MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_002578	TTC	2	6	1449265	1449270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27003	NC_002578	ACCCTC	2	12	1449295	1449306	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27004	NC_002578	TAT	2	6	1449377	1449382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27005	NC_002578	TTC	2	6	1449403	1449408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27006	NC_002578	T	6	6	1449438	1449443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27007	NC_002578	TTA	2	6	1449461	1449466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27008	NC_002578	ATTTTT	2	12	1449505	1449516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27009	NC_002578	T	7	7	1449512	1449518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27010	NC_002578	T	6	6	1449567	1449572	0 %	100 %	0 %	0 %	16082377
27011	NC_002578	A	6	6	1449579	1449584	100 %	0 %	0 %	0 %	16082377
27012	NC_002578	A	6	6	1449601	1449606	100 %	0 %	0 %	0 %	16082377
27013	NC_002578	GTA	2	6	1449710	1449715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082377
27014	NC_002578	GTGAT	2	10	1449793	1449802	20 %	40 %	40 %	0 %	16082377
27015	NC_002578	TA	3	6	1449830	1449835	50 %	50 %	0 %	0 %	16082377
27016	NC_002578	AGC	2	6	1449860	1449865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082377
27017	NC_002578	TCCT	2	8	1449969	1449976	0 %	50 %	0 %	50 %	16082378
27018	NC_002578	CAT	3	9	1450029	1450037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082378
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27022	NC_002578	ATC	2	6	1450194	1450199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082378
27023	NC_002578	ATG	2	6	1450201	1450206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082378
27024	NC_002578	TTCT	2	8	1450238	1450245	0 %	75 %	0 %	25 %	16082378
27025	NC_002578	TCT	2	6	1450274	1450279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082378
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27033	NC_002578	ATTG	2	8	1450655	1450662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27034	NC_002578	TAAT	2	8	1450684	1450691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27035	NC_002578	ATA	2	6	1450692	1450697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27036	NC_002578	CGAA	2	8	1450783	1450790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27037	NC_002578	AAGG	2	8	1450856	1450863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27038	NC_002578	A	7	7	1450888	1450894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27039	NC_002578	GAG	2	6	1450930	1450935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27040	NC_002578	GGA	3	9	1450947	1450955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27041	NC_002578	TGA	2	6	1451017	1451022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27042	NC_002578	AAT	2	6	1451043	1451048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27043	NC_002578	GCA	2	6	1451052	1451057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27044	NC_002578	CGAT	2	8	1451135	1451142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27045	NC_002578	AAGAT	2	10	1451249	1451258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27046	NC_002578	TAAA	2	8	1451430	1451437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27047	NC_002578	ATCA	2	8	1451526	1451533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27048	NC_002578	CAT	2	6	1451559	1451564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082379
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27054	NC_002578	CA	3	6	1451801	1451806	50 %	0 %	0 %	50 %	16082379
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27057	NC_002578	ATC	2	6	1452004	1452009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082379
27058	NC_002578	AGC	2	6	1452027	1452032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082379
27059	NC_002578	ACC	2	6	1452103	1452108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082379
27060	NC_002578	TGA	2	6	1452109	1452114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082379
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27063	NC_002578	GGTAC	2	10	1452159	1452168	20 %	20 %	40 %	20 %	16082379
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27069	NC_002578	AT	4	8	1452504	1452511	50 %	50 %	0 %	0 %	16082379
27070	NC_002578	ATA	2	6	1452580	1452585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27071	NC_002578	T	6	6	1452606	1452611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27094	NC_002578	AT	3	6	1453788	1453793	50 %	50 %	0 %	0 %	16082380
27095	NC_002578	GAAG	2	8	1453794	1453801	50 %	0 %	50 %	0 %	16082380
27096	NC_002578	GTA	2	6	1453821	1453826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082380
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27104	NC_002578	CTGG	2	8	1454075	1454082	0 %	25 %	50 %	25 %	16082380
27105	NC_002578	G	6	6	1454081	1454086	0 %	0 %	100 %	0 %	16082380
27106	NC_002578	CTG	2	6	1454183	1454188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082380
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27108	NC_002578	GAATA	2	10	1454389	1454398	60 %	20 %	20 %	0 %	16082380
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27111	NC_002578	TGTC	2	8	1454574	1454581	0 %	50 %	25 %	25 %	16082380
27112	NC_002578	CG	3	6	1454720	1454725	0 %	0 %	50 %	50 %	16082380
27113	NC_002578	TGC	2	6	1454764	1454769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082380
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27120	NC_002578	TCA	2	6	1454900	1454905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082380
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27478	NC_002578	TTCAT	2	10	1473114	1473123	20 %	60 %	0 %	20 %	16082396
27479	NC_002578	TCC	2	6	1473199	1473204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082397
27480	NC_002578	CCA	2	6	1473266	1473271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082397
27481	NC_002578	GGCT	2	8	1473297	1473304	0 %	25 %	50 %	25 %	16082397
27482	NC_002578	TCC	2	6	1473328	1473333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082397
27483	NC_002578	ATCT	2	8	1473336	1473343	25 %	50 %	0 %	25 %	16082397
27484	NC_002578	CTT	2	6	1473477	1473482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082397
27485	NC_002578	GATC	2	8	1473493	1473500	25 %	25 %	25 %	25 %	16082397
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27490	NC_002578	TAT	2	6	1474033	1474038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082624
27491	NC_002578	ATG	2	6	1474056	1474061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082624
27492	NC_002578	AGA	2	6	1474062	1474067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082624
27493	NC_002578	TTA	2	6	1474078	1474083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082624
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