MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_004113	CGT	2	6	624283	624288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298161
11502	NC_004113	CAGCGA	2	12	624385	624396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298161
11503	NC_004113	AAT	2	6	624402	624407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298161
11504	NC_004113	AC	3	6	624423	624428	50 %	0 %	0 %	50 %	22298161
11505	NC_004113	C	6	6	624500	624505	0 %	0 %	0 %	100 %	22298161
11506	NC_004113	GCC	2	6	624527	624532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298161
11507	NC_004113	GAT	2	6	624578	624583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_004113	CGC	2	6	624613	624618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_004113	C	6	6	624653	624658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11510	NC_004113	GCG	2	6	624756	624761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_004113	AAC	3	9	624820	624828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_004113	CCA	2	6	624853	624858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_004113	GAA	2	6	624924	624929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_004113	GAT	2	6	624975	624980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_004113	GTT	2	6	625015	625020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_004113	GAG	2	6	625122	625127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_004113	TCG	2	6	625283	625288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_004113	CAC	2	6	625322	625327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11519	NC_004113	AGGC	2	8	625389	625396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_004113	GAG	2	6	625481	625486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_004113	CCCG	2	8	625502	625509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11522	NC_004113	CTG	2	6	625526	625531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_004113	TC	3	6	625533	625538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_004113	ACCA	2	8	625613	625620	50 %	0 %	0 %	50 %	22298162
11525	NC_004113	GAAG	2	8	625705	625712	50 %	0 %	50 %	0 %	22298162
11526	NC_004113	GCA	2	6	625806	625811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11527	NC_004113	CA	3	6	625843	625848	50 %	0 %	0 %	50 %	22298162
11528	NC_004113	AACCCC	2	12	625896	625907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298162
11529	NC_004113	GCCCTA	2	12	625997	626008	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298162
11530	NC_004113	CAG	2	6	626028	626033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11531	NC_004113	ACA	2	6	626160	626165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298162
11532	NC_004113	CTA	2	6	626180	626185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298162
11533	NC_004113	AGC	2	6	626247	626252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11534	NC_004113	CCAT	2	8	626262	626269	25 %	25 %	0 %	50 %	22298162
11535	NC_004113	AGGG	2	8	626283	626290	25 %	0 %	75 %	0 %	22298162
11536	NC_004113	GGATG	2	10	626323	626332	20 %	20 %	60 %	0 %	22298162
11537	NC_004113	GAA	2	6	626333	626338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298162
11538	NC_004113	CGA	2	6	626389	626394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11539	NC_004113	TCG	2	6	626397	626402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11540	NC_004113	GAAG	2	8	626416	626423	50 %	0 %	50 %	0 %	22298162
11541	NC_004113	GAA	2	6	626513	626518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298162
11542	NC_004113	ATG	2	6	626553	626558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298162
11543	NC_004113	TCA	2	6	626568	626573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298162
11544	NC_004113	GAA	3	9	626581	626589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298162
11545	NC_004113	AC	3	6	626664	626669	50 %	0 %	0 %	50 %	22298162
11546	NC_004113	ATC	2	6	626678	626683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298162
11547	NC_004113	ACTA	2	8	626693	626700	50 %	25 %	0 %	25 %	22298162
11548	NC_004113	TCG	2	6	626730	626735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11549	NC_004113	ACC	2	6	626742	626747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298162
11550	NC_004113	AGTA	2	8	626816	626823	50 %	25 %	25 %	0 %	22298162
11551	NC_004113	AGC	2	6	626994	626999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11552	NC_004113	GAA	2	6	627055	627060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298162
11553	NC_004113	GGC	2	6	627065	627070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298162
11554	NC_004113	CCA	2	6	627121	627126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298162
11555	NC_004113	GGT	2	6	627146	627151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298162
11556	NC_004113	GAC	2	6	627155	627160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298162
11557	NC_004113	AGG	2	6	627300	627305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_004113	C	7	7	627322	627328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11559	NC_004113	CTT	2	6	627338	627343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298163
11560	NC_004113	ATTG	2	8	627550	627557	25 %	50 %	25 %	0 %	22298163
11561	NC_004113	CA	3	6	627573	627578	50 %	0 %	0 %	50 %	22298163
11562	NC_004113	CTG	2	6	627665	627670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298163
11563	NC_004113	CTG	2	6	627683	627688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298163
11564	NC_004113	TCACG	2	10	627692	627701	20 %	20 %	20 %	40 %	22298163
11565	NC_004113	ATTG	2	8	627738	627745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_004113	TGT	2	6	627755	627760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298164
11567	NC_004113	TGG	2	6	627865	627870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298164
