MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 31685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_002689	AGC	2	6	1396737	1396742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13542159
28003	NC_002689	TC	3	6	1396770	1396775	0 %	50 %	0 %	50 %	13542159
28004	NC_002689	TGC	2	6	1396790	1396795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13542159
28005	NC_002689	CTG	2	6	1396990	1396995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13542159
28006	NC_002689	TCTGCC	2	12	1397112	1397123	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13542159
28007	NC_002689	CTTC	2	8	1397211	1397218	0 %	50 %	0 %	50 %	13542159
28008	NC_002689	AAT	2	6	1397231	1397236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542159
28009	NC_002689	TAT	2	6	1397251	1397256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542159
28010	NC_002689	CCT	2	6	1397320	1397325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13542159
28011	NC_002689	TTC	2	6	1397369	1397374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542159
28012	NC_002689	TCT	3	9	1397420	1397428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542159
28013	NC_002689	AAT	2	6	1397454	1397459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542159
28014	NC_002689	CTT	2	6	1397463	1397468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542159
28015	NC_002689	TTAG	2	8	1397534	1397541	25 %	50 %	25 %	0 %	13542159
28016	NC_002689	CTT	2	6	1397611	1397616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542159
28017	NC_002689	CAT	2	6	1397631	1397636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542159
28018	NC_002689	TTC	2	6	1397661	1397666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542159
28019	NC_002689	CTT	2	6	1397692	1397697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542159
28020	NC_002689	CCT	2	6	1397741	1397746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13542160
28021	NC_002689	AT	3	6	1397834	1397839	50 %	50 %	0 %	0 %	13542160
28022	NC_002689	CGG	2	6	1397880	1397885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13542160
28023	NC_002689	TAA	2	6	1397888	1397893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542160
28024	NC_002689	CTT	2	6	1398026	1398031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542160
28025	NC_002689	GTT	2	6	1398169	1398174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542160
28026	NC_002689	TGA	2	6	1398222	1398227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542160
28027	NC_002689	TAT	2	6	1398399	1398404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542160
28028	NC_002689	T	6	6	1398590	1398595	0 %	100 %	0 %	0 %	13542160
28029	NC_002689	TC	3	6	1398642	1398647	0 %	50 %	0 %	50 %	13542160
28030	NC_002689	TCT	2	6	1398714	1398719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542160
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28032	NC_002689	TTA	2	6	1398797	1398802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542160
28033	NC_002689	ATC	2	6	1398904	1398909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542160
28034	NC_002689	TAT	2	6	1399005	1399010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542160
28035	NC_002689	CCTG	2	8	1399077	1399084	0 %	25 %	25 %	50 %	13542160
28036	NC_002689	TGTA	2	8	1399217	1399224	25 %	50 %	25 %	0 %	13542160
28037	NC_002689	ATT	2	6	1399242	1399247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542160
28038	NC_002689	TCT	3	9	1399270	1399278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542160
28039	NC_002689	TTC	2	6	1399290	1399295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542160
28040	NC_002689	ATC	2	6	1399297	1399302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542160
28041	NC_002689	GAG	2	6	1399349	1399354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13542161
28042	NC_002689	ACTG	2	8	1399355	1399362	25 %	25 %	25 %	25 %	13542161
28043	NC_002689	ATC	2	6	1399374	1399379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542161
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28045	NC_002689	CAT	2	6	1399445	1399450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542161
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28053	NC_002689	AT	3	6	1399792	1399797	50 %	50 %	0 %	0 %	13542161
28054	NC_002689	TCA	2	6	1399807	1399812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542161
28055	NC_002689	TCA	2	6	1399818	1399823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542161
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28057	NC_002689	GTA	2	6	1399939	1399944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542161
28058	NC_002689	CCAT	2	8	1399982	1399989	25 %	25 %	0 %	50 %	13542161
28059	NC_002689	GGAG	2	8	1400001	1400008	25 %	0 %	75 %	0 %	13542161
28060	NC_002689	ATA	2	6	1400027	1400032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542161
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28064	NC_002689	TCT	2	6	1400231	1400236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542161
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28068	NC_002689	AT	3	6	1400375	1400380	50 %	50 %	0 %	0 %	13542162
28069	NC_002689	ACC	2	6	1400456	1400461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13542162
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28073	NC_002689	CAT	2	6	1400600	1400605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542162
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28076	NC_002689	GAA	2	6	1401056	1401061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13542162
28077	NC_002689	TTAC	2	8	1401099	1401106	25 %	50 %	0 %	25 %	13542162
28078	NC_002689	CAA	2	6	1401293	1401298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13542162
28079	NC_002689	CAAT	2	8	1401436	1401443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28080	NC_002689	A	6	6	1401450	1401455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28081	NC_002689	ATATA	2	10	1401464	1401473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28082	NC_002689	GTA	2	6	1401506	1401511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542163
28083	NC_002689	TGTTC	2	10	1401556	1401565	0 %	60 %	20 %	20 %	13542163
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28085	NC_002689	GTA	2	6	1401725	1401730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542163
28086	NC_002689	ATC	2	6	1401735	1401740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542163
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28089	NC_002689	GTCAT	2	10	1401810	1401819	20 %	40 %	20 %	20 %	13542163
28090	NC_002689	TGT	2	6	1401833	1401838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542163
28091	NC_002689	AAT	2	6	1401868	1401873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542163
28092	NC_002689	AT	3	6	1401911	1401916	50 %	50 %	0 %	0 %	13542163
28093	NC_002689	GTAAAA	2	12	1401981	1401992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	13542163
28094	NC_002689	AATG	2	8	1401998	1402005	50 %	25 %	25 %	0 %	13542163
28095	NC_002689	CAC	2	6	1402054	1402059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13542163
28096	NC_002689	ATT	3	9	1402065	1402073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542163
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28098	NC_002689	TA	3	6	1402336	1402341	50 %	50 %	0 %	0 %	13542163
28099	NC_002689	GTAGGC	2	12	1402382	1402393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13542163
28100	NC_002689	GTA	2	6	1402470	1402475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542163
28101	NC_002689	TG	3	6	1402540	1402545	0 %	50 %	50 %	0 %	13542163
28102	NC_002689	TCG	2	6	1402579	1402584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13542163
28103	NC_002689	GAC	2	6	1402658	1402663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13542163
28104	NC_002689	AGG	2	6	1402697	1402702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13542163
28105	NC_002689	TTAA	2	8	1402719	1402726	50 %	50 %	0 %	0 %	13542163
28106	NC_002689	TAC	2	6	1402727	1402732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542163
28107	NC_002689	GAT	2	6	1402737	1402742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542163
28108	NC_002689	GTT	2	6	1402784	1402789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542163
28109	NC_002689	GCTG	2	8	1402899	1402906	0 %	25 %	50 %	25 %	13542163
28110	NC_002689	CTA	2	6	1402924	1402929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542163
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28113	NC_002689	GTT	2	6	1403334	1403339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542163
28114	NC_002689	AGA	3	9	1403378	1403386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13542163
28115	NC_002689	CGTAT	2	10	1403441	1403450	20 %	40 %	20 %	20 %	13542163
28116	NC_002689	TCCA	2	8	1403459	1403466	25 %	25 %	0 %	50 %	13542163
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28118	NC_002689	CAA	3	9	1403551	1403559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13542163
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