NC_004113	ACGC	2	8	837418	837425	25 %	0 %	25 %	50 %	22298351
15526	NC_004113	GAGC	2	8	837462	837469	25 %	0 %	50 %	25 %	22298351
15527	NC_004113	CGA	2	6	837493	837498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298351
15528	NC_004113	GTG	2	6	837502	837507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298351
15529	NC_004113	AGG	2	6	837544	837549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298351
15530	NC_004113	CAA	2	6	837657	837662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298351
15531	NC_004113	ATCG	2	8	837708	837715	25 %	25 %	25 %	25 %	22298351
15532	NC_004113	AGA	2	6	837737	837742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298351
15533	NC_004113	C	6	6	837876	837881	0 %	0 %	0 %	100 %	22298352
15534	NC_004113	TAAA	2	8	837948	837955	75 %	25 %	0 %	0 %	22298352
15535	NC_004113	TGC	2	6	837999	838004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15536	NC_004113	CGT	2	6	838005	838010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15537	NC_004113	GCT	2	6	838057	838062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15538	NC_004113	CGA	2	6	838072	838077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15539	NC_004113	GGT	2	6	838092	838097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298352
15540	NC_004113	C	8	8	838179	838186	0 %	0 %	0 %	100 %	22298352
15541	NC_004113	GA	3	6	838227	838232	50 %	0 %	50 %	0 %	22298352
15542	NC_004113	CTG	2	6	838298	838303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15543	NC_004113	TTG	2	6	838332	838337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298352
15544	NC_004113	TCG	2	6	838401	838406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15545	NC_004113	GCCT	2	8	838415	838422	0 %	25 %	25 %	50 %	22298352
15546	NC_004113	GTT	2	6	838550	838555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298352
15547	NC_004113	ATC	2	6	838557	838562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298352
15548	NC_004113	CAT	2	6	838606	838611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298352
15549	NC_004113	CCA	2	6	838636	838641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298352
15550	NC_004113	GCG	2	6	838655	838660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298352
15551	NC_004113	GCA	2	6	838810	838815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15552	NC_004113	CAA	2	6	838834	838839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298352
15553	NC_004113	TCCCGT	2	12	839019	839030	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22298352
15554	NC_004113	GGCA	2	8	839051	839058	25 %	0 %	50 %	25 %	22298352
15555	NC_004113	A	6	6	839082	839087	100 %	0 %	0 %	0 %	22298352
15556	NC_004113	GCA	2	6	839149	839154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15557	NC_004113	TGG	2	6	839191	839196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298352
15558	NC_004113	CGG	2	6	839461	839466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298352
15559	NC_004113	CCAAGG	2	12	839511	839522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15560	NC_004113	CAG	2	6	839537	839542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
15561	NC_004113	CCA	2	6	839561	839566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298352
15562	NC_004113	GCC	2	6	839575	839580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298353
15563	NC_004113	C	6	6	839612	839617	0 %	0 %	0 %	100 %	22298353
15564	NC_004113	GTT	2	6	839627	839632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298353
15565	NC_004113	GAG	2	6	839745	839750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298353
15566	NC_004113	ATGA	2	8	839761	839768	50 %	25 %	25 %	0 %	22298353
15567	NC_004113	CAG	2	6	839781	839786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298353
15568	NC_004113	GCC	2	6	839887	839892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298354
15569	NC_004113	ATC	2	6	839900	839905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298354
15570	NC_004113	GAC	2	6	839971	839976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298354
15571	NC_004113	TCA	2	6	840008	840013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298354
15572	NC_004113	CCA	2	6	840024	840029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298354
15573	NC_004113	CTT	3	9	840093	840101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298354
15574	NC_004113	T	7	7	840218	840224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_004113	ATA	2	6	840315	840320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_004113	CAA	2	6	840358	840363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298355
15577	NC_004113	CTT	2	6	840425	840430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298355
15578	NC_004113	GCC	2	6	840435	840440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298355
15579	NC_004113	GGC	2	6	840535	840540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298356
