MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004113	G	6	6	597325	597330	0 %	0 %	100 %	0 %	22298133
11002	NC_004113	GCTC	2	8	597402	597409	0 %	25 %	25 %	50 %	22298133
11003	NC_004113	CAA	2	6	597451	597456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298133
11004	NC_004113	CGC	2	6	597539	597544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298133
11005	NC_004113	TTG	2	6	597593	597598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298133
11006	NC_004113	AAG	2	6	597612	597617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298133
11007	NC_004113	ACCC	2	8	597638	597645	25 %	0 %	0 %	75 %	22298133
11008	NC_004113	CTG	2	6	597686	597691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298133
11009	NC_004113	GAA	2	6	597721	597726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298133
11010	NC_004113	ACG	2	6	597762	597767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298133
11011	NC_004113	CTG	2	6	597803	597808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298133
11012	NC_004113	GT	3	6	597888	597893	0 %	50 %	50 %	0 %	22298133
11013	NC_004113	CGAATG	2	12	597987	597998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22298134
11014	NC_004113	AAT	2	6	598061	598066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298134
11015	NC_004113	ACA	2	6	598101	598106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298134
11016	NC_004113	CCGTT	2	10	598160	598169	0 %	40 %	20 %	40 %	22298134
11017	NC_004113	GCC	2	6	598180	598185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298134
11018	NC_004113	AAT	2	6	598271	598276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298134
11019	NC_004113	TTTA	2	8	598329	598336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_004113	GCGA	2	8	598388	598395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_004113	GGCT	2	8	598649	598656	0 %	25 %	50 %	25 %	22298135
11022	NC_004113	TGC	2	6	598674	598679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298135
11023	NC_004113	CT	3	6	598721	598726	0 %	50 %	0 %	50 %	22298135
11024	NC_004113	CTT	2	6	598904	598909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298135
11025	NC_004113	CAG	2	6	598910	598915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298135
11026	NC_004113	TCC	2	6	598920	598925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298135
11027	NC_004113	TCA	2	6	598942	598947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298135
11028	NC_004113	GGC	2	6	598951	598956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298135
11029	NC_004113	TGAT	2	8	598971	598978	25 %	50 %	25 %	0 %	22298135
11030	NC_004113	GGC	2	6	599017	599022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298135
11031	NC_004113	TGA	2	6	599043	599048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298135
11032	NC_004113	CGCC	2	8	599134	599141	0 %	0 %	25 %	75 %	22298135
11033	NC_004113	TGAG	2	8	599194	599201	25 %	25 %	50 %	0 %	22298135
11034	NC_004113	TGG	2	6	599263	599268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298136
11035	NC_004113	C	7	7	599288	599294	0 %	0 %	0 %	100 %	22298136
11036	NC_004113	AGA	2	6	599300	599305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298136
11037	NC_004113	AGC	2	6	599341	599346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298136
11038	NC_004113	TCAGC	2	10	599402	599411	20 %	20 %	20 %	40 %	22298136
11039	NC_004113	CAG	2	6	599423	599428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298136
11040	NC_004113	CTC	2	6	599475	599480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298136
11041	NC_004113	G	6	6	599516	599521	0 %	0 %	100 %	0 %	22298136
11042	NC_004113	CAG	2	6	599532	599537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298136
11043	NC_004113	GAC	2	6	599585	599590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298136
11044	NC_004113	CTA	2	6	599642	599647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298136
11045	NC_004113	GCA	2	6	599679	599684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298136
11046	NC_004113	AGC	2	6	599737	599742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298136
11047	NC_004113	TTGGC	2	10	599769	599778	0 %	40 %	40 %	20 %	22298136
11048	NC_004113	GT	3	6	599898	599903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_004113	GAG	2	6	599904	599909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_004113	GTC	2	6	599946	599951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_004113	TGC	2	6	599996	600001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298137
11052	NC_004113	TGT	2	6	600002	600007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298137
11053	NC_004113	CGG	2	6	600050	600055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298137
11054	NC_004113	GGT	3	9	600068	600076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298137
11055	NC_004113	GGC	2	6	600122	600127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298137
