MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004113	GGTT	2	8	544081	544088	0 %	50 %	50 %	0 %	22298084
10002	NC_004113	CAA	2	6	544143	544148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298084
10003	NC_004113	GTG	2	6	544152	544157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298084
10004	NC_004113	GAT	2	6	544170	544175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298084
10005	NC_004113	GAG	2	6	544189	544194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298084
10006	NC_004113	CCA	2	6	544233	544238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298084
10007	NC_004113	CGG	2	6	544281	544286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298084
10008	NC_004113	C	6	6	544319	544324	0 %	0 %	0 %	100 %	22298084
10009	NC_004113	CCA	2	6	544350	544355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298084
10010	NC_004113	CAC	2	6	544359	544364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298084
10011	NC_004113	TTC	2	6	544423	544428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298084
10012	NC_004113	CAC	2	6	544467	544472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298084
10013	NC_004113	CTG	2	6	544666	544671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298084
10014	NC_004113	GGA	2	6	544717	544722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298084
10015	NC_004113	AGG	2	6	544742	544747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298084
10016	NC_004113	TAG	2	6	544781	544786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298084
10017	NC_004113	AC	3	6	544816	544821	50 %	0 %	0 %	50 %	22298084
10018	NC_004113	T	7	7	544875	544881	0 %	100 %	0 %	0 %	22298084
10019	NC_004113	CGG	2	6	544955	544960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298084
10020	NC_004113	TCA	2	6	544992	544997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298084
10021	NC_004113	GCG	2	6	545018	545023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298084
10022	NC_004113	GTT	2	6	545037	545042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298084
10023	NC_004113	TGG	2	6	545090	545095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298084
10024	NC_004113	AGTC	2	8	545103	545110	25 %	25 %	25 %	25 %	22298084
10025	NC_004113	CCT	2	6	545117	545122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_004113	TC	3	6	545157	545162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_004113	GTG	2	6	545170	545175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_004113	AAC	2	6	545185	545190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298085
10029	NC_004113	GTC	2	6	545215	545220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298085
10030	NC_004113	CAC	3	9	545298	545306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298085
10031	NC_004113	GAG	2	6	545376	545381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298085
10032	NC_004113	CGCC	2	8	545441	545448	0 %	0 %	25 %	75 %	22298085
10033	NC_004113	TGT	2	6	545582	545587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298086
10034	NC_004113	GAAA	2	8	545601	545608	75 %	0 %	25 %	0 %	22298086
10035	NC_004113	GCC	2	6	545647	545652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298086
10036	NC_004113	GCC	2	6	545699	545704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_004113	GGC	2	6	545837	545842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_004113	GCA	2	6	545852	545857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_004113	TAAA	2	8	545946	545953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_004113	GTC	2	6	546004	546009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298087
10041	NC_004113	CAG	2	6	546049	546054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298087
10042	NC_004113	AAG	2	6	546061	546066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298087
10043	NC_004113	A	6	6	546117	546122	100 %	0 %	0 %	0 %	22298087
10044	NC_004113	CTG	2	6	546334	546339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298088
10045	NC_004113	GCC	2	6	546430	546435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298088
10046	NC_004113	GAT	2	6	546481	546486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298088
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10051	NC_004113	AC	3	6	546800	546805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_004113	AAG	2	6	546888	546893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298089
10053	NC_004113	CGG	2	6	546918	546923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298089
10054	NC_004113	CTG	2	6	546933	546938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298089
10055	NC_004113	CTG	2	6	546956	546961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298089
10056	NC_004113	GCT	2	6	546965	546970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298089
10057	NC_004113	TGG	2	6	547001	547006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298089
10058	NC_004113	CAAT	2	8	547139	547146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_004113	CAA	2	6	547151	547156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_004113	GT	3	6	547466	547471	0 %	50 %	50 %	0 %	22298090
