MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_004113	G	6	6	571318	571323	0 %	0 %	100 %	0 %	22298112
10503	NC_004113	GTC	2	6	571346	571351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298112
10504	NC_004113	TTG	2	6	571353	571358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298112
10505	NC_004113	CT	3	6	571422	571427	0 %	50 %	0 %	50 %	22298113
10506	NC_004113	TGC	2	6	571435	571440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298113
10507	NC_004113	A	6	6	571453	571458	100 %	0 %	0 %	0 %	22298113
10508	NC_004113	CCT	2	6	571569	571574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298113
10509	NC_004113	CAG	2	6	571609	571614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298113
10510	NC_004113	GGCA	2	8	571726	571733	25 %	0 %	50 %	25 %	22298113
10511	NC_004113	TGC	2	6	571754	571759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298113
10512	NC_004113	GCA	2	6	571764	571769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298113
10513	NC_004113	CTG	2	6	571777	571782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298113
10514	NC_004113	AGT	2	6	571799	571804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298113
10515	NC_004113	CAC	2	6	571822	571827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298113
10516	NC_004113	CCA	2	6	571874	571879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298113
10517	NC_004113	TGC	2	6	571891	571896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298113
10518	NC_004113	ATC	2	6	571901	571906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298113
10519	NC_004113	ACC	2	6	571912	571917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298114
10520	NC_004113	ACA	2	6	572032	572037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298114
10521	NC_004113	CAC	2	6	572109	572114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298114
10522	NC_004113	GAC	3	9	572121	572129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298114
10523	NC_004113	CCT	2	6	572162	572167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298114
10524	NC_004113	GAA	2	6	572207	572212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298114
10525	NC_004113	CCA	2	6	572249	572254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298114
10526	NC_004113	TGTCA	2	10	572265	572274	20 %	40 %	20 %	20 %	22298114
10527	NC_004113	TAC	2	6	572335	572340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298115
10528	NC_004113	ATG	2	6	572464	572469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298115
10529	NC_004113	GACT	2	8	572472	572479	25 %	25 %	25 %	25 %	22298115
10530	NC_004113	CAT	2	6	572627	572632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298115
10531	NC_004113	TTCAT	2	10	572647	572656	20 %	60 %	0 %	20 %	22298115
10532	NC_004113	A	6	6	572721	572726	100 %	0 %	0 %	0 %	22298115
10533	NC_004113	ACG	2	6	572833	572838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298115
10534	NC_004113	TCAA	2	8	572851	572858	50 %	25 %	0 %	25 %	22298115
10535	NC_004113	GCT	4	12	572951	572962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298115
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10537	NC_004113	CTG	2	6	573045	573050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298115
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10540	NC_004113	CTG	2	6	573209	573214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298115
10541	NC_004113	TGGGG	2	10	573264	573273	0 %	20 %	80 %	0 %	22298115
10542	NC_004113	C	6	6	573410	573415	0 %	0 %	0 %	100 %	22298115
10543	NC_004113	CTG	2	6	573435	573440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298115
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10545	NC_004113	GCA	2	6	573494	573499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298115
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10551	NC_004113	AGAGG	2	10	573806	573815	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_004113	AGC	2	6	573820	573825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_004113	AAAT	2	8	573827	573834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_004113	GTC	2	6	573857	573862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298116
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10556	NC_004113	TGA	2	6	573927	573932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298116
10557	NC_004113	TGT	2	6	573960	573965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298116
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10588	NC_004113	TTG	2	6	575792	575797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10592	NC_004113	CACCC	2	10	575987	575996	20 %	0 %	0 %	80 %	22298117
10593	NC_004113	GGTTGT	2	12	576174	576185	0 %	50 %	50 %	0 %	22298117
10594	NC_004113	GCC	2	6	576200	576205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298117
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10602	NC_004113	CTC	2	6	576565	576570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298117
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10605	NC_004113	TATT	2	8	576750	576757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_004113	CCT	2	6	576779	576784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10607	NC_004113	ATT	2	6	576881	576886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298118
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10620	NC_004113	AC	3	6	577539	577544	50 %	0 %	0 %	50 %	22298118
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10987	NC_004113	GT	3	6	596367	596372	0 %	50 %	50 %	0 %	22298132
10988	NC_004113	ATC	2	6	596376	596381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298132
10989	NC_004113	ACT	2	6	596524	596529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298132
10990	NC_004113	GCG	2	6	596582	596587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298132
10991	NC_004113	CTACC	2	10	596605	596614	20 %	20 %	0 %	60 %	22298132
10992	NC_004113	GAG	2	6	596679	596684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298132
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10994	NC_004113	GT	3	6	596743	596748	0 %	50 %	50 %	0 %	22298132
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11000	NC_004113	ATG	2	6	597129	597134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298133

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