MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_002578	AGA	2	6	1367100	1367105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082307
25503	NC_002578	GAA	2	6	1367191	1367196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082307
25504	NC_002578	A	7	7	1367195	1367201	100 %	0 %	0 %	0 %	16082307
25505	NC_002578	GGC	2	6	1367247	1367252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082307
25506	NC_002578	CAT	2	6	1367347	1367352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082307
25507	NC_002578	ATG	2	6	1367363	1367368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082307
25508	NC_002578	CAG	2	6	1367415	1367420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082307
25509	NC_002578	CTT	2	6	1367434	1367439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082307
25510	NC_002578	GAT	2	6	1367440	1367445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082307
25511	NC_002578	CTC	2	6	1367472	1367477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082307
25512	NC_002578	GAT	2	6	1367500	1367505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082307
25513	NC_002578	AG	3	6	1367507	1367512	50 %	0 %	50 %	0 %	16082307
25514	NC_002578	AATTTG	2	12	1367513	1367524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082307
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25516	NC_002578	AGA	2	6	1367585	1367590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082307
25517	NC_002578	CCAT	2	8	1367635	1367642	25 %	25 %	0 %	50 %	16082307
25518	NC_002578	AAG	2	6	1367653	1367658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082307
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25523	NC_002578	TGG	2	6	1368120	1368125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082308
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25529	NC_002578	TGATCT	2	12	1368667	1368678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082309
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25531	NC_002578	TCCT	2	8	1368750	1368757	0 %	50 %	0 %	50 %	16082309
25532	NC_002578	T	6	6	1368834	1368839	0 %	100 %	0 %	0 %	16082310
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25537	NC_002578	CAT	2	6	1369103	1369108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082310
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25545	NC_002578	TCG	2	6	1369825	1369830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082310
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25551	NC_002578	AT	3	6	1370253	1370258	50 %	50 %	0 %	0 %	16082310
25552	NC_002578	TCA	2	6	1370380	1370385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082310
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25554	NC_002578	TGTA	2	8	1370573	1370580	25 %	50 %	25 %	0 %	16082310
25555	NC_002578	GTT	2	6	1370742	1370747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082310
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25559	NC_002578	TGTC	2	8	1371054	1371061	0 %	50 %	25 %	25 %	16082311
25560	NC_002578	TTC	2	6	1371119	1371124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082311
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25564	NC_002578	AAC	2	6	1371361	1371366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082311
25565	NC_002578	CTG	2	6	1371371	1371376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082311
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25579	NC_002578	CATT	2	8	1372122	1372129	25 %	50 %	0 %	25 %	16082311
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25602	NC_002578	GA	4	8	1373064	1373071	50 %	0 %	50 %	0 %	16082312
25603	NC_002578	CTT	2	6	1373158	1373163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082312
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25609	NC_002578	TAG	2	6	1373404	1373409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25980	NC_002578	GCG	2	6	1393688	1393693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082612
25981	NC_002578	ATG	2	6	1393807	1393812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082612
25982	NC_002578	AGC	2	6	1393862	1393867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082612
25983	NC_002578	GAA	2	6	1393876	1393881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082612
25984	NC_002578	GTA	2	6	1393912	1393917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082612
25985	NC_002578	TGG	2	6	1393977	1393982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082612
25986	NC_002578	CGA	2	6	1393983	1393988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082612
25987	NC_002578	GCT	2	6	1394022	1394027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082612
25988	NC_002578	TAT	2	6	1394047	1394052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082612
25989	NC_002578	CGT	2	6	1394124	1394129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082612
25990	NC_002578	AAG	2	6	1394153	1394158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082612
25991	NC_002578	TA	3	6	1394290	1394295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25992	NC_002578	GGCAA	2	10	1394421	1394430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25993	NC_002578	CGT	3	9	1394443	1394451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25994	NC_002578	GAT	2	6	1394476	1394481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25995	NC_002578	AGAT	2	8	1394682	1394689	50 %	25 %	25 %	0 %	16082331
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25999	NC_002578	ATCC	2	8	1395213	1395220	25 %	25 %	0 %	50 %	16082331
26000	NC_002578	GTG	2	6	1395237	1395242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082331

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