11056	NC_004113	CCG	2	6	600184	600189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298137
11057	NC_004113	AAG	2	6	600199	600204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298137
11058	NC_004113	GTG	2	6	600384	600389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298137
11059	NC_004113	AGC	2	6	600410	600415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298137
11060	NC_004113	G	7	7	600422	600428	0 %	0 %	100 %	0 %	22298137
11061	NC_004113	CCCCCT	2	12	600505	600516	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	22298137
11062	NC_004113	GCTGCC	2	12	600522	600533	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	22298137
11063	NC_004113	GCC	3	9	600603	600611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298137
11064	NC_004113	GCG	2	6	600668	600673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298137
11065	NC_004113	CAA	2	6	600679	600684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298137
11066	NC_004113	C	6	6	600690	600695	0 %	0 %	0 %	100 %	22298137
11067	NC_004113	ATTC	2	8	600729	600736	25 %	50 %	0 %	25 %	22298137
11068	NC_004113	C	6	6	600780	600785	0 %	0 %	0 %	100 %	22298137
11069	NC_004113	TGC	2	6	600815	600820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298137
11070	NC_004113	TGG	2	6	600823	600828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298137
11071	NC_004113	G	6	6	600827	600832	0 %	0 %	100 %	0 %	22298137
11072	NC_004113	G	6	6	600874	600879	0 %	0 %	100 %	0 %	22298137
11073	NC_004113	GCT	2	6	600926	600931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298137
11074	NC_004113	GC	4	8	600966	600973	0 %	0 %	50 %	50 %	22298137
11075	NC_004113	GGT	2	6	600983	600988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298137
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11078	NC_004113	CT	3	6	601107	601112	0 %	50 %	0 %	50 %	22298137
11079	NC_004113	AGTG	2	8	601142	601149	25 %	25 %	50 %	0 %	22298137
11080	NC_004113	GCC	2	6	601153	601158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298137
11081	NC_004113	GAG	2	6	601260	601265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298137
11082	NC_004113	GTG	2	6	601313	601318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298137
11083	NC_004113	AG	3	6	601349	601354	50 %	0 %	50 %	0 %	22298137
11084	NC_004113	CTG	2	6	601525	601530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298138
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11087	NC_004113	CAG	2	6	601717	601722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298138
11088	NC_004113	AGC	2	6	601737	601742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298138
11089	NC_004113	GCC	2	6	601756	601761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298138
11090	NC_004113	TTG	2	6	601802	601807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298138
11091	NC_004113	TGG	2	6	601837	601842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298138
11092	NC_004113	AGTC	2	8	601866	601873	25 %	25 %	25 %	25 %	22298138
11093	NC_004113	ACCA	2	8	601884	601891	50 %	0 %	0 %	50 %	22298138
11094	NC_004113	CCA	2	6	601928	601933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298138
11095	NC_004113	T	6	6	601946	601951	0 %	100 %	0 %	0 %	22298138
11096	NC_004113	GCT	3	9	601969	601977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298138
11097	NC_004113	GTTG	2	8	602096	602103	0 %	50 %	50 %	0 %	22298138
11098	NC_004113	CTT	2	6	602106	602111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298138
11099	NC_004113	AC	3	6	602162	602167	50 %	0 %	0 %	50 %	22298138
11100	NC_004113	GCC	2	6	602179	602184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298138
11101	NC_004113	CTCCG	2	10	602229	602238	0 %	20 %	20 %	60 %	22298138
11102	NC_004113	GTG	2	6	602270	602275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298138
11103	NC_004113	ACA	2	6	602319	602324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298138
11104	NC_004113	TCC	2	6	602345	602350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298138
11105	NC_004113	TGCC	2	8	602354	602361	0 %	25 %	25 %	50 %	22298138
11106	NC_004113	G	6	6	602385	602390	0 %	0 %	100 %	0 %	22298138
11107	NC_004113	CTT	2	6	602445	602450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298138
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11109	NC_004113	GCC	2	6	602698	602703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298138
11110	NC_004113	CGC	2	6	602760	602765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298139
11111	NC_004113	GAG	2	6	602928	602933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298139
11112	NC_004113	CTT	2	6	603051	603056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298139
11113	NC_004113	ATC	2	6	603166	603171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298139
11114	NC_004113	TCG	2	6	603245	603250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298139
11115	NC_004113	TGG	2	6	603254	603259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298139
