MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 31685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002689	A	6	6	11	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002689	A	6	6	54	59	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002689	TAAGG	2	10	88	97	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002689	AGA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
5	NC_002689	AGA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
6	NC_002689	AGG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540832
7	NC_002689	TTG	2	6	303	308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13540832
8	NC_002689	CTT	2	6	471	476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540832
9	NC_002689	ATTGTT	2	12	530	541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	13540832
10	NC_002689	TAG	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540832
11	NC_002689	AGA	2	6	611	616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
12	NC_002689	AGA	2	6	636	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
13	NC_002689	A	6	6	673	678	100 %	0 %	0 %	0 %	13540832
14	NC_002689	AT	3	6	697	702	50 %	50 %	0 %	0 %	13540832
15	NC_002689	TAAA	2	8	828	835	75 %	25 %	0 %	0 %	13540832
16	NC_002689	A	6	6	904	909	100 %	0 %	0 %	0 %	13540832
17	NC_002689	GAATAG	2	12	912	923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	13540832
18	NC_002689	AGGG	2	8	932	939	25 %	0 %	75 %	0 %	13540832
19	NC_002689	CT	3	6	949	954	0 %	50 %	0 %	50 %	13540832
20	NC_002689	GTT	2	6	992	997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13540832
21	NC_002689	A	6	6	1105	1110	100 %	0 %	0 %	0 %	13540832
22	NC_002689	TTTAA	2	10	1217	1226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002689	AATT	2	8	1256	1263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002689	TA	3	6	1272	1277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002689	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002689	TTCA	2	8	1292	1299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002689	AT	3	6	1300	1305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002689	AAATAT	2	12	1336	1347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002689	AGA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002689	TTAA	2	8	1362	1369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002689	TGA	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002689	AT	3	6	1403	1408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002689	CATG	2	8	1428	1435	25 %	25 %	25 %	25 %	13540833
34	NC_002689	TG	3	6	1444	1449	0 %	50 %	50 %	0 %	13540833
35	NC_002689	AAAT	2	8	1473	1480	75 %	25 %	0 %	0 %	13540833
36	NC_002689	ACA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13540833
37	NC_002689	TTC	4	12	1579	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
38	NC_002689	A	6	6	1618	1623	100 %	0 %	0 %	0 %	13540833
39	NC_002689	TAA	2	6	1693	1698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540833
40	NC_002689	TCT	2	6	1727	1732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
41	NC_002689	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
42	NC_002689	AAG	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
43	NC_002689	CAG	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540833
44	NC_002689	AGC	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540833
45	NC_002689	ATT	2	6	1949	1954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540833
46	NC_002689	A	7	7	1976	1982	100 %	0 %	0 %	0 %	13540833
47	NC_002689	TAG	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540833
48	NC_002689	AAGA	2	8	2011	2018	75 %	0 %	25 %	0 %	13540833
49	NC_002689	CTT	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
50	NC_002689	TAT	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540833
51	NC_002689	AGA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
52	NC_002689	TGC	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540833
53	NC_002689	AAG	2	6	2236	2241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
54	NC_002689	AGC	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540833
55	NC_002689	TATGG	2	10	2285	2294	20 %	40 %	40 %	0 %	13540833
56	NC_002689	TGA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540833
57	NC_002689	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	13540833
58	NC_002689	AAG	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
59	NC_002689	GCG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13540833
60	NC_002689	ATT	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540833
61	NC_002689	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540833
62	NC_002689	GAG	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540833
63	NC_002689	CCG	2	6	2807	2812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13540833
64	NC_002689	TGG	2	6	2831	2836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13540833
65	NC_002689	AT	3	6	2952	2957	50 %	50 %	0 %	0 %	13540833
66	NC_002689	CA	3	6	3017	3022	50 %	0 %	0 %	50 %	13540833
67	NC_002689	GAA	2	6	3120	3125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
68	NC_002689	ACT	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13540833
69	NC_002689	ATG	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540833
70	NC_002689	AAC	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13540833
71	NC_002689	GGCCA	2	10	3245	3254	20 %	0 %	40 %	40 %	13540833
72	NC_002689	ATA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540833
73	NC_002689	TTCCA	2	10	3333	3342	20 %	40 %	0 %	40 %	13540833
74	NC_002689	AAG	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
75	NC_002689	TCT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
76	NC_002689	TGC	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540833
77	NC_002689	AT	3	6	3442	3447	50 %	50 %	0 %	0 %	13540833
78	NC_002689	GACA	2	8	3453	3460	50 %	0 %	25 %	25 %	13540834
79	NC_002689	TTTG	2	8	3474	3481	0 %	75 %	25 %	0 %	13540834
80	NC_002689	GAA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540834
81	NC_002689	T	6	6	3603	3608	0 %	100 %	0 %	0 %	13540834
82	NC_002689	AT	3	6	3626	3631	50 %	50 %	0 %	0 %	13540834
83	NC_002689	A	6	6	3650	3655	100 %	0 %	0 %	0 %	13540834
84	NC_002689	A	6	6	3782	3787	100 %	0 %	0 %	0 %	13540834
85	NC_002689	G	6	6	3817	3822	0 %	0 %	100 %	0 %	13540834
86	NC_002689	TGA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
87	NC_002689	ATG	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
88	NC_002689	TGA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
89	NC_002689	GAA	2	6	3946	3951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540834
90	NC_002689	AAG	2	6	3955	3960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540834
91	NC_002689	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540834
92	NC_002689	GAC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540834
93	NC_002689	GGAA	2	8	4126	4133	50 %	0 %	50 %	0 %	13540834
94	NC_002689	CAG	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540834
95	NC_002689	GAT	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
96	NC_002689	AGG	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540834
97	NC_002689	A	6	6	4370	4375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002689	GAAG	2	8	4474	4481	50 %	0 %	50 %	0 %	13540835
99	NC_002689	AATG	2	8	4573	4580	50 %	25 %	25 %	0 %	13540835