10061	NC_004113	GTG	2	6	547475	547480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298090
10062	NC_004113	CTG	2	6	547649	547654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298090
10063	NC_004113	ACA	2	6	547668	547673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298090
10064	NC_004113	ATCG	2	8	547946	547953	25 %	25 %	25 %	25 %	22298091
10065	NC_004113	TGG	2	6	547965	547970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298091
10066	NC_004113	T	7	7	547972	547978	0 %	100 %	0 %	0 %	22298091
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10068	NC_004113	GATTG	2	10	548045	548054	20 %	40 %	40 %	0 %	22298091
10069	NC_004113	CA	3	6	548133	548138	50 %	0 %	0 %	50 %	22298091
10070	NC_004113	GTGA	2	8	548210	548217	25 %	25 %	50 %	0 %	22298091
10071	NC_004113	G	7	7	548221	548227	0 %	0 %	100 %	0 %	22298091
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10074	NC_004113	A	6	6	548297	548302	100 %	0 %	0 %	0 %	22298091
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10080	NC_004113	GCT	2	6	548692	548697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298091
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10082	NC_004113	ACT	2	6	548937	548942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298091
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10088	NC_004113	TGG	2	6	549294	549299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298092
10089	NC_004113	AAT	2	6	549417	549422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298092
10090	NC_004113	GCA	2	6	549432	549437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298092
10091	NC_004113	GATG	2	8	549468	549475	25 %	25 %	50 %	0 %	22298092
10092	NC_004113	GCTG	2	8	549496	549503	0 %	25 %	50 %	25 %	22298093
10093	NC_004113	CTG	2	6	549519	549524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298093
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10105	NC_004113	GGC	2	6	550097	550102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298093
10106	NC_004113	TGG	2	6	550174	550179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298093
10107	NC_004113	G	6	6	550178	550183	0 %	0 %	100 %	0 %	22298093
10108	NC_004113	CCA	2	6	550275	550280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298093
10109	NC_004113	T	6	6	550350	550355	0 %	100 %	0 %	0 %	22298093
10110	NC_004113	C	6	6	550455	550460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10111	NC_004113	C	6	6	550483	550488	0 %	0 %	0 %	100 %	22298094
10112	NC_004113	GAG	2	6	550582	550587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298094
10113	NC_004113	C	7	7	550656	550662	0 %	0 %	0 %	100 %	22298094
10114	NC_004113	CGC	2	6	550692	550697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298094
10115	NC_004113	GCC	2	6	550767	550772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298094
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10118	NC_004113	G	6	6	550860	550865	0 %	0 %	100 %	0 %	22298094
10119	NC_004113	C	6	6	550901	550906	0 %	0 %	0 %	100 %	22298094
10120	NC_004113	A	6	6	551040	551045	100 %	0 %	0 %	0 %	22298095
10121	NC_004113	CCAC	2	8	551072	551079	25 %	0 %	0 %	75 %	22298095
10122	NC_004113	TTA	2	6	551092	551097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298095
10123	NC_004113	GAG	2	6	551115	551120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298095
10124	NC_004113	TGC	2	6	551122	551127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298095
10125	NC_004113	GGC	2	6	551136	551141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298095
10126	NC_004113	CAC	2	6	551172	551177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298095
10127	NC_004113	GCC	2	6	551182	551187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298095
10128	NC_004113	CGTT	2	8	551220	551227	0 %	50 %	25 %	25 %	22298095
10129	NC_004113	CGA	2	6	551276	551281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298095
10130	NC_004113	GCG	2	6	551284	551289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298095
10131	NC_004113	CTG	2	6	551312	551317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298095
10132	NC_004113	TTG	2	6	551406	551411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298095
10133	NC_004113	AGT	2	6	551413	551418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298095
10134	NC_004113	CCG	2	6	551468	551473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298095
10135	NC_004113	TGA	2	6	551480	551485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298095
10136	NC_004113	GCT	2	6	551587	551592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298095
10137	NC_004113	CCA	2	6	551599	551604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298095
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10139	NC_004113	ACG	2	6	551635	551640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298095
10140	NC_004113	TCA	2	6	551738	551743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298095
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10142	NC_004113	GGC	2	6	551799	551804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298096
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10144	NC_004113	CCA	2	6	551889	551894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298096
