MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004113	CAT	2	6	351160	351165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297900
6502	NC_004113	G	6	6	351216	351221	0 %	0 %	100 %	0 %	22297900
6503	NC_004113	GCTG	2	8	351223	351230	0 %	25 %	50 %	25 %	22297900
6504	NC_004113	CCCA	2	8	351276	351283	25 %	0 %	0 %	75 %	22297900
6505	NC_004113	CAATC	2	10	351289	351298	40 %	20 %	0 %	40 %	22297900
6506	NC_004113	CTG	2	6	351335	351340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297900
6507	NC_004113	CCA	3	9	351367	351375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297900
6508	NC_004113	ATC	2	6	351544	351549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297901
6509	NC_004113	GCC	2	6	351565	351570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297901
6510	NC_004113	GCA	2	6	351659	351664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6511	NC_004113	GCC	2	6	351757	351762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297901
6512	NC_004113	GAG	2	6	351819	351824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297901
6513	NC_004113	TTGGG	2	10	351832	351841	0 %	40 %	60 %	0 %	22297901
6514	NC_004113	CACC	2	8	351842	351849	25 %	0 %	0 %	75 %	22297901
6515	NC_004113	GCA	2	6	351893	351898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6516	NC_004113	ATG	2	6	351952	351957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297901
6517	NC_004113	TGC	2	6	351969	351974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6518	NC_004113	TGC	2	6	351978	351983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6519	NC_004113	CCG	2	6	352054	352059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297901
6520	NC_004113	GCT	2	6	352078	352083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6521	NC_004113	CCA	4	12	352142	352153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297901
6522	NC_004113	CAT	2	6	352154	352159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297901
6523	NC_004113	CAC	3	9	352197	352205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297901
6524	NC_004113	GC	3	6	352240	352245	0 %	0 %	50 %	50 %	22297901
6525	NC_004113	GCT	2	6	352253	352258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6526	NC_004113	CTG	2	6	352319	352324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6527	NC_004113	CAA	2	6	352331	352336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297901
6528	NC_004113	T	6	6	352367	352372	0 %	100 %	0 %	0 %	22297901
6529	NC_004113	CTG	2	6	352402	352407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297901
6530	NC_004113	TTC	2	6	352419	352424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297901
6531	NC_004113	CTT	2	6	352438	352443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297901
6532	NC_004113	ATC	2	6	352453	352458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297901
6533	NC_004113	ATTGT	2	10	352494	352503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_004113	TTGG	2	8	352510	352517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_004113	TGA	2	6	352667	352672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297902
6536	NC_004113	GCT	2	6	352727	352732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297902
6537	NC_004113	GCC	2	6	352755	352760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297902
6538	NC_004113	TCA	2	6	352793	352798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297902
6539	NC_004113	ACT	2	6	352809	352814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297902
6540	NC_004113	CCA	2	6	352843	352848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297902
6541	NC_004113	TACCG	2	10	352863	352872	20 %	20 %	20 %	40 %	22297902
6542	NC_004113	CTG	2	6	352887	352892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297902
6543	NC_004113	CGC	2	6	352963	352968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297902
6544	NC_004113	GAA	2	6	352980	352985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297902
6545	NC_004113	GCT	2	6	353024	353029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297902
6546	NC_004113	GC	3	6	353051	353056	0 %	0 %	50 %	50 %	22297902
6547	NC_004113	GCG	2	6	353091	353096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297902
6548	NC_004113	CAAA	2	8	353097	353104	75 %	0 %	0 %	25 %	22297902
6549	NC_004113	AAT	2	6	353127	353132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297902
6550	NC_004113	C	7	7	353160	353166	0 %	0 %	0 %	100 %	22297902
6551	NC_004113	ACC	2	6	353268	353273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297902
6552	NC_004113	ATCGCG	2	12	353356	353367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22297902
6553	NC_004113	TTCCC	2	10	353378	353387	0 %	40 %	0 %	60 %	22297902
6554	NC_004113	GCTG	2	8	353676	353683	0 %	25 %	50 %	25 %	22297903
6555	NC_004113	TCG	2	6	353721	353726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297903
6556	NC_004113	TGC	2	6	353748	353753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297903
6557	NC_004113	CTG	2	6	353783	353788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297903
6558	NC_004113	CTG	2	6	353859	353864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297903
6559	NC_004113	CTG	2	6	353909	353914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297903
6560	NC_004113	ACTG	2	8	354037	354044	25 %	25 %	25 %	25 %	22297903
6561	NC_004113	GCA	2	6	354050	354055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297903
6562	NC_004113	GCC	2	6	354081	354086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297903
6563	NC_004113	C	6	6	354130	354135	0 %	0 %	0 %	100 %	22297903
6564	NC_004113	GCG	2	6	354206	354211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297903
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6567	NC_004113	TTGG	2	8	354347	354354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_004113	CTTG	2	8	354606	354613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6569	NC_004113	ACA	2	6	354732	354737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_004113	GGAA	2	8	354783	354790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_004113	GA	3	6	354917	354922	50 %	0 %	50 %	0 %	22297904
6572	NC_004113	GCA	2	6	354950	354955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297904
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6574	NC_004113	GCA	2	6	355047	355052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297904
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6588	NC_004113	AGG	2	6	355699	355704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297904
6589	NC_004113	AGC	2	6	355726	355731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297904
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6593	NC_004113	GAA	2	6	355878	355883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297904
6594	NC_004113	GCGG	2	8	355901	355908	0 %	0 %	75 %	25 %	22297904
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6597	NC_004113	TGG	2	6	356101	356106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297904
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6603	NC_004113	GAG	2	6	356280	356285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297904
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6605	NC_004113	TTA	2	6	356337	356342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297904
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6607	NC_004113	TGA	2	6	356402	356407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297904
6608	NC_004113	ATG	4	12	356410	356421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297904
6609	NC_004113	TGA	3	9	356480	356488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297904
6610	NC_004113	ATAAA	2	10	356497	356506	80 %	20 %	0 %	0 %	22297904
6611	NC_004113	GAT	2	6	356511	356516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297904
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6613	NC_004113	AG	3	6	356694	356699	50 %	0 %	50 %	0 %	22297904
6614	NC_004113	TCA	2	6	356710	356715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297904
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6620	NC_004113	GGA	2	6	357233	357238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297904
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6999	NC_004113	TGC	2	6	377840	377845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297921
7000	NC_004113	CTG	2	6	377924	377929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297921

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