MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 31685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_002689	GAC	2	6	1268347	1268352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13542040
25503	NC_002689	TGCC	2	8	1268357	1268364	0 %	25 %	25 %	50 %	13542040
25504	NC_002689	TTA	2	6	1268399	1268404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542040
25505	NC_002689	ATA	2	6	1268425	1268430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542040
25506	NC_002689	ATT	2	6	1268550	1268555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542040
25507	NC_002689	TGA	2	6	1268559	1268564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542040
25508	NC_002689	T	6	6	1268605	1268610	0 %	100 %	0 %	0 %	13542040
25509	NC_002689	ACC	2	6	1268639	1268644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13542040
25510	NC_002689	GA	3	6	1268688	1268693	50 %	0 %	50 %	0 %	13542040
25511	NC_002689	ACG	2	6	1268702	1268707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13542040
25512	NC_002689	AT	3	6	1268739	1268744	50 %	50 %	0 %	0 %	13542040
25513	NC_002689	CGAA	2	8	1268759	1268766	50 %	0 %	25 %	25 %	13542040
25514	NC_002689	TTC	2	6	1268788	1268793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13542040
25515	NC_002689	ATC	2	6	1268854	1268859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542040
25516	NC_002689	A	6	6	1268881	1268886	100 %	0 %	0 %	0 %	13542040
25517	NC_002689	T	6	6	1268950	1268955	0 %	100 %	0 %	0 %	13542040
25518	NC_002689	AAG	2	6	1269055	1269060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13542040
25519	NC_002689	CT	3	6	1269073	1269078	0 %	50 %	0 %	50 %	13542040
25520	NC_002689	TTA	2	6	1269138	1269143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542040
25521	NC_002689	TCA	2	6	1269178	1269183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542040
25522	NC_002689	GAA	2	6	1269270	1269275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13542040
25523	NC_002689	AGG	2	6	1269458	1269463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13542040
25524	NC_002689	TGG	2	6	1269561	1269566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13542040
25525	NC_002689	TGC	2	6	1269579	1269584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13542040
25526	NC_002689	A	7	7	1269662	1269668	100 %	0 %	0 %	0 %	13542040
25527	NC_002689	TAT	2	6	1269694	1269699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25528	NC_002689	TTCA	2	8	1269701	1269708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25529	NC_002689	TA	4	8	1269711	1269718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25530	NC_002689	ATG	2	6	1269741	1269746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25531	NC_002689	ATG	2	6	1269807	1269812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542041
25532	NC_002689	AGG	2	6	1269827	1269832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13542041
25533	NC_002689	TGT	3	9	1269883	1269891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542041
25534	NC_002689	TAT	2	6	1269892	1269897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542041
25535	NC_002689	A	6	6	1269904	1269909	100 %	0 %	0 %	0 %	13542041
25536	NC_002689	ATA	2	6	1269912	1269917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542041
25537	NC_002689	GCT	2	6	1269982	1269987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13542041
25538	NC_002689	GATA	2	8	1270219	1270226	50 %	25 %	25 %	0 %	13542041
25539	NC_002689	TGAA	2	8	1270242	1270249	50 %	25 %	25 %	0 %	13542041
25540	NC_002689	C	6	6	1270263	1270268	0 %	0 %	0 %	100 %	13542041
25541	NC_002689	TAA	2	6	1270311	1270316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542041
25542	NC_002689	GAAAT	2	10	1270407	1270416	60 %	20 %	20 %	0 %	13542041
25543	NC_002689	GGA	2	6	1270543	1270548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13542042
25544	NC_002689	ATA	2	6	1270554	1270559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542042
25545	NC_002689	ATG	2	6	1270562	1270567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542042
25546	NC_002689	ATCT	2	8	1270590	1270597	25 %	50 %	0 %	25 %	13542042
25547	NC_002689	ATT	2	6	1270696	1270701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542042
25548	NC_002689	TTATA	2	10	1270754	1270763	40 %	60 %	0 %	0 %	13542042