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10147	NC_004113	TGC	2	6	552140	552145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298096
10148	NC_004113	TGA	2	6	552179	552184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298096
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10151	NC_004113	TGT	2	6	552263	552268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298096
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10153	NC_004113	GCC	2	6	552293	552298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298096
10154	NC_004113	GA	4	8	552309	552316	50 %	0 %	50 %	0 %	22298096
10155	NC_004113	CTC	2	6	552328	552333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298096
10156	NC_004113	GTT	2	6	552345	552350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298096
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10158	NC_004113	TCA	2	6	552546	552551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298096
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10160	NC_004113	TCC	2	6	552639	552644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298097
10161	NC_004113	GCC	2	6	552705	552710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298097
10162	NC_004113	CCA	2	6	552754	552759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298097
10163	NC_004113	GCT	2	6	552885	552890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298097
10164	NC_004113	AAT	2	6	552938	552943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298097
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10169	NC_004113	GCA	2	6	553249	553254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298097
10170	NC_004113	GGTG	2	8	553339	553346	0 %	25 %	75 %	0 %	22298097
10171	NC_004113	TTG	2	6	553361	553366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298097
10172	NC_004113	AGT	2	6	553390	553395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298097
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10174	NC_004113	GTG	2	6	553459	553464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298097
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10176	NC_004113	GGTTG	2	10	553569	553578	0 %	40 %	60 %	0 %	22298097
10177	NC_004113	CCA	2	6	553579	553584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298097
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10181	NC_004113	G	8	8	553677	553684	0 %	0 %	100 %	0 %	22298097
10182	NC_004113	G	7	7	553693	553699	0 %	0 %	100 %	0 %	22298097
10183	NC_004113	CCG	2	6	553732	553737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298097
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10185	NC_004113	GGA	2	6	553791	553796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298097
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10190	NC_004113	CAT	2	6	554113	554118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298098
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10192	NC_004113	GCA	2	6	554154	554159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298098
10193	NC_004113	CAAAGG	2	12	554217	554228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22298098
10194	NC_004113	ATCT	2	8	554245	554252	25 %	50 %	0 %	25 %	22298098
10195	NC_004113	CA	3	6	554253	554258	50 %	0 %	0 %	50 %	22298098
10196	NC_004113	TCG	2	6	554268	554273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298098
10197	NC_004113	CCA	2	6	554356	554361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298098
10198	NC_004113	GTA	2	6	554383	554388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298098
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10200	NC_004113	CGT	2	6	554467	554472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298098
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10203	NC_004113	CCAA	2	8	554703	554710	50 %	0 %	0 %	50 %	22298098
10204	NC_004113	CAAC	2	8	554812	554819	50 %	0 %	0 %	50 %	22298098
10205	NC_004113	TCA	2	6	554910	554915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10206	NC_004113	GTC	2	6	554992	554997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298099
10207	NC_004113	TG	3	6	555002	555007	0 %	50 %	50 %	0 %	22298099
10208	NC_004113	CGA	2	6	555018	555023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298099
10209	NC_004113	GGCT	2	8	555093	555100	0 %	25 %	50 %	25 %	22298099
10210	NC_004113	GCGA	2	8	555145	555152	25 %	0 %	50 %	25 %	22298099
10211	NC_004113	TGA	2	6	555248	555253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298099
10212	NC_004113	C	7	7	555284	555290	0 %	0 %	0 %	100 %	22298099
10213	NC_004113	GCC	2	6	555339	555344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10214	NC_004113	GTT	2	6	555371	555376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10215	NC_004113	GTT	2	6	555385	555390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10216	NC_004113	TGG	2	6	555401	555406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298100
10217	NC_004113	TTGG	2	8	555473	555480	0 %	50 %	50 %	0 %	22298100
10218	NC_004113	GAC	2	6	555560	555565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298100
10219	NC_004113	TGGG	2	8	555605	555612	0 %	25 %	75 %	0 %	22298100