11116	NC_004113	AAAC	2	8	603446	603453	75 %	0 %	0 %	25 %	22298139
11117	NC_004113	CCG	2	6	603456	603461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298139
11118	NC_004113	CCA	2	6	603464	603469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298139
11119	NC_004113	TCA	2	6	603484	603489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298139
11120	NC_004113	GCA	2	6	603500	603505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298139
11121	NC_004113	CCG	2	6	603514	603519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298139
11122	NC_004113	CAC	2	6	603539	603544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298139
11123	NC_004113	CTC	2	6	603567	603572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298139
11124	NC_004113	AG	3	6	603650	603655	50 %	0 %	50 %	0 %	22298139
11125	NC_004113	GAT	2	6	603708	603713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298139
11126	NC_004113	CTGC	2	8	603731	603738	0 %	25 %	25 %	50 %	22298139
11127	NC_004113	TAA	2	6	603799	603804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_004113	AGC	2	6	603822	603827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11129	NC_004113	CTTTC	2	10	604071	604080	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11130	NC_004113	T	6	6	604097	604102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_004113	CAC	2	6	604109	604114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_004113	ATT	3	9	604303	604311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298140
11133	NC_004113	GTT	2	6	604411	604416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298140
11134	NC_004113	TGC	2	6	604440	604445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298140
11135	NC_004113	CTG	2	6	604523	604528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298140
11136	NC_004113	CAC	2	6	604550	604555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298140
11137	NC_004113	TGA	2	6	604577	604582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298140
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11139	NC_004113	G	6	6	604667	604672	0 %	0 %	100 %	0 %	22298140
11140	NC_004113	ACT	2	6	604758	604763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298140
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11148	NC_004113	ATC	2	6	605137	605142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298140
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11154	NC_004113	TGG	2	6	605417	605422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298140
11155	NC_004113	GTC	2	6	605468	605473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298140
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11230	NC_004113	A	6	6	608829	608834	100 %	0 %	0 %	0 %	22298143
11231	NC_004113	GCA	2	6	608845	608850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298143
11232	NC_004113	TTG	2	6	608856	608861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298143
11233	NC_004113	GC	3	6	609023	609028	0 %	0 %	50 %	50 %	22298144
11234	NC_004113	CG	3	6	609087	609092	0 %	0 %	50 %	50 %	22298144
11235	NC_004113	GAC	2	6	609100	609105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298144
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11237	NC_004113	AG	3	6	609201	609206	50 %	0 %	50 %	0 %	22298144
11238	NC_004113	CAGA	2	8	609235	609242	50 %	0 %	25 %	25 %	22298144
11239	NC_004113	TCAC	2	8	609386	609393	25 %	25 %	0 %	50 %	22298144
11240	NC_004113	GCC	2	6	609401	609406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298144
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11242	NC_004113	AGG	2	6	609452	609457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298144
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11249	NC_004113	GCC	2	6	609786	609791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298145
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11363	NC_004113	GCA	2	6	616552	616557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298153
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11369	NC_004113	GAA	3	9	616669	616677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298153
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11371	NC_004113	TGC	2	6	616760	616765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298153
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11389	NC_004113	TGG	2	6	617785	617790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298154
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11484	NC_004113	ATC	2	6	623483	623488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_004113	TG	3	6	623502	623507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11487	NC_004113	ATTG	2	8	623588	623595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_004113	TGC	2	6	623699	623704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11489	NC_004113	CTAGC	2	10	623746	623755	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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