25549	NC_002689	TA	4	8	1270760	1270767	50 %	50 %	0 %	0 %	13542042
25550	NC_002689	AAC	2	6	1270815	1270820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13542042
25551	NC_002689	TACA	2	8	1270881	1270888	50 %	25 %	0 %	25 %	13542042
25552	NC_002689	AAT	2	6	1270952	1270957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542042
25553	NC_002689	AGC	2	6	1271124	1271129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13542042
25554	NC_002689	TTTC	2	8	1271207	1271214	0 %	75 %	0 %	25 %	13542042
25555	NC_002689	ACA	2	6	1271244	1271249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13542043
25556	NC_002689	TATAAG	2	12	1271261	1271272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	13542043
25557	NC_002689	ATA	2	6	1271316	1271321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542043
25558	NC_002689	ATTCA	2	10	1271372	1271381	40 %	40 %	0 %	20 %	13542043
25559	NC_002689	TTG	2	6	1271397	1271402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542043
25560	NC_002689	GTA	2	6	1271442	1271447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
25561	NC_002689	TA	3	6	1271549	1271554	50 %	50 %	0 %	0 %	13542043
25562	NC_002689	TTAT	2	8	1271601	1271608	25 %	75 %	0 %	0 %	13542043
25563	NC_002689	GAAG	2	8	1271646	1271653	50 %	0 %	50 %	0 %	13542043
25564	NC_002689	GAA	2	6	1271655	1271660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13542043
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25568	NC_002689	ATGT	2	8	1272039	1272046	25 %	50 %	25 %	0 %	13542043
25569	NC_002689	ATA	2	6	1272059	1272064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13542043
25570	NC_002689	AT	3	6	1272161	1272166	50 %	50 %	0 %	0 %	13542043
25571	NC_002689	AGT	2	6	1272328	1272333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
25572	NC_002689	GCA	2	6	1272391	1272396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13542043
25573	NC_002689	AGTT	2	8	1272481	1272488	25 %	50 %	25 %	0 %	13542043
25574	NC_002689	TTG	2	6	1272493	1272498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13542043
25575	NC_002689	TTTC	2	8	1272511	1272518	0 %	75 %	0 %	25 %	13542043
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25580	NC_002689	TAT	2	6	1272772	1272777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542043
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25584	NC_002689	GTTATA	2	12	1273067	1273078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	13542043
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25586	NC_002689	GTA	2	6	1273214	1273219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
25587	NC_002689	TAGA	2	8	1273252	1273259	50 %	25 %	25 %	0 %	13542043
25588	NC_002689	TAC	2	6	1273265	1273270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542043
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25591	NC_002689	AT	3	6	1273508	1273513	50 %	50 %	0 %	0 %	13542043
25592	NC_002689	TA	3	6	1273516	1273521	50 %	50 %	0 %	0 %	13542043
25593	NC_002689	GAA	2	6	1273557	1273562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13542043
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25600	NC_002689	CCAC	2	8	1274088	1274095	25 %	0 %	0 %	75 %	13542043
25601	NC_002689	AT	3	6	1274131	1274136	50 %	50 %	0 %	0 %	13542043
25602	NC_002689	GAT	2	6	1274148	1274153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
25603	NC_002689	AGT	2	6	1274159	1274164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
25604	NC_002689	CCA	2	6	1274253	1274258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13542043
25605	NC_002689	TAT	2	6	1274306	1274311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542043
25606	NC_002689	ATT	2	6	1274318	1274323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13542043
25607	NC_002689	TAG	2	6	1274386	1274391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
25608	NC_002689	AGT	2	6	1274419	1274424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13542043
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25612	NC_002689	ACCA	2	8	1274582	1274589	50 %	0 %	0 %	50 %	13542043
25613	NC_002689	AT	3	6	1274648	1274653	50 %	50 %	0 %	0 %	13542043
25614	NC_002689	CAT	2	6	1274683	1274688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13542043
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