MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27504	NC_002578	ATCC	2	8	1474375	1474382	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27505	NC_002578	GGAC	2	8	1474386	1474393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27506	NC_002578	GT	3	6	1474430	1474435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27507	NC_002578	TAC	2	6	1474480	1474485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27508	NC_002578	GC	3	6	1474594	1474599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27509	NC_002578	TCCT	2	8	1474645	1474652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27510	NC_002578	GAC	2	6	1474769	1474774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27511	NC_002578	CAC	2	6	1474782	1474787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27512	NC_002578	CTC	2	6	1474881	1474886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27513	NC_002578	C	7	7	1474979	1474985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27514	NC_002578	GTC	2	6	1475114	1475119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27515	NC_002578	TTC	2	6	1475203	1475208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27517	NC_002578	CAC	2	6	1475280	1475285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27518	NC_002578	CGG	2	6	1475306	1475311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27519	NC_002578	CTG	2	6	1475435	1475440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27520	NC_002578	TGT	2	6	1475460	1475465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27521	NC_002578	GGT	2	6	1475520	1475525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27522	NC_002578	ACC	2	6	1475533	1475538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27523	NC_002578	TAC	2	6	1475539	1475544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27552	NC_002578	A	6	6	1477226	1477231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27553	NC_002578	G	7	7	1477257	1477263	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27554	NC_002578	GGCTA	2	10	1477319	1477328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27555	NC_002578	AAGG	2	8	1477340	1477347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27557	NC_002578	GATA	2	8	1477377	1477384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27558	NC_002578	ATGC	2	8	1477411	1477418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27559	NC_002578	AAT	2	6	1477450	1477455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27594	NC_002578	TA	4	8	1479336	1479343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27595	NC_002578	AT	3	6	1479352	1479357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27605	NC_002578	T	6	6	1479629	1479634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27606	NC_002578	TAA	2	6	1479679	1479684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27624	NC_002578	TTC	2	6	1480732	1480737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082399
27625	NC_002578	ATA	2	6	1480753	1480758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082399
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27677	NC_002578	A	7	7	1483365	1483371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27678	NC_002578	AAT	2	6	1483489	1483494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27727	NC_002578	TCTCT	2	10	1486115	1486124	0 %	60 %	0 %	40 %	16082405
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27732	NC_002578	CCCT	2	8	1486477	1486484	0 %	25 %	0 %	75 %	16082405
27733	NC_002578	CAA	2	6	1486556	1486561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082405
27734	NC_002578	CCA	2	6	1486577	1486582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082405
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27739	NC_002578	TCT	2	6	1486887	1486892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082406
27740	NC_002578	GAG	2	6	1487164	1487169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082406
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27984	NC_002578	CATA	2	8	1501636	1501643	50 %	25 %	0 %	25 %	16082422
27985	NC_002578	GA	3	6	1501687	1501692	50 %	0 %	50 %	0 %	16082422
27986	NC_002578	ATAC	2	8	1501718	1501725	50 %	25 %	0 %	25 %	16082422
27987	NC_002578	GCT	2	6	1501779	1501784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082422
27988	NC_002578	AGAA	2	8	1501800	1501807	75 %	0 %	25 %	0 %	16082422
27989	NC_002578	TTG	2	6	1501885	1501890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082422
27990	NC_002578	AGGC	2	8	1501948	1501955	25 %	0 %	50 %	25 %	16082422
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27992	NC_002578	GAT	2	6	1502106	1502111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082422
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27996	NC_002578	TCA	2	6	1502239	1502244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082422
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