MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 31685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002689	AGA	2	6	215867	215872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541040
4502	NC_002689	T	6	6	215882	215887	0 %	100 %	0 %	0 %	13541040
4503	NC_002689	TAAT	2	8	215911	215918	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
4504	NC_002689	ATA	2	6	216010	216015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4505	NC_002689	ATTAT	2	10	216176	216185	40 %	60 %	0 %	0 %	13541040
4506	NC_002689	A	6	6	216196	216201	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4507	NC_002689	AATAA	2	10	216219	216228	80 %	20 %	0 %	0 %	13541040
4508	NC_002689	ATG	2	6	216241	216246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541040
4509	NC_002689	TTG	2	6	216259	216264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13541040
4510	NC_002689	AAG	2	6	216349	216354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541040
4511	NC_002689	TTGT	2	8	216423	216430	0 %	75 %	25 %	0 %	13541040
4512	NC_002689	ATT	2	6	216534	216539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541040
4513	NC_002689	TTGATT	2	12	216574	216585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	13541040
4514	NC_002689	TAA	2	6	216608	216613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4515	NC_002689	ATGGTG	2	12	216649	216660	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	13541040
4516	NC_002689	ATG	2	6	216681	216686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541040
4517	NC_002689	AT	3	6	216755	216760	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
4518	NC_002689	TAC	2	6	216839	216844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541040
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4520	NC_002689	TA	3	6	216936	216941	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
4521	NC_002689	A	6	6	216951	216956	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4522	NC_002689	TATGG	2	10	216958	216967	20 %	40 %	40 %	0 %	13541040
4523	NC_002689	TTA	2	6	216969	216974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541040
4524	NC_002689	AT	3	6	216991	216996	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
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4527	NC_002689	AGAT	2	8	217063	217070	50 %	25 %	25 %	0 %	13541040
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4529	NC_002689	AAG	2	6	217119	217124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541040
4530	NC_002689	AGT	2	6	217214	217219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541040
4531	NC_002689	AAAT	2	8	217295	217302	75 %	25 %	0 %	0 %	13541040
4532	NC_002689	TA	3	6	217341	217346	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
4533	NC_002689	ATA	2	6	217359	217364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4534	NC_002689	TAA	2	6	217369	217374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4535	NC_002689	TAT	2	6	217388	217393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541040
4536	NC_002689	TAA	3	9	217406	217414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4537	NC_002689	AT	3	6	217418	217423	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
4538	NC_002689	A	6	6	217425	217430	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4539	NC_002689	AT	3	6	217446	217451	50 %	50 %	0 %	0 %	13541040
4540	NC_002689	ATTT	2	8	217510	217517	25 %	75 %	0 %	0 %	13541040
4541	NC_002689	A	6	6	217553	217558	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4542	NC_002689	A	7	7	217581	217587	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4543	NC_002689	TCT	2	6	217602	217607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13541040
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4545	NC_002689	A	6	6	217615	217620	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4546	NC_002689	TAGTA	2	10	217640	217649	40 %	40 %	20 %	0 %	13541040
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4549	NC_002689	AGT	2	6	217697	217702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541040
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4551	NC_002689	A	6	6	217786	217791	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4552	NC_002689	GA	3	6	217862	217867	50 %	0 %	50 %	0 %	13541040
4553	NC_002689	AG	3	6	217962	217967	50 %	0 %	50 %	0 %	13541040
4554	NC_002689	ACA	2	6	217999	218004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13541040
4555	NC_002689	AG	4	8	218076	218083	50 %	0 %	50 %	0 %	13541040
4556	NC_002689	TTTA	2	8	218084	218091	25 %	75 %	0 %	0 %	13541040
4557	NC_002689	ATA	2	6	218109	218114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4558	NC_002689	AGA	2	6	218135	218140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541040
4559	NC_002689	ATA	2	6	218260	218265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541040
4560	NC_002689	ATATT	2	10	218269	218278	40 %	60 %	0 %	0 %	13541040
4561	NC_002689	ATT	2	6	218300	218305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541040
