MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004113	TGG	2	6	489695	489700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298036
9002	NC_004113	GAA	2	6	489703	489708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298036
9003	NC_004113	CGC	2	6	489834	489839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298036
9004	NC_004113	AG	3	6	490012	490017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_004113	A	7	7	490045	490051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_004113	GGT	2	6	490067	490072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_004113	ACCC	2	8	490078	490085	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9008	NC_004113	CCGATT	2	12	490097	490108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_004113	TAG	2	6	490350	490355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298037
9010	NC_004113	TTAA	2	8	490394	490401	50 %	50 %	0 %	0 %	22298037
9011	NC_004113	TGC	2	6	490447	490452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298037
9012	NC_004113	TCA	2	6	490492	490497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298037
9013	NC_004113	CAT	2	6	490514	490519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298037
9014	NC_004113	ATT	2	6	490602	490607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298037
9015	NC_004113	GCG	2	6	490649	490654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298038
9016	NC_004113	GCCA	2	8	490669	490676	25 %	0 %	25 %	50 %	22298038
9017	NC_004113	GAC	2	6	490719	490724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298038
9018	NC_004113	CCA	2	6	490796	490801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298038
9019	NC_004113	CCA	2	6	490877	490882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298038
9020	NC_004113	CTG	2	6	490899	490904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298038
9021	NC_004113	GCG	2	6	490920	490925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298038
9022	NC_004113	TG	3	6	490994	490999	0 %	50 %	50 %	0 %	22298038
9023	NC_004113	AGC	2	6	491026	491031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298038
9024	NC_004113	ATC	2	6	491034	491039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298038
9025	NC_004113	TGG	2	6	491102	491107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298038
9026	NC_004113	GCA	2	6	491129	491134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298038
9027	NC_004113	TGC	2	6	491136	491141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298038
9028	NC_004113	TCT	2	6	491234	491239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_004113	CAA	2	6	491252	491257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_004113	GA	3	6	491278	491283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_004113	CG	3	6	491288	491293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_004113	CCT	2	6	491328	491333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298039
9033	NC_004113	ACA	2	6	491427	491432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298039
9034	NC_004113	CGT	2	6	491470	491475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298039
9035	NC_004113	CCG	2	6	491503	491508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298039
9036	NC_004113	TCC	2	6	491514	491519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298039
9037	NC_004113	TGA	2	6	491560	491565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298039
9038	NC_004113	AAG	2	6	491676	491681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298039
9039	NC_004113	CGT	2	6	491708	491713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298039
9040	NC_004113	TAG	2	6	491719	491724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298039
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9042	NC_004113	AAACTC	2	12	491964	491975	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_004113	AAG	2	6	492045	492050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298040
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9047	NC_004113	TGC	2	6	492366	492371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298040
9048	NC_004113	TGA	2	6	492565	492570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298040
9049	NC_004113	CTG	2	6	492581	492586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298040
9050	NC_004113	TGG	2	6	492594	492599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298040
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9052	NC_004113	GCA	2	6	492676	492681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298040
9053	NC_004113	TGT	2	6	492700	492705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_004113	AC	3	6	492789	492794	50 %	0 %	0 %	50 %	22298041
9055	NC_004113	GCG	2	6	492876	492881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298041
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9058	NC_004113	ACT	2	6	493044	493049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298041
9059	NC_004113	CTG	2	6	493087	493092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298041
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9069	NC_004113	TGG	2	6	493461	493466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298042
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9082	NC_004113	TTGA	2	8	494291	494298	25 %	50 %	25 %	0 %	22298042
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9105	NC_004113	T	6	6	495714	495719	0 %	100 %	0 %	0 %	22298044
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9122	NC_004113	CAG	2	6	496578	496583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298045
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9240	NC_004113	CATC	2	8	502947	502954	25 %	25 %	0 %	50 %	22298050
9241	NC_004113	CAGC	2	8	503041	503048	25 %	0 %	25 %	50 %	22298050
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9495	NC_004113	CTG	2	6	515874	515879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298062
9496	NC_004113	CA	3	6	515906	515911	50 %	0 %	0 %	50 %	22298062
9497	NC_004113	CAGTTG	2	12	515922	515933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22298062
9498	NC_004113	CGC	2	6	516016	516021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298062
9499	NC_004113	CCA	2	6	516036	516041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298062
9500	NC_004113	TCA	2	6	516076	516081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298062

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