MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002578	TTA	2	6	159852	159857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081317
3002	NC_002578	TCT	2	6	159952	159957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
3003	NC_002578	TCT	2	6	159967	159972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
3004	NC_002578	TAT	2	6	159973	159978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081317
3005	NC_002578	CCTT	2	8	160032	160039	0 %	50 %	0 %	50 %	16081317
3006	NC_002578	TCT	2	6	160053	160058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
3007	NC_002578	CTA	2	6	160131	160136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
3008	NC_002578	GAA	2	6	160156	160161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081317
3009	NC_002578	TAT	2	6	160210	160215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081317
3010	NC_002578	ATG	2	6	160242	160247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081318
3011	NC_002578	TCA	2	6	160308	160313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081318
3012	NC_002578	CCG	2	6	160345	160350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081318
3013	NC_002578	GTAT	2	8	160356	160363	25 %	50 %	25 %	0 %	16081318
3014	NC_002578	AT	3	6	160426	160431	50 %	50 %	0 %	0 %	16081318
3015	NC_002578	AT	3	6	160453	160458	50 %	50 %	0 %	0 %	16081318
3016	NC_002578	TCC	2	6	160729	160734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081318
3017	NC_002578	TA	3	6	160766	160771	50 %	50 %	0 %	0 %	16081318
3018	NC_002578	GAA	2	6	160823	160828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081318
3019	NC_002578	TCC	2	6	161059	161064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081318
3020	NC_002578	GTAT	2	8	161190	161197	25 %	50 %	25 %	0 %	16081318
3021	NC_002578	CAG	2	6	161344	161349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081319
3022	NC_002578	CTT	2	6	161397	161402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3023	NC_002578	CTT	2	6	161410	161415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3024	NC_002578	CAG	2	6	161416	161421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081319
3025	NC_002578	TCAACG	2	12	161432	161443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081319
3026	NC_002578	ATT	3	9	161507	161515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081319
3027	NC_002578	TCC	2	6	161543	161548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081319
3028	NC_002578	GCT	2	6	161572	161577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081319
3029	NC_002578	TAT	2	6	161620	161625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081319
3030	NC_002578	GATC	2	8	161655	161662	25 %	25 %	25 %	25 %	16081319
3031	NC_002578	TTA	2	6	161679	161684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081319
3032	NC_002578	CTG	2	6	161715	161720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081319
3033	NC_002578	TCT	2	6	161724	161729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3034	NC_002578	CAC	2	6	161757	161762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081319
3035	NC_002578	CAG	2	6	161838	161843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081319
3036	NC_002578	CAT	2	6	161850	161855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081319
3037	NC_002578	AAT	2	6	161883	161888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081319
3038	NC_002578	CGCTCT	2	12	162039	162050	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16081319
3039	NC_002578	TCA	2	6	162062	162067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081319
3040	NC_002578	TTC	2	6	162075	162080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3041	NC_002578	CTC	2	6	162088	162093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081319
3042	NC_002578	CTT	2	6	162159	162164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3043	NC_002578	TTC	2	6	162290	162295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3044	NC_002578	ATG	2	6	162329	162334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081319
3045	NC_002578	CTT	2	6	162343	162348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3046	NC_002578	AGT	2	6	162350	162355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081319
3047	NC_002578	TCC	2	6	162356	162361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081319
3048	NC_002578	TAT	2	6	162406	162411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081319
3049	NC_002578	CCT	2	6	162421	162426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081319
3050	NC_002578	TCA	3	9	162497	162505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081319
3051	NC_002578	TGT	2	6	162675	162680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081319
3052	NC_002578	GAG	2	6	162697	162702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081319
3053	NC_002578	TCC	2	6	162722	162727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081319
3054	NC_002578	CTT	2	6	162778	162783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081319
3055	NC_002578	CAA	2	6	162804	162809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081319
3056	NC_002578	TGT	2	6	162970	162975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081320
3057	NC_002578	CAT	2	6	163025	163030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081320
3058	NC_002578	TCC	2	6	163092	163097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081320
3059	NC_002578	GCA	2	6	163105	163110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081320
3060	NC_002578	ATG	2	6	163203	163208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081320