100	NC_002689	G	6	6	4663	4668	0 %	0 %	100 %	0 %	13540835
101	NC_002689	TTGA	2	8	4694	4701	25 %	50 %	25 %	0 %	13540835
102	NC_002689	AGG	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540835
103	NC_002689	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540835
104	NC_002689	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13540835
105	NC_002689	TGC	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540835
106	NC_002689	ATG	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540835
107	NC_002689	GCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540835
108	NC_002689	AGA	2	6	4981	4986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540835
109	NC_002689	AT	3	6	4989	4994	50 %	50 %	0 %	0 %	13540835
110	NC_002689	GAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540835
111	NC_002689	ATGC	2	8	5064	5071	25 %	25 %	25 %	25 %	13540835
112	NC_002689	AT	3	6	5135	5140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002689	TTA	2	6	5141	5146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002689	T	6	6	5151	5156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002689	AT	3	6	5195	5200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002689	CAT	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002689	TAA	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002689	AT	3	6	5238	5243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002689	TTA	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002689	AT	3	6	5323	5328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002689	A	6	6	5413	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002689	AT	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002689	TA	3	6	5521	5526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002689	AT	3	6	5527	5532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002689	CT	3	6	5548	5553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002689	CAT	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13540836
127	NC_002689	TTC	2	6	5672	5677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540836
128	NC_002689	TGGG	2	8	5734	5741	0 %	25 %	75 %	0 %	13540836
129	NC_002689	TCT	2	6	5785	5790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540836
130	NC_002689	GAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
131	NC_002689	G	7	7	5969	5975	0 %	0 %	100 %	0 %	13540836
132	NC_002689	GAA	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
133	NC_002689	TC	3	6	6053	6058	0 %	50 %	0 %	50 %	13540836
134	NC_002689	TAA	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540836
135	NC_002689	A	6	6	6264	6269	100 %	0 %	0 %	0 %	13540836
136	NC_002689	GAA	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
137	NC_002689	TAA	2	6	6606	6611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540836
138	NC_002689	T	6	6	6703	6708	0 %	100 %	0 %	0 %	13540836
139	NC_002689	AGA	2	6	6947	6952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
140	NC_002689	AT	3	6	6982	6987	50 %	50 %	0 %	0 %	13540836
141	NC_002689	A	6	6	7010	7015	100 %	0 %	0 %	0 %	13540836
142	NC_002689	ATGC	2	8	7172	7179	25 %	25 %	25 %	25 %	13540837
143	NC_002689	CTG	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540837
144	NC_002689	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540837
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147	NC_002689	ATA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002689	CATA	2	8	7580	7587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002689	TAA	2	6	7607	7612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002689	TTA	2	6	7651	7656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002689	TAAA	2	8	7665	7672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002689	GAC	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540838
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172	NC_002689	ATA	2	6	8433	8438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540839
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182	NC_002689	GA	3	6	8854	8859	50 %	0 %	50 %	0 %	13540841
183	NC_002689	ATA	2	6	8888	8893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540841
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257	NC_002689	ATA	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_002689	AG	3	6	12222	12227	50 %	0 %	50 %	0 %	13540845
259	NC_002689	TAT	2	6	12285	12290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540845
260	NC_002689	TGT	2	6	12362	12367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13540845
261	NC_002689	TAG	2	6	12376	12381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540845
262	NC_002689	GATG	2	8	12467	12474	25 %	25 %	50 %	0 %	13540845
263	NC_002689	AG	3	6	12492	12497	50 %	0 %	50 %	0 %	13540845
264	NC_002689	GACA	2	8	12530	12537	50 %	0 %	25 %	25 %	13540845
265	NC_002689	A	6	6	12561	12566	100 %	0 %	0 %	0 %	13540845
266	NC_002689	TGCTA	2	10	12584	12593	20 %	40 %	20 %	20 %	13540845
267	NC_002689	TAT	2	6	12600	12605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540845
268	NC_002689	A	6	6	12646	12651	100 %	0 %	0 %	0 %	13540845
269	NC_002689	TAAAA	2	10	12652	12661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_002689	AT	3	6	12785	12790	50 %	50 %	0 %	0 %	13540846
271	NC_002689	TTTG	2	8	12905	12912	0 %	75 %	25 %	0 %	13540846
272	NC_002689	CGTG	2	8	12937	12944	0 %	25 %	50 %	25 %	13540846
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275	NC_002689	TTC	2	6	13142	13147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540846
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410	NC_002689	A	6	6	19947	19952	100 %	0 %	0 %	0 %	13540852
411	NC_002689	GAT	2	6	19967	19972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540852
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413	NC_002689	A	7	7	20030	20036	100 %	0 %	0 %	0 %	13540852
414	NC_002689	TAA	2	6	20179	20184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540852
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443	NC_002689	CT	3	6	21380	21385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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452	NC_002689	ATT	2	6	22261	22266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_002689	ATTA	2	8	22275	22282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_002689	AT	3	6	22361	22366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_002689	T	6	6	22531	22536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_002689	CTTGAT	2	12	22538	22549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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461	NC_002689	AAATA	2	10	22632	22641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_002689	CAA	2	6	22649	22654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_002689	CAA	2	6	23872	23877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_002689	AT	4	8	23879	23886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_002689	ATG	2	6	23909	23914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540855
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498	NC_002689	AG	4	8	24335	24342	50 %	0 %	50 %	0 %	13540855
499	NC_002689	TTC	2	6	24428	24433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540855
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