MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_002578	CTC	2	6	1502438	1502443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082422
28003	NC_002578	TGAC	2	8	1502530	1502537	25 %	25 %	25 %	25 %	16082422
28004	NC_002578	GAG	2	6	1502544	1502549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082422
28005	NC_002578	AGA	2	6	1502578	1502583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082422
28006	NC_002578	AAG	3	9	1502631	1502639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082422
28007	NC_002578	ATA	2	6	1502640	1502645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082422
28008	NC_002578	CAT	2	6	1502673	1502678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082423
28009	NC_002578	GAGCA	2	10	1502833	1502842	40 %	0 %	40 %	20 %	16082423
28010	NC_002578	GCG	2	6	1502857	1502862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082423
28011	NC_002578	GCG	2	6	1502932	1502937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082423
28012	NC_002578	ACG	2	6	1502975	1502980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082423
28013	NC_002578	ATA	2	6	1503031	1503036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082423
28014	NC_002578	TCC	2	6	1503046	1503051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082423
28015	NC_002578	GGA	2	6	1503150	1503155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082423
28016	NC_002578	GAT	2	6	1503162	1503167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082423
28017	NC_002578	TGA	2	6	1503330	1503335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082423
28018	NC_002578	AGAA	2	8	1503340	1503347	75 %	0 %	25 %	0 %	16082423
28019	NC_002578	GGA	2	6	1503390	1503395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082423
28020	NC_002578	TGCAC	2	10	1503402	1503411	20 %	20 %	20 %	40 %	16082423
28021	NC_002578	AAG	2	6	1503484	1503489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082423
28022	NC_002578	TCCT	2	8	1503499	1503506	0 %	50 %	0 %	50 %	16082423
28023	NC_002578	AAGGGC	2	12	1503571	1503582	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082423
28024	NC_002578	GCCT	2	8	1503617	1503624	0 %	25 %	25 %	50 %	16082423
28025	NC_002578	CGTC	2	8	1503788	1503795	0 %	25 %	25 %	50 %	16082423
28026	NC_002578	GTGA	2	8	1503809	1503816	25 %	25 %	50 %	0 %	16082423
28027	NC_002578	CT	3	6	1503972	1503977	0 %	50 %	0 %	50 %	16082424
28028	NC_002578	AG	3	6	1503992	1503997	50 %	0 %	50 %	0 %	16082424
28029	NC_002578	CCG	2	6	1504020	1504025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082424
28030	NC_002578	GAG	2	6	1504071	1504076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082424
28031	NC_002578	GAT	2	6	1504082	1504087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082424
28032	NC_002578	T	6	6	1504226	1504231	0 %	100 %	0 %	0 %	16082425
28033	NC_002578	T	7	7	1504236	1504242	0 %	100 %	0 %	0 %	16082425
28034	NC_002578	GCA	2	6	1504249	1504254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082425
28035	NC_002578	GGAT	2	8	1504292	1504299	25 %	25 %	50 %	0 %	16082425
28036	NC_002578	T	6	6	1504319	1504324	0 %	100 %	0 %	0 %	16082425
28037	NC_002578	CCTG	3	12	1504483	1504494	0 %	25 %	25 %	50 %	16082425
28038	NC_002578	ATT	2	6	1504506	1504511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082425
28039	NC_002578	CTC	2	6	1504523	1504528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082425
28040	NC_002578	CGT	2	6	1504534	1504539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082425
28041	NC_002578	TCC	2	6	1504593	1504598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082425
28042	NC_002578	CAT	2	6	1504625	1504630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082425
28043	NC_002578	TGGA	2	8	1504646	1504653	25 %	25 %	50 %	0 %	16082425
28044	NC_002578	TCT	2	6	1504706	1504711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082425
28045	NC_002578	AC	3	6	1504772	1504777	50 %	0 %	0 %	50 %	16082425
28046	NC_002578	TTG	2	6	1504888	1504893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28047	NC_002578	AGG	2	6	1504949	1504954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28048	NC_002578	GATA	2	8	1505010	1505017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28049	NC_002578	AT	3	6	1505053	1505058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28050	NC_002578	TAA	2	6	1505059	1505064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28051	NC_002578	ATA	2	6	1505278	1505283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28052	NC_002578	TAA	2	6	1505300	1505305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28053	NC_002578	TCA	2	6	1505373	1505378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28054	NC_002578	TTA	2	6	1505472	1505477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28055	NC_002578	TGGG	2	8	1505601	1505608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28056	NC_002578	A	6	6	1505631	1505636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28057	NC_002578	AAT	2	6	1505643	1505648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28058	NC_002578	GGT	2	6	1505904	1505909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082426
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28061	NC_002578	AG	3	6	1506073	1506078	50 %	0 %	50 %	0 %	16082426
28062	NC_002578	TCG	2	6	1506086	1506091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082426
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28065	NC_002578	GAC	2	6	1506364	1506369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082426