3061	NC_002578	TTTC	2	8	163230	163237	0 %	75 %	0 %	25 %	16081320
3062	NC_002578	CAG	2	6	163271	163276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081320
3063	NC_002578	TCT	2	6	163330	163335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081320
3064	NC_002578	TCCTA	2	10	163418	163427	20 %	40 %	0 %	40 %	16081320
3065	NC_002578	TCA	2	6	163483	163488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081320
3066	NC_002578	GGA	2	6	163502	163507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081320
3067	NC_002578	CAT	2	6	163511	163516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081320
3068	NC_002578	GAA	2	6	163622	163627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081320
3069	NC_002578	GCT	2	6	163658	163663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081320
3070	NC_002578	TA	3	6	163746	163751	50 %	50 %	0 %	0 %	16081320
3071	NC_002578	GAC	2	6	163950	163955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_002578	AC	3	6	164024	164029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_002578	TGAT	2	8	164060	164067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_002578	AGC	2	6	164079	164084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_002578	AATA	2	8	164085	164092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_002578	A	6	6	164112	164117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_002578	CCG	2	6	164156	164161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_002578	CAT	2	6	164171	164176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_002578	GAA	2	6	164207	164212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_002578	GAG	2	6	164229	164234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_002578	ATGG	2	8	164287	164294	25 %	25 %	50 %	0 %	16081321
3082	NC_002578	A	6	6	164308	164313	100 %	0 %	0 %	0 %	16081321
3083	NC_002578	TTC	2	6	164315	164320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081321
3084	NC_002578	TGGT	2	8	164321	164328	0 %	50 %	50 %	0 %	16081321
3085	NC_002578	GAC	2	6	164506	164511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081321
3086	NC_002578	ATG	2	6	164645	164650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081321
3087	NC_002578	GAA	2	6	164682	164687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081321
3088	NC_002578	TAG	2	6	164693	164698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081321
3089	NC_002578	TTG	2	6	164702	164707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081321
3090	NC_002578	GATCT	2	10	164740	164749	20 %	40 %	20 %	20 %	16081321
3091	NC_002578	GAA	2	6	164870	164875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081321
3092	NC_002578	GAT	2	6	164964	164969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081321
3093	NC_002578	TCAA	2	8	164995	165002	50 %	25 %	0 %	25 %	16081321
3094	NC_002578	GGA	2	6	165295	165300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082491
3095	NC_002578	ATA	2	6	165326	165331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082491
3096	NC_002578	ATG	2	6	165393	165398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082491
3097	NC_002578	GATG	2	8	165559	165566	25 %	25 %	50 %	0 %	16082491
3098	NC_002578	GGC	2	6	165604	165609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082491
3099	NC_002578	TC	3	6	165682	165687	0 %	50 %	0 %	50 %	16082491
3100	NC_002578	TGG	2	6	165692	165697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082491
3101	NC_002578	GGA	2	6	165719	165724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082491
3102	NC_002578	GAG	2	6	165824	165829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082491
3103	NC_002578	CGC	2	6	165945	165950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082491
3104	NC_002578	AT	3	6	165957	165962	50 %	50 %	0 %	0 %	16082491
3105	NC_002578	ATTG	2	8	165994	166001	25 %	50 %	25 %	0 %	16082491
3106	NC_002578	GGA	2	6	166024	166029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082491
3107	NC_002578	ATC	2	6	166109	166114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082491
3108	NC_002578	GGTGC	2	10	166183	166192	0 %	20 %	60 %	20 %	16082491
3109	NC_002578	GTT	2	6	166211	166216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082491
3110	NC_002578	ATT	2	6	166407	166412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082491
3111	NC_002578	A	7	7	166426	166432	100 %	0 %	0 %	0 %	16082491
3112	NC_002578	AT	3	6	166478	166483	50 %	50 %	0 %	0 %	16082491
3113	NC_002578	TGCC	2	8	166484	166491	0 %	25 %	25 %	50 %	16082491
3114	NC_002578	CGC	2	6	166579	166584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082491
3115	NC_002578	GAAG	2	8	166638	166645	50 %	0 %	50 %	0 %	16082491
3116	NC_002578	ATG	2	6	166704	166709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082491
3117	NC_002578	AT	3	6	166959	166964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_002578	A	6	6	166981	166986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_002578	A	6	6	167070	167075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_002578	TAT	3	9	167133	167141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082637
3121	NC_002578	CAC	2	6	167241	167246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082637
3122	NC_002578	ATCC	2	8	167287	167294	25 %	25 %	0 %	50 %	16082637
3123	NC_002578	AG	3	6	167321	167326	50 %	0 %	50 %	0 %	16082637
3124	NC_002578	A	6	6	167372	167377	100 %	0 %	0 %	0 %	16082637
3125	NC_002578	AGA	2	6	167381	167386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082637
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