4562	NC_002689	A	7	7	218311	218317	100 %	0 %	0 %	0 %	13541040
4563	NC_002689	TG	3	6	218385	218390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_002689	TAA	2	6	218392	218397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_002689	ATA	2	6	218447	218452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_002689	TATTT	2	10	218489	218498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_002689	ATA	2	6	218506	218511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_002689	AAG	2	6	218521	218526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_002689	AG	3	6	218542	218547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_002689	ATA	2	6	218551	218556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_002689	AAT	2	6	218568	218573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_002689	AT	3	6	218579	218584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_002689	TTTA	2	8	218623	218630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_002689	A	7	7	218671	218677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_002689	GTA	2	6	218710	218715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_002689	TA	4	8	218783	218790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_002689	ATT	2	6	218844	218849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541041
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4579	NC_002689	T	7	7	218974	218980	0 %	100 %	0 %	0 %	13541041
4580	NC_002689	TTGA	2	8	219045	219052	25 %	50 %	25 %	0 %	13541041
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4584	NC_002689	AT	3	6	219206	219211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_002689	AT	4	8	219214	219221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_002689	A	6	6	219253	219258	100 %	0 %	0 %	0 %	13541042
4587	NC_002689	ATG	2	6	219324	219329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541042
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4592	NC_002689	ATAG	2	8	219678	219685	50 %	25 %	25 %	0 %	13541042
4593	NC_002689	TGG	2	6	219775	219780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13541042
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4596	NC_002689	T	7	7	219922	219928	0 %	100 %	0 %	0 %	13541043
4597	NC_002689	CA	3	6	219975	219980	50 %	0 %	0 %	50 %	13541043
4598	NC_002689	ATC	2	6	220052	220057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541043
4599	NC_002689	AT	3	6	220124	220129	50 %	50 %	0 %	0 %	13541043
4600	NC_002689	GAT	2	6	220157	220162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541043
4601	NC_002689	CAAA	2	8	220203	220210	75 %	0 %	0 %	25 %	13541043
4602	NC_002689	GAA	2	6	220241	220246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541043
4603	NC_002689	GAA	2	6	220259	220264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541043
4604	NC_002689	TAT	2	6	220438	220443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541043
4605	NC_002689	GGC	2	6	220454	220459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13541043
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4607	NC_002689	GCAG	2	8	220574	220581	25 %	0 %	50 %	25 %	13541043
4608	NC_002689	TGA	2	6	220620	220625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541043
4609	NC_002689	ATG	2	6	220665	220670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13541043
4610	NC_002689	AAT	2	6	220688	220693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541043
4611	NC_002689	A	7	7	220707	220713	100 %	0 %	0 %	0 %	13541043
4612	NC_002689	AT	3	6	220761	220766	50 %	50 %	0 %	0 %	13541044
4613	NC_002689	CCA	2	6	220814	220819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13541044
4614	NC_002689	GAA	2	6	220849	220854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13541044
4615	NC_002689	TG	3	6	221065	221070	0 %	50 %	50 %	0 %	13541044
4616	NC_002689	TAA	2	6	221078	221083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541044
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4618	NC_002689	CAT	2	6	221166	221171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541044
4619	NC_002689	TTA	2	6	221217	221222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541044
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4621	NC_002689	CTT	2	6	221296	221301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13541044
4622	NC_002689	TAA	2	6	221358	221363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13541044
4623	NC_002689	T	6	6	221397	221402	0 %	100 %	0 %	0 %	13541044
4624	NC_002689	ATT	2	6	221416	221421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13541044
4625	NC_002689	ATC	2	6	221426	221431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13541044
4626	NC_002689	T	8	8	221458	221465	0 %	100 %	0 %	0 %	13541044
4627	NC_002689	TA	3	6	221473	221478	50 %	50 %	0 %	0 %	13541044
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4629	NC_002689	T	6	6	221564	221569	0 %	100 %	0 %	0 %	13541044
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