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28069	NC_002578	AT	4	8	1506561	1506568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28070	NC_002578	AAG	2	6	1506645	1506650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28072	NC_002578	AAT	2	6	1506704	1506709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28073	NC_002578	CAC	2	6	1506722	1506727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28074	NC_002578	TCA	2	6	1506752	1506757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28075	NC_002578	A	8	8	1506774	1506781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28078	NC_002578	GGCC	2	8	1506881	1506888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28079	NC_002578	AGG	2	6	1506919	1506924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28080	NC_002578	GAG	2	6	1506949	1506954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28081	NC_002578	CAA	2	6	1506961	1506966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28083	NC_002578	GGCC	2	8	1507027	1507034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28084	NC_002578	GAT	2	6	1507049	1507054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28086	NC_002578	ATT	2	6	1507116	1507121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28087	NC_002578	GGC	2	6	1507142	1507147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28088	NC_002578	CAT	2	6	1507148	1507153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082427
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28091	NC_002578	TAT	2	6	1507248	1507253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082427
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28103	NC_002578	GTCCA	2	10	1508357	1508366	20 %	20 %	20 %	40 %	16082427
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28108	NC_002578	TAT	2	6	1508608	1508613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082427
28109	NC_002578	CCAT	2	8	1508676	1508683	25 %	25 %	0 %	50 %	16082427
28110	NC_002578	CAG	2	6	1509015	1509020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082427
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28118	NC_002578	TGTC	2	8	1509342	1509349	0 %	50 %	25 %	25 %	16082427
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28241	NC_002578	AAT	2	6	1515658	1515663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082432
28242	NC_002578	CCG	2	6	1515707	1515712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082432
28243	NC_002578	GCC	2	6	1515718	1515723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082432
28244	NC_002578	TCA	2	6	1515729	1515734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082432
28245	NC_002578	ATG	2	6	1515741	1515746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082432
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28248	NC_002578	CAT	2	6	1515964	1515969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082432
28249	NC_002578	CT	3	6	1516112	1516117	0 %	50 %	0 %	50 %	16082432
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28252	NC_002578	CTG	2	6	1516213	1516218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082433
28253	NC_002578	ACTAC	2	10	1516289	1516298	40 %	20 %	0 %	40 %	16082433
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28256	NC_002578	GAT	2	6	1516701	1516706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28263	NC_002578	CTG	2	6	1517212	1517217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082434
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28273	NC_002578	AGCC	2	8	1517896	1517903	25 %	0 %	25 %	50 %	16082434
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28279	NC_002578	AT	4	8	1518121	1518128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28280	NC_002578	ATG	2	6	1518240	1518245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082435
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28289	NC_002578	T	7	7	1519070	1519076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28339	NC_002578	ATCT	2	8	1521483	1521490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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28344	NC_002578	ACCG	2	8	1521959	1521966	25 %	0 %	25 %	50 %	16082439
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28351	NC_002578	T	6	6	1522384	1522389	0 %	100 %	0 %	0 %	16082440
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28357	NC_002578	TCT	2	6	1522736	1522741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082440
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28360	NC_002578	CG	3	6	1522826	1522831	0 %	0 %	50 %	50 %	16082440
28361	NC_002578	AAG	2	6	1522860	1522865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082440
28362	NC_002578	AGC	2	6	1522928	1522933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082440
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28365	NC_002578	CCT	2	6	1523000	1523005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082440
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28371	NC_002578	TCT	2	6	1523312	1523317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082440
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28393	NC_002578	TCC	2	6	1524118	1524123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082440
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28400	NC_002578	GTAT	2	8	1524434	1524441	25 %	50 %	25 %	0 %	16082440
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28407	NC_002578	GTTTT	2	10	1524709	1524718	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28408	NC_002578	TG	3	6	1524725	1524730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28409	NC_002578	TTACGT	2	12	1524747	1524758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28410	NC_002578	ATG	2	6	1524775	1524780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28425	NC_002578	AGA	2	6	1525944	1525949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082442
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28465	NC_002578	GAT	2	6	1527966	1527971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082443
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28467	NC_002578	GA	3	6	1528132	1528137	50 %	0 %	50 %	0 %	16082443
28468	NC_002578	AT	3	6	1528156	1528161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28469	NC_002578	T	6	6	1528164	1528169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28470	NC_002578	CGG	2	6	1528209	1528214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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