11568	NC_004113	ACC	2	6	627876	627881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298164
11569	NC_004113	ATT	2	6	627897	627902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298164
11570	NC_004113	ACG	2	6	627906	627911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298164
11571	NC_004113	ACA	2	6	628073	628078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298164
11572	NC_004113	CCG	2	6	628123	628128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298164
11573	NC_004113	TGGC	2	8	628240	628247	0 %	25 %	50 %	25 %	22298164
11574	NC_004113	CGGC	2	8	628321	628328	0 %	0 %	50 %	50 %	22298164
11575	NC_004113	CTC	2	6	628335	628340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298164
11576	NC_004113	GGGT	2	8	628402	628409	0 %	25 %	75 %	0 %	22298164
11577	NC_004113	GCC	2	6	628560	628565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298164
11578	NC_004113	TGC	2	6	628646	628651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298164
11579	NC_004113	GCGATC	2	12	628656	628667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298164
11580	NC_004113	CCTG	2	8	628675	628682	0 %	25 %	25 %	50 %	22298164
11581	NC_004113	AAC	2	6	628693	628698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298164
11582	NC_004113	C	6	6	628704	628709	0 %	0 %	0 %	100 %	22298164
11583	NC_004113	CTG	2	6	628787	628792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298164
11584	NC_004113	GTT	2	6	628821	628826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298164
11585	NC_004113	AGG	2	6	628843	628848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298164
11586	NC_004113	ACG	2	6	628854	628859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485769
11587	NC_004113	G	7	7	628909	628915	0 %	0 %	100 %	0 %	161485769
11588	NC_004113	CCA	2	6	628960	628965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161485769
11589	NC_004113	CCT	2	6	629011	629016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485769
11590	NC_004113	AGC	2	6	629056	629061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485769
11591	NC_004113	CCT	2	6	629062	629067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485769
11592	NC_004113	CGG	2	6	629152	629157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485769
11593	NC_004113	TCC	2	6	629292	629297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485769
11594	NC_004113	ATC	2	6	629376	629381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485769
11595	NC_004113	TGG	2	6	629463	629468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161485769
11596	NC_004113	CCCG	2	8	629493	629500	0 %	0 %	25 %	75 %	161485769
11597	NC_004113	AGA	3	9	629509	629517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485769
11598	NC_004113	CAT	2	6	629539	629544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485769
11599	NC_004113	GC	3	6	629562	629567	0 %	0 %	50 %	50 %	161485769
11600	NC_004113	CGC	2	6	629624	629629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485769
11601	NC_004113	TGC	2	6	629643	629648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485769
11602	NC_004113	GAA	2	6	629692	629697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485769
11603	NC_004113	CGC	2	6	629723	629728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485769
11604	NC_004113	G	6	6	629801	629806	0 %	0 %	100 %	0 %	161485769
11605	NC_004113	TCC	2	6	629979	629984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485769
11606	NC_004113	CTC	2	6	630026	630031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485769
11607	NC_004113	CCT	2	6	630073	630078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485769
11608	NC_004113	AAG	2	6	630114	630119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485769
11609	NC_004113	TAA	2	6	630154	630159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485769
11610	NC_004113	ACC	2	6	630249	630254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161485769
11611	NC_004113	C	6	6	630309	630314	0 %	0 %	0 %	100 %	161485769
11612	NC_004113	AAT	2	6	630332	630337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485769
11613	NC_004113	GCC	2	6	630393	630398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485769
11614	NC_004113	C	6	6	630473	630478	0 %	0 %	0 %	100 %	161485769
11615	NC_004113	GTT	2	6	630500	630505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485769
11616	NC_004113	GAC	2	6	630557	630562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485769
11617	NC_004113	CGC	2	6	630647	630652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485769
11618	NC_004113	GGC	2	6	630683	630688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485769
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11620	NC_004113	AAT	2	6	630894	630899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298166
11621	NC_004113	CCA	2	6	630990	630995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298166
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11623	NC_004113	AGG	2	6	631194	631199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298166
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11989	NC_004113	TGT	2	6	650855	650860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298183
11990	NC_004113	TTG	2	6	650868	650873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298183
11991	NC_004113	AGGC	2	8	650928	650935	25 %	0 %	50 %	25 %	22298183
11992	NC_004113	CAC	2	6	650964	650969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298183
11993	NC_004113	ACCG	3	12	650974	650985	25 %	0 %	25 %	50 %	22298183
11994	NC_004113	AGT	2	6	650987	650992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298183
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11999	NC_004113	ATCA	2	8	651111	651118	50 %	25 %	0 %	25 %	22298183
12000	NC_004113	GCA	2	6	651137	651142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298183

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