10220	NC_004113	CAG	2	6	555649	555654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10221	NC_004113	GCT	2	6	555684	555689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10222	NC_004113	GGC	2	6	555720	555725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10223	NC_004113	CAT	2	6	555773	555778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298101
10224	NC_004113	GTG	2	6	555795	555800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298101
10225	NC_004113	TGG	2	6	555856	555861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298101
10226	NC_004113	GCGA	2	8	555886	555893	25 %	0 %	50 %	25 %	22298101
10227	NC_004113	TCG	2	6	555894	555899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298101
10228	NC_004113	C	6	6	555910	555915	0 %	0 %	0 %	100 %	22298101
10229	NC_004113	TGG	2	6	556028	556033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298101
10230	NC_004113	CGG	2	6	556034	556039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298101
10231	NC_004113	TGC	2	6	556040	556045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298101
10232	NC_004113	CCA	2	6	556192	556197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298102
10233	NC_004113	AAT	2	6	556259	556264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298102
10234	NC_004113	CCT	2	6	556300	556305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298102
10235	NC_004113	TCA	2	6	556347	556352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298102
10236	NC_004113	CCG	2	6	556414	556419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298102
10237	NC_004113	AGAGA	2	10	556568	556577	60 %	0 %	40 %	0 %	22298102
10238	NC_004113	TGC	2	6	556605	556610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298102
10239	NC_004113	ACC	2	6	556646	556651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298102
10240	NC_004113	CG	3	6	556666	556671	0 %	0 %	50 %	50 %	22298102
10241	NC_004113	GAC	2	6	556684	556689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298102
10242	NC_004113	AAT	2	6	556700	556705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298102
10243	NC_004113	CAA	2	6	556732	556737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298102
10244	NC_004113	GAAAG	2	10	556765	556774	60 %	0 %	40 %	0 %	22298102
10245	NC_004113	GCCA	2	8	556806	556813	25 %	0 %	25 %	50 %	22298102
10246	NC_004113	GCT	2	6	557044	557049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298102
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10270	NC_004113	AGCTA	2	10	558006	558015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10273	NC_004113	GT	3	6	558198	558203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10349	NC_004113	AGG	2	6	562385	562390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10350	NC_004113	CT	3	6	562477	562482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10351	NC_004113	CGA	2	6	562490	562495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10354	NC_004113	C	7	7	562608	562614	0 %	0 %	0 %	100 %	22298108
10355	NC_004113	ACCA	2	8	562620	562627	50 %	0 %	0 %	50 %	22298108
10356	NC_004113	CTG	2	6	562653	562658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298108
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10359	NC_004113	CAT	2	6	562721	562726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298108
10360	NC_004113	TGA	2	6	562736	562741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298108
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10362	NC_004113	GTG	2	6	562965	562970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298108
10363	NC_004113	TGG	2	6	563086	563091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298108
10364	NC_004113	G	6	6	563094	563099	0 %	0 %	100 %	0 %	22298108
10365	NC_004113	TTGC	2	8	563117	563124	0 %	50 %	25 %	25 %	22298108
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10367	NC_004113	AGCC	2	8	563221	563228	25 %	0 %	25 %	50 %	22298108
10368	NC_004113	GCC	3	9	563226	563234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298108
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10489	NC_004113	C	6	6	570325	570330	0 %	0 %	0 %	100 %	22298112
10490	NC_004113	GGT	2	6	570553	570558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298112
10491	NC_004113	GCC	2	6	570571	570576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298112
10492	NC_004113	CTG	2	6	570802	570807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298112
10493	NC_004113	TTG	2	6	570821	570826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298112
10494	NC_004113	CAT	2	6	570873	570878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298112
10495	NC_004113	ATG	2	6	570884	570889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298112
10496	NC_004113	CGC	2	6	570959	570964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298112
10497	NC_004113	TGCT	2	8	571066	571073	0 %	50 %	25 %	25 %	22298112
10498	NC_004113	CTA	2	6	571128	571133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298112
10499	NC_004113	GCG	2	6	571210	571215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298112
10500	NC_004113	GGC	2	6	571226	571231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298112

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