15580	NC_004113	TGC	3	9	840576	840584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298356
15581	NC_004113	AAT	2	6	840599	840604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298356
15582	NC_004113	GAT	2	6	840634	840639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298356
15583	NC_004113	ATC	2	6	840687	840692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298356
15584	NC_004113	CAA	2	6	840721	840726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298356
15585	NC_004113	CTTG	2	8	840727	840734	0 %	50 %	25 %	25 %	22298356
15586	NC_004113	GCC	2	6	840851	840856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298356
15587	NC_004113	AAG	2	6	840881	840886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298356
15588	NC_004113	CTG	2	6	840937	840942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_004113	GTC	2	6	840981	840986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15590	NC_004113	ACT	2	6	840992	840997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298357
15591	NC_004113	AG	3	6	841104	841109	50 %	0 %	50 %	0 %	22298357
15592	NC_004113	GAA	2	6	841237	841242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298357
15593	NC_004113	GCAAA	2	10	841249	841258	60 %	0 %	20 %	20 %	22298357
15594	NC_004113	CAA	2	6	841261	841266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298357
15595	NC_004113	GGT	2	6	841293	841298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298357
15596	NC_004113	TGG	2	6	841376	841381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298357
15597	NC_004113	TTTGT	2	10	841426	841435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_004113	GTT	2	6	841439	841444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_004113	TTG	2	6	841560	841565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298358
15600	NC_004113	GGC	2	6	841588	841593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
15601	NC_004113	GTG	2	6	841598	841603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
15602	NC_004113	GGC	2	6	841633	841638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
15603	NC_004113	TGG	2	6	841677	841682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
15604	NC_004113	CTC	2	6	841826	841831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298358
15605	NC_004113	ATCAG	2	10	841914	841923	40 %	20 %	20 %	20 %	22298358
15606	NC_004113	C	6	6	841934	841939	0 %	0 %	0 %	100 %	22298358
15607	NC_004113	ACC	2	6	842015	842020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298358
15608	NC_004113	CGA	2	6	842057	842062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298358
15609	NC_004113	GCG	2	6	842165	842170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
15610	NC_004113	CTG	2	6	842174	842179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
15611	NC_004113	CGG	2	6	842205	842210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
15612	NC_004113	CGT	2	6	842215	842220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
15613	NC_004113	GCC	2	6	842283	842288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298358
15614	NC_004113	ACAGG	2	10	842324	842333	40 %	0 %	40 %	20 %	22298358
15615	NC_004113	TAA	2	6	842379	842384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298358
15616	NC_004113	CTG	2	6	842390	842395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
15617	NC_004113	CCA	2	6	842428	842433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298358
15618	NC_004113	TGC	2	6	842460	842465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
15619	NC_004113	GTG	2	6	842481	842486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
15620	NC_004113	C	6	6	842529	842534	0 %	0 %	0 %	100 %	22298358
15621	NC_004113	GTG	2	6	842553	842558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
15622	NC_004113	CTG	2	6	842631	842636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
15623	NC_004113	TGAT	2	8	842673	842680	25 %	50 %	25 %	0 %	22298358
15624	NC_004113	GC	4	8	842681	842688	0 %	0 %	50 %	50 %	22298358
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15991	NC_004113	CCA	2	6	862423	862428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298382
15992	NC_004113	GGT	2	6	862469	862474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298382
15993	NC_004113	GGGCAG	2	12	862526	862537	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	22298382
15994	NC_004113	TCC	2	6	862563	862568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298382
15995	NC_004113	AAT	2	6	862694	862699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298382
15996	NC_004113	TTG	2	6	862775	862780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15997	NC_004113	AAC	2	6	862789	862794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15998	NC_004113	TGG	2	6	862808	862813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298383
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