MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 31685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_002689	TTCT	2	8	818843	818850	0 %	75 %	0 %	25 %	13541632
16503	NC_002689	CTG	2	6	818900	818905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13541632
16504	NC_002689	T	7	7	819010	819016	0 %	100 %	0 %	0 %	13541632
16505	NC_002689	TTG	2	6	819101	819106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13541632
16506	NC_002689	TTG	2	6	819125	819130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13541632
16507	NC_002689	TAT	2	6	819214	819219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541632
16508	NC_002689	ATTC	2	8	819221	819228	25 %	50 %	0 %	25 %	13541632
16509	NC_002689	CTT	2	6	819290	819295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13541632
16510	NC_002689	TGA	2	6	819296	819301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541632
16511	NC_002689	AGGT	2	8	819309	819316	25 %	25 %	50 %	0 %	13541632
16512	NC_002689	ATA	2	6	819348	819353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_002689	CTT	2	6	819419	819424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_002689	TAA	2	6	819462	819467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_002689	ATA	2	6	819484	819489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_002689	ATC	2	6	819494	819499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_002689	A	7	7	819653	819659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_002689	TTA	2	6	819660	819665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16519	NC_002689	CTA	2	6	819668	819673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_002689	A	6	6	819702	819707	100 %	0 %	0 %	0 %	13541633
16521	NC_002689	AG	3	6	819978	819983	50 %	0 %	50 %	0 %	13541633
16522	NC_002689	CGA	2	6	819986	819991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13541633
16523	NC_002689	GTT	2	6	820086	820091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13541633
16524	NC_002689	GAT	2	6	820134	820139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541633
16525	NC_002689	CAT	2	6	820161	820166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541633
16526	NC_002689	AAAC	2	8	820281	820288	75 %	0 %	0 %	25 %	13541633
16527	NC_002689	ATA	2	6	820390	820395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541633
16528	NC_002689	GTT	2	6	820409	820414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13541633
16529	NC_002689	TCAT	2	8	820520	820527	25 %	50 %	0 %	25 %	13541633
16530	NC_002689	GGATG	2	10	820593	820602	20 %	20 %	60 %	0 %	13541633
16531	NC_002689	GAT	2	6	820635	820640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541633
16532	NC_002689	GGT	2	6	820693	820698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13541633
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16534	NC_002689	GCC	2	6	820795	820800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13541634
16535	NC_002689	ATT	2	6	820808	820813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541634
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16537	NC_002689	AGT	2	6	820857	820862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541634
16538	NC_002689	CTA	2	6	820883	820888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541634
16539	NC_002689	TAA	2	6	820958	820963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541634
16540	NC_002689	G	6	6	820998	821003	0 %	0 %	100 %	0 %	13541634
16541	NC_002689	TTG	2	6	821021	821026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13541634
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16543	NC_002689	CGG	2	6	821259	821264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13541634
16544	NC_002689	GGA	2	6	821304	821309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13541634
16545	NC_002689	ATT	2	6	821310	821315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541634
16546	NC_002689	TA	3	6	821335	821340	50 %	50 %	0 %	0 %	13541634
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16549	NC_002689	GCA	2	6	821527	821532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13541634
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16551	NC_002689	GTA	2	6	821608	821613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541634
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16553	NC_002689	TGC	2	6	821751	821756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13541634
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16555	NC_002689	GAA	2	6	821887	821892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541634
16556	NC_002689	CCTC	2	8	821912	821919	0 %	25 %	0 %	75 %	13541634
16557	NC_002689	GTAC	2	8	821980	821987	25 %	25 %	25 %	25 %	13541634
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16560	NC_002689	TTATT	2	10	822078	822087	20 %	80 %	0 %	0 %	13541634
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16564	NC_002689	GATGAA	2	12	822331	822342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	13541634
16565	NC_002689	AAGA	2	8	822447	822454	75 %	0 %	25 %	0 %	13541634
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16568	NC_002689	T	6	6	822716	822721	0 %	100 %	0 %	0 %	13541634
16569	NC_002689	GGC	2	6	822847	822852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13541634
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16571	NC_002689	AGAT	2	8	822962	822969	50 %	25 %	25 %	0 %	13541634
16572	NC_002689	TTCA	2	8	823040	823047	25 %	50 %	0 %	25 %	13541634
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16595	NC_002689	ATCG	2	8	824531	824538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16606	NC_002689	GA	3	6	825134	825139	50 %	0 %	50 %	0 %	13541636
16607	NC_002689	CTA	2	6	825171	825176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541636
16608	NC_002689	A	6	6	825277	825282	100 %	0 %	0 %	0 %	13541636
16609	NC_002689	ATA	2	6	825436	825441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541636
16610	NC_002689	GCGATA	2	12	825492	825503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13541636
16611	NC_002689	TGCAA	2	10	825539	825548	40 %	20 %	20 %	20 %	13541636
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16613	NC_002689	TGCCT	2	10	825636	825645	0 %	40 %	20 %	40 %	13541636
16614	NC_002689	ACCAC	2	10	825665	825674	40 %	0 %	0 %	60 %	13541636
16615	NC_002689	AGC	2	6	825685	825690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13541636
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16620	NC_002689	AAAAG	2	10	825864	825873	80 %	0 %	20 %	0 %	13541636
16621	NC_002689	GTAA	2	8	825958	825965	50 %	25 %	25 %	0 %	13541636
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16999	NC_002689	ATCTG	2	10	844551	844560	20 %	40 %	20 %	20 %	13541646
17000	NC_002689	TAA	2	6	844574	